MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 2845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	387504935
2	NC_017656	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	387504936
3	NC_017656	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	387504941
4	NC_017656	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	387504942
5	NC_017656	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	387504944
6	NC_017656	CCGAT	2	10	16491	16500	20 %	20 %	20 %	40 %	387504949
7	NC_017656	AGCGA	2	10	16879	16888	40 %	0 %	40 %	20 %	387504949
8	NC_017656	GTTTT	2	10	19296	19305	0 %	80 %	20 %	0 %	387504952
9	NC_017656	TTTAT	2	10	20352	20361	20 %	80 %	0 %	0 %	387504952
10	NC_017656	AATGT	2	10	21828	21837	40 %	40 %	20 %	0 %	387504953
11	NC_017656	TGCAA	2	10	22041	22050	40 %	20 %	20 %	20 %	387504953
12	NC_017656	ATAAA	2	10	22112	22121	80 %	20 %	0 %	0 %	387504953
13	NC_017656	TAAAA	2	10	22385	22394	80 %	20 %	0 %	0 %	387504953
14	NC_017656	ATTGC	2	10	24127	24136	20 %	40 %	20 %	20 %	387504955
15	NC_017656	GCGAA	2	10	36824	36833	40 %	0 %	40 %	20 %	387504966
16	NC_017656	CCGTT	2	10	37718	37727	0 %	40 %	20 %	40 %	387504966
17	NC_017656	CACGG	2	10	38095	38104	20 %	0 %	40 %	40 %	387504966
18	NC_017656	CGAAT	2	10	40837	40846	40 %	20 %	20 %	20 %	387504970
19	NC_017656	CCATG	2	10	42375	42384	20 %	20 %	20 %	40 %	387504971
20	NC_017656	CCGTA	2	10	44021	44030	20 %	20 %	20 %	40 %	387504972
21	NC_017656	GTACA	2	10	44511	44520	40 %	20 %	20 %	20 %	387504972
22	NC_017656	TTAAA	2	10	44759	44768	60 %	40 %	0 %	0 %	387504972
23	NC_017656	ACCCA	2	10	45502	45511	40 %	0 %	0 %	60 %	387504973
24	NC_017656	TTTGA	2	10	47129	47138	20 %	60 %	20 %	0 %	387504974
25	NC_017656	CGGCG	2	10	47380	47389	0 %	0 %	60 %	40 %	387504974
26	NC_017656	AATCA	2	10	47662	47671	60 %	20 %	0 %	20 %	387504975
27	NC_017656	CGGTT	2	10	48617	48626	0 %	40 %	40 %	20 %	387504976
28	NC_017656	TGGCG	2	10	50308	50317	0 %	20 %	60 %	20 %	387504978
29	NC_017656	TGCAC	2	10	52070	52079	20 %	20 %	20 %	40 %	387504979
30	NC_017656	AGGGC	2	10	53155	53164	20 %	0 %	60 %	20 %	387504980
31	NC_017656	GGCGC	2	10	53189	53198	0 %	0 %	60 %	40 %	387504980
32	NC_017656	GAAAC	2	10	54002	54011	60 %	0 %	20 %	20 %	387504980
33	NC_017656	AACGT	2	10	56475	56484	40 %	20 %	20 %	20 %	387504985
34	NC_017656	GCGTC	2	10	59459	59468	0 %	20 %	40 %	40 %	387504988
35	NC_017656	ATGTT	2	10	60273	60282	20 %	60 %	20 %	0 %	387504989
36	NC_017656	CTTCG	2	10	60706	60715	0 %	40 %	20 %	40 %	387504989
37	NC_017656	TGCGT	2	10	60992	61001	0 %	40 %	40 %	20 %	387504989
38	NC_017656	AAAGT	2	10	68053	68062	60 %	20 %	20 %	0 %	387504993
39	NC_017656	GTGCT	2	10	69316	69325	0 %	40 %	40 %	20 %	387504994
40	NC_017656	GGTGA	2	10	70300	70309	20 %	20 %	60 %	0 %	387504994
41	NC_017656	CAGCG	2	10	71668	71677	20 %	0 %	40 %	40 %	387504996
42	NC_017656	GGATC	2	10	74163	74172	20 %	20 %	40 %	20 %	387504997
43	NC_017656	GGCAA	2	10	80815	80824	40 %	0 %	40 %	20 %	387505003
44	NC_017656	TTGCT	2	10	81550	81559	0 %	60 %	20 %	20 %	387505004
45	NC_017656	GATGG	2	10	82286	82295	20 %	20 %	60 %	0 %	387505004
46	NC_017656	GCTTC	2	10	83431	83440	0 %	40 %	20 %	40 %	387505005
47	NC_017656	CCTGG	2	10	84539	84548	0 %	20 %	40 %	40 %	387505006
