MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017656	TTAAT	2	10	24762	24771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017656	ATTTA	2	10	33586	33595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017656	GATGC	2	10	39086	39095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017656	TGTTA	2	10	46533	46542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017656	TAGTG	2	10	80389	80398	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017656	GTAAC	2	10	80530	80539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017656	ATTTT	2	10	83114	83123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017656	GGGAG	2	10	83278	83287	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017656	CGCCA	2	10	83342	83351	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017656	AATGC	2	10	121417	121426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017656	GGCAT	2	10	146324	146333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017656	GTAAG	2	10	147088	147097	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017656	TCCTC	2	10	148808	148817	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017656	TAAGA	2	10	161494	161503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017656	AAATA	2	10	161504	161513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017656	TTATC	2	10	171688	171697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017656	TACGT	2	10	186564	186573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017656	TGGCC	2	10	188289	188298	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017656	GTCTG	2	10	196125	196134	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017656	CGGTT	2	10	226814	226823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017656	AAAAT	2	10	263449	263458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017656	CTAAT	2	10	263664	263673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017656	TTTGT	2	10	263691	263700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017656	ACTGT	2	10	264719	264728	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017656	CCTCA	2	10	274949	274958	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017656	GGGCA	2	10	278528	278537	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017656	ATGGT	2	10	283862	283871	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017656	CCTTT	2	10	288013	288022	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017656	TCAAC	2	10	288783	288792	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017656	AAAAC	2	10	303112	303121	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017656	CAGTG	2	10	307709	307718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017656	TTCGT	2	10	309144	309153	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017656	ACAAA	2	10	309312	309321	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017656	GTTCT	2	10	321669	321678	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017656	TGTAT	2	10	321718	321727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017656	ATCCC	2	10	350369	350378	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017656	TTTCG	2	10	353405	353414	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017656	CGCTT	2	10	353566	353575	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017656	TGGCA	2	10	355566	355575	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017656	TGCAA	2	10	355947	355956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017656	ATCAA	2	10	361189	361198	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017656	TGTGT	2	10	382163	382172	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017656	TGTTA	2	10	383272	383281	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017656	TTGAT	2	10	384161	384170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017656	CAAAA	2	10	398472	398481	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017656	ATTAG	2	10	398505	398514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017656	GACAA	2	10	403079	403088	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017656	AAAAT	2	10	403717	403726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017656	GGTTT	2	10	407990	407999	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017656	ATTGA	2	10	408184	408193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017656	AGCGA	2	10	409474	409483	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017656	TGTCA	2	10	415915	415924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017656	ATTTT	2	10	415979	415988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017656	GGCTG	2	10	450923	450932	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017656	AAGCG	2	10	454482	454491	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017656	TTGCG	2	10	459680	459689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017656	TAGCG	2	10	462591	462600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017656	CGGCG	2	10	482763	482772	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017656	ATGGA	2	10	482796	482805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017656	CTTCT	2	10	495925	495934	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017656	GTTTA	2	10	505577	505586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017656	AATAA	2	10	505948	505957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017656	GTTTC	2	10	533170	533179	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017656	CTTTT	2	10	536646	536655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017656	GGAGT	2	10	541141	541150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017656	GAAGA	2	10	564282	564291	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017656	TCAGG	2	10	571704	571713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017656	TGAGT	2	10	578053	578062	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017656	CAGGT	2	10	579342	579351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017656	TTTTC	2	10	599714	599723	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017656	TCAGG	2	10	607476	607485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017656	ATTTT	2	10	654098	654107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017656	TGGCG	2	10	654252	654261	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017656	GCCCG	2	10	654354	654363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017656	GCAGC	2	10	654595	654604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017656	GCGGG	2	10	655268	655277	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017656	TGACC	2	10	656215	656224	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017656	TAAAT	2	10	658078	658087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017656	TATTT	2	10	667261	667270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017656	AAGCG	2	10	672775	672784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017656	GTTTC	2	10	687370	687379	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017656	GTTGA	2	10	699557	699566	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017656	GTTGA	2	10	708514	708523	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017656	GTTCT	2	10	711768	711777	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017656	AAATT	2	10	740590	740599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017656	GTTTT	2	10	751851	751860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017656	TTGCT	2	10	752204	752213	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017656	CTCCC	2	10	752308	752317	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
90	NC_017656	AGCCC	2	10	753108	753117	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_017656	GGTGT	2	10	754189	754198	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017656	ACCGG	2	10	755951	755960	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017656	GTCAG	2	10	774189	774198	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017656	GTCAG	2	10	774692	774701	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017656	GCAGT	2	10	777917	777926	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017656	GTTAA	2	10	794909	794918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017656	AAACG	2	10	808449	808458	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017656	TGCTA	2	10	821530	821539	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017656	ATTTG	2	10	822971	822980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017656	TCAAT	2	10	825276	825285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017656	GGAAC	2	10	826466	826475	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017656	CGTAA	2	10	827674	827683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017656	GCATA	2	10	839870	839879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017656	AGCAA	2	10	839977	839986	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017656	CGTTG	2	10	845759	845768	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017656	CAGGG	2	10	866515	866524	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017656	TCGCG	2	10	871931	871940	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017656	GCCGC	2	10	892630	892639	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017656	TGACC	2	10	893508	893517	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017656	CGCAC	2	10	893825	893834	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_017656	AATGT	2	10	896596	896605	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017656	GAAAA	2	10	896704	896713	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017656	TTAAT	2	10	897573	897582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017656	ACGCT	2	10	938100	938109	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017656	ATAAC	2	10	938983	938992	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017656	GTCGT	2	10	948537	948546	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017656	AAGCG	2	10	949203	949212	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017656	GATGC	2	10	973478	973487	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017656	AAAAT	2	10	974981	974990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017656	TCCAT	2	10	976434	976443	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017656	AAAAC	2	10	976480	976489	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017656	GTTGG	2	10	976593	976602	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017656	CAGTG	2	10	980768	980777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017656	TTCGT	2	10	982203	982212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017656	ACAAA	2	10	982371	982380	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017656	AATTC	2	10	988457	988466	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017656	TGATT	2	10	992008	992017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017656	TAACT	2	10	993825	993834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017656	GGGAT	2	10	999617	999626	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017656	ACATA	2	10	1051346	1051355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017656	GATGC	2	10	1056612	1056621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017656	CAAAA	2	10	1063210	1063219	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017656	TATAT	2	10	1067943	1067952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017656	TGATG	2	10	1073951	1073960	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017656	CAGGG	2	10	1093924	1093933	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017656	AGTAA	2	10	1105784	1105793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017656	CAAAT	2	10	1115609	1115618	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017656	TGATA	2	10	1125593	1125602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017656	GCTGT	2	10	1170442	1170451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017656	GCAAC	2	10	1177830	1177839	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017656	TTCAC	2	10	1191799	1191808	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017656	TTGTT	2	10	1217565	1217574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017656	AATCG	2	10	1221464	1221473	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017656	AACGT	2	10	1221495	1221504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017656	AGCGA	2	10	1225920	1225929	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017656	TAGGG	2	10	1225956	1225965	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017656	ATGAC	2	10	1227660	1227669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017656	TATTT	2	10	1227723	1227732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017656	TTTTC	2	10	1235698	1235707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017656	TTATT	2	10	1236508	1236517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017656	TTCTT	2	10	1238441	1238450	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017656	GTACA	2	10	1240977	1240986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017656	TTATG	2	10	1241134	1241143	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017656	CTTAT	2	10	1251637	1251646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_017656	AATGT	2	10	1265856	1265865	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017656	TAAAA	2	10	1270515	1270524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017656	ACAGC	2	10	1287494	1287503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017656	TGGAG	2	10	1320070	1320079	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017656	GATCG	2	10	1360422	1360431	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017656	TAAAA	2	10	1372346	1372355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017656	TGCAG	2	10	1380543	1380552	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017656	TCTGC	2	10	1385807	1385816	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017656	GGGGA	2	10	1451588	1451597	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017656	CATGA	2	10	1458196	1458205	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_017656	ATTAA	2	10	1460044	1460053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017656	AAGGA	2	10	1465123	1465132	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017656	GTTTA	2	10	1465479	1465488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017656	AAGCA	2	10	1465728	1465737	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_017656	CAACT	2	10	1467426	1467435	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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171	NC_017656	CTGGT	2	10	1469356	1469365	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_017656	TCACT	2	10	1470201	1470210	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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174	NC_017656	CGATG	2	10	1471599	1471608	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_017656	GGGGA	2	10	1471625	1471634	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_017656	TTCTA	2	10	1479377	1479386	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_017656	CTTAC	2	10	1483541	1483550	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_017656	ATAAA	3	15	1502347	1502361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017656	TGAAA	2	10	1513517	1513526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017656	CTTCA	2	10	1526371	1526380	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_017656	CTTCA	2	10	1526906	1526915	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
187	NC_017656	TTATC	2	10	1534228	1534237	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_017656	TCGCT	2	10	1543264	1543273	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_017656	TGATT	2	10	1584752	1584761	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_017656	ATCGA	2	10	1907861	1907870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_017656	AGCGC	2	10	2195248	2195257	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_017656	TGTTT	2	10	2212794	2212803	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017656	GCCAG	2	10	2220712	2220721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_017656	TCCCC	2	10	2223381	2223390	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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266	NC_017656	GTTTT	2	10	2229027	2229036	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017656	CATAC	2	10	2242977	2242986	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
268	NC_017656	TCGAT	2	10	2253645	2253654	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
269	NC_017656	AATAA	2	10	2257076	2257085	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017656	GCTGT	2	10	2280666	2280675	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
271	NC_017656	TGCTC	2	10	2322620	2322629	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
272	NC_017656	TTTTG	2	10	2330288	2330297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017656	CGCTA	2	10	2330327	2330336	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_017656	TAGCG	2	10	2340510	2340519	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
275	NC_017656	AGCGC	2	10	2353046	2353055	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
276	NC_017656	TTTAC	2	10	2377016	2377025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_017656	TAAAA	2	10	2387165	2387174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017656	CTATG	2	10	2396741	2396750	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
279	NC_017656	AATAC	2	10	2397195	2397204	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
280	NC_017656	TATAA	2	10	2399240	2399249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017656	CTGAC	2	10	2399265	2399274	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_017656	CTCAC	2	10	2421460	2421469	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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284	NC_017656	ATTCT	2	10	2433513	2433522	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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420	NC_017656	AATTG	2	10	3715432	3715441	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
421	NC_017656	CGCCC	2	10	3729029	3729038	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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465	NC_017656	CGGGA	2	10	4161157	4161166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
466	NC_017656	TATGC	2	10	4166389	4166398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
467	NC_017656	TAAGG	2	10	4171455	4171464	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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