48	NC_017656	GACCG	2	10	86806	86815	20 %	0 %	40 %	40 %	387505008
49	NC_017656	ATGTT	2	10	89353	89362	20 %	60 %	20 %	0 %	387505009
50	NC_017656	TGCAT	2	10	90295	90304	20 %	40 %	20 %	20 %	387505010
51	NC_017656	ATTCC	2	10	90465	90474	20 %	40 %	0 %	40 %	387505010
52	NC_017656	TTACG	2	10	91357	91366	20 %	40 %	20 %	20 %	387505010
53	NC_017656	AGTTC	2	10	95558	95567	20 %	40 %	20 %	20 %	387505014
54	NC_017656	CGTGG	2	10	96931	96940	0 %	20 %	60 %	20 %	387505016
55	NC_017656	GGGCT	2	10	101310	101319	0 %	20 %	60 %	20 %	387505019
56	NC_017656	GCCTG	2	10	101770	101779	0 %	20 %	40 %	40 %	387505020
57	NC_017656	ACCGT	2	10	103683	103692	20 %	20 %	20 %	40 %	387505021
58	NC_017656	ATCAG	2	10	105456	105465	40 %	20 %	20 %	20 %	387505023
59	NC_017656	TGACG	2	10	106928	106937	20 %	20 %	40 %	20 %	387505024
60	NC_017656	AGCCG	2	10	107224	107233	20 %	0 %	40 %	40 %	387505024
61	NC_017656	GCGCA	2	10	109552	109561	20 %	0 %	40 %	40 %	387505026
62	NC_017656	TGGCG	2	10	110546	110555	0 %	20 %	60 %	20 %	387505027
63	NC_017656	CCGGC	2	10	113515	113524	0 %	0 %	40 %	60 %	387505030
64	NC_017656	CGCGG	2	10	116724	116733	0 %	0 %	60 %	40 %	387505033
65	NC_017656	ATCCC	2	10	118968	118977	20 %	20 %	0 %	60 %	387505036
66	NC_017656	CATCG	2	10	118981	118990	20 %	20 %	20 %	40 %	387505036
67	NC_017656	TAACG	2	10	119675	119684	40 %	20 %	20 %	20 %	387505036
68	NC_017656	ATGCC	2	10	120134	120143	20 %	20 %	20 %	40 %	387505036
69	NC_017656	TCTGT	2	10	122363	122372	0 %	60 %	20 %	20 %	387505038
70	NC_017656	GCATG	2	10	123456	123465	20 %	20 %	40 %	20 %	387505039
71	NC_017656	AGCAG	2	10	124794	124803	40 %	0 %	40 %	20 %	387505041
72	NC_017656	CGAAG	2	10	126709	126718	40 %	0 %	40 %	20 %	387505042
73	NC_017656	ACACG	2	10	126842	126851	40 %	0 %	20 %	40 %	387505042
74	NC_017656	TCGCG	2	10	127103	127112	0 %	20 %	40 %	40 %	387505042
75	NC_017656	GCATC	2	10	127193	127202	20 %	20 %	20 %	40 %	387505042
76	NC_017656	GACTG	2	10	128511	128520	20 %	20 %	40 %	20 %	387505043
77	NC_017656	AGAGC	2	10	128921	128930	40 %	0 %	40 %	20 %	387505043
78	NC_017656	AGGCG	2	10	134077	134086	20 %	0 %	60 %	20 %	387505046
79	NC_017656	GGTTG	2	10	134830	134839	0 %	40 %	60 %	0 %	387505046
80	NC_017656	TCTGG	2	10	137476	137485	0 %	40 %	40 %	20 %	387505047
81	NC_017656	GGGCA	2	10	138888	138897	20 %	0 %	60 %	20 %	387505048
82	NC_017656	CAGCG	2	10	139167	139176	20 %	0 %	40 %	40 %	387505049
83	NC_017656	ACGAC	2	10	140447	140456	40 %	0 %	20 %	40 %	387505050
84	NC_017656	CCGTC	2	10	146152	146161	0 %	20 %	20 %	60 %	387505054
85	NC_017656	GTGAA	2	10	146162	146171	40 %	20 %	40 %	0 %	387505054
86	NC_017656	GTTCA	2	10	146549	146558	20 %	40 %	20 %	20 %	387505055
87	NC_017656	ATCCA	2	10	146875	146884	40 %	20 %	0 %	40 %	387505055
88	NC_017656	CTTTA	2	10	148138	148147	20 %	60 %	0 %	20 %	387505057
89	NC_017656	TGGCG	2	10	148365	148374	0 %	20 %	60 %	20 %	387505057
90	NC_017656	TTTCA	2	10	150678	150687	20 %	60 %	0 %	20 %	387505060
91	NC_017656	CCTTT	2	10	155372	155381	0 %	60 %	0 %	40 %	387505064
92	NC_017656	TTTAA	2	10	156932	156941	40 %	60 %	0 %	0 %	387505067
93	NC_017656	TGGTT	2	10	157294	157303	0 %	60 %	40 %	0 %	387505068
94	NC_017656	GCGAG	2	10	162693	162702	20 %	0 %	60 %	20 %	387505072
95	NC_017656	GGCGT	2	10	163131	163140	0 %	20 %	60 %	20 %	387505072
96	NC_017656	ACCAC	2	10	166034	166043	40 %	0 %	0 %	60 %	387505076
97	NC_017656	GGCGT	2	10	167737	167746	0 %	20 %	60 %	20 %	387505077
98	NC_017656	CGACG	2	10	168776	168785	20 %	0 %	40 %	40 %	387505077
99	NC_017656	CTGCG	2	10	170912	170921	0 %	20 %	40 %	40 %	387505078
100	NC_017656	AAAAC	2	10	172763	172772	80 %	0 %	0 %	20 %	387505079
101	NC_017656	TGGTT	2	10	173020	173029	0 %	60 %	40 %	0 %	387505079
102	NC_017656	AACCT	2	10	175101	175110	40 %	20 %	0 %	40 %	387505081
103	NC_017656	TGGTC	2	10	175143	175152	0 %	40 %	40 %	20 %	387505081
104	NC_017656	TGGCG	2	10	176388	176397	0 %	20 %	60 %	20 %	387505082
105	NC_017656	GGTCC	2	10	181952	181961	0 %	20 %	40 %	40 %	387505087
106	NC_017656	ACGGG	2	10	183869	183878	20 %	0 %	60 %	20 %	387505089
107	NC_017656	GTGAT	2	10	186028	186037	20 %	40 %	40 %	0 %	387505090
108	NC_017656	GTGAT	2	10	186319	186328	20 %	40 %	40 %	0 %	387505090
109	NC_017656	GCCAG	2	10	190038	190047	20 %	0 %	40 %	40 %	387505094
110	NC_017656	GTTCT	2	10	191479	191488	0 %	60 %	20 %	20 %	387505094
111	NC_017656	CTGAA	2	10	193471	193480	40 %	20 %	20 %	20 %	387505096
112	NC_017656	AAGCG	2	10	193535	193544	40 %	0 %	40 %	20 %	387505096
113	NC_017656	TGGTG	2	10	195441	195450	0 %	40 %	60 %	0 %	387505098
114	NC_017656	TGCAC	2	10	195567	195576	20 %	20 %	20 %	40 %	387505098
115	NC_017656	TGCGC	2	10	195960	195969	0 %	20 %	40 %	40 %	387505098
116	NC_017656	CATGG	2	10	197661	197670	20 %	20 %	40 %	20 %	387505100
117	NC_017656	CAGAT	2	10	198700	198709	40 %	20 %	20 %	20 %	387505101
118	NC_017656	ACTTT	2	10	198833	198842	20 %	60 %	0 %	20 %	387505101
119	NC_017656	GACGT	2	10	202753	202762	20 %	20 %	40 %	20 %	387505104
120	NC_017656	CGACG	2	10	204580	204589	20 %	0 %	40 %	40 %	387505106
121	NC_017656	CCACG	2	10	206421	206430	20 %	0 %	20 %	60 %	387505108
122	NC_017656	ATGCC	2	10	207148	207157	20 %	20 %	20 %	40 %	387505109
123	NC_017656	TGGCC	2	10	208474	208483	0 %	20 %	40 %	40 %	387505111
124	NC_017656	ACCGC	2	10	208487	208496	20 %	0 %	20 %	60 %	387505111
125	NC_017656	GTAAC	2	10	209217	209226	40 %	20 %	20 %	20 %	387505111
126	NC_017656	AGCCG	2	10	209845	209854	20 %	0 %	40 %	40 %	387505111
127	NC_017656	GGTGG	2	10	209954	209963	0 %	20 %	80 %	0 %	387505111
128	NC_017656	TTAGT	2	10	216915	216924	20 %	60 %	20 %	0 %	387505115
129	NC_017656	ACGGT	2	10	221010	221019	20 %	20 %	40 %	20 %	387505122
130	NC_017656	TGATT	2	10	223851	223860	20 %	60 %	20 %	0 %	387505125
131	NC_017656	CGCAA	2	10	225301	225310	40 %	0 %	20 %	40 %	387505127
132	NC_017656	GTGAA	2	10	235670	235679	40 %	20 %	40 %	0 %	387505132
133	NC_017656	TAATT	2	10	235854	235863	40 %	60 %	0 %	0 %	387505132
134	NC_017656	ACTGG	2	10	238792	238801	20 %	20 %	40 %	20 %	387505135
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141	NC_017656	ATTTC	2	10	255581	255590	20 %	60 %	0 %	20 %	387505149
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148	NC_017656	GCCCG	2	10	267196	267205	0 %	0 %	40 %	60 %	387505162
149	NC_017656	CGGGG	2	10	267425	267434	0 %	0 %	80 %	20 %	387505162
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155	NC_017656	GGTGT	2	10	277071	277080	0 %	40 %	60 %	0 %	387505167
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