MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 12902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017656	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	387504935
3	NC_017656	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	387504935
4	NC_017656	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	387504935
5	NC_017656	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	387504935
6	NC_017656	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	387504935
7	NC_017656	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	387504936
8	NC_017656	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	387504936
9	NC_017656	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	387504936
10	NC_017656	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	387504936
11	NC_017656	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	387504936
12	NC_017656	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	387504937
13	NC_017656	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	387504939
14	NC_017656	GCGG	2	8	6098	6105	0 %	0 %	75 %	25 %	387504939
15	NC_017656	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	387504939
16	NC_017656	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	387504940
17	NC_017656	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	387504940
18	NC_017656	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017656	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	387504941
20	NC_017656	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	387504941
21	NC_017656	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	387504941
22	NC_017656	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	387504941
23	NC_017656	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017656	GGTG	2	8	9661	9668	0 %	25 %	75 %	0 %	387504942
25	NC_017656	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	387504943
26	NC_017656	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	387504943
27	NC_017656	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017656	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	387504944
29	NC_017656	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	387504944
30	NC_017656	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	387504945
31	NC_017656	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017656	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017656	ATGG	2	8	12216	12223	25 %	25 %	50 %	0 %	387504946
34	NC_017656	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	387504946
35	NC_017656	ACCG	2	8	12674	12681	25 %	0 %	25 %	50 %	387504946
36	NC_017656	CAAC	2	8	12820	12827	50 %	0 %	0 %	50 %	387504946
37	NC_017656	AAGA	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	387504946
38	NC_017656	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	387504946
39	NC_017656	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017656	AACA	2	8	15873	15880	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017656	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017656	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017656	GGTT	2	8	16285	16292	0 %	50 %	50 %	0 %	387504949
44	NC_017656	GTGG	2	8	16909	16916	0 %	25 %	75 %	0 %	387504949
45	NC_017656	CGTT	2	8	17281	17288	0 %	50 %	25 %	25 %	387504949
46	NC_017656	TTTA	2	8	17453	17460	25 %	75 %	0 %	0 %	387504950
47	NC_017656	CCAC	2	8	17756	17763	25 %	0 %	0 %	75 %	387504950
48	NC_017656	AATA	2	8	18386	18393	75 %	25 %	0 %	0 %	387504951
49	NC_017656	CTTC	2	8	18408	18415	0 %	50 %	0 %	50 %	387504951
50	NC_017656	TGTT	2	8	19681	19688	0 %	75 %	25 %	0 %	387504952
51	NC_017656	TGGC	2	8	20142	20149	0 %	25 %	50 %	25 %	387504952
52	NC_017656	GAAC	2	8	20775	20782	50 %	0 %	25 %	25 %	387504952
53	NC_017656	TGAG	2	8	21031	21038	25 %	25 %	50 %	0 %	387504952
54	NC_017656	TAAA	2	8	21175	21182	75 %	25 %	0 %	0 %	387504952
55	NC_017656	CTTT	2	8	22122	22129	0 %	75 %	0 %	25 %	387504953
56	NC_017656	ATAA	2	8	22340	22347	75 %	25 %	0 %	0 %	387504953
57	NC_017656	TTAA	2	8	23019	23026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017656	TTAA	2	8	23253	23260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017656	TATT	2	8	24660	24667	25 %	75 %	0 %	0 %	387504955
60	NC_017656	CAGT	2	8	25660	25667	25 %	25 %	25 %	25 %	387504957
61	NC_017656	CATA	2	8	25817	25824	50 %	25 %	0 %	25 %	387504958
62	NC_017656	GCGT	2	8	26281	26288	0 %	25 %	50 %	25 %	387504958
63	NC_017656	CCGC	2	8	26704	26711	0 %	0 %	25 %	75 %	387504958
64	NC_017656	CTGG	2	8	27061	27068	0 %	25 %	50 %	25 %	387504959
65	NC_017656	CTGC	2	8	27522	27529	0 %	25 %	25 %	50 %	387504959
66	NC_017656	ACTC	2	8	28401	28408	25 %	25 %	0 %	50 %	387504959
67	NC_017656	GTGG	2	8	29277	29284	0 %	25 %	75 %	0 %	387504959
68	NC_017656	GCTG	2	8	29631	29638	0 %	25 %	50 %	25 %	387504960
69	NC_017656	ATGG	2	8	30491	30498	25 %	25 %	50 %	0 %	387504961
70	NC_017656	TTGA	2	8	31362	31369	25 %	50 %	25 %	0 %	387504962
71	NC_017656	TGGC	2	8	31905	31912	0 %	25 %	50 %	25 %	387504963
72	NC_017656	CTGG	2	8	32365	32372	0 %	25 %	50 %	25 %	387504963
73	NC_017656	GTGG	2	8	32530	32537	0 %	25 %	75 %	0 %	387504963
74	NC_017656	TCAT	2	8	32589	32596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017656	TCCC	2	8	32619	32626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017656	TGGC	2	8	32660	32667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017656	GCTG	2	8	32882	32889	0 %	25 %	50 %	25 %	387504964
78	NC_017656	CGTG	2	8	33359	33366	0 %	25 %	50 %	25 %	387504964
79	NC_017656	CATG	2	8	33829	33836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017656	AGTG	2	8	33979	33986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017656	TCCT	2	8	34141	34148	0 %	50 %	0 %	50 %	387504965
82	NC_017656	CTTA	2	8	34169	34176	25 %	50 %	0 %	25 %	387504965
83	NC_017656	AGCC	2	8	35071	35078	25 %	0 %	25 %	50 %	387504965
84	NC_017656	GGGC	2	8	35213	35220	0 %	0 %	75 %	25 %	387504966
85	NC_017656	GACC	2	8	35337	35344	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
86	NC_017656	TGAT	2	8	35786	35793	25 %	50 %	25 %	0 %	387504966
87	NC_017656	CGCA	2	8	36337	36344	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
88	NC_017656	CTGT	2	8	36511	36518	0 %	50 %	25 %	25 %	387504966
89	NC_017656	GGCG	2	8	36687	36694	0 %	0 %	75 %	25 %	387504966
90	NC_017656	ACCG	2	8	36841	36848	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
91	NC_017656	CGTC	2	8	37315	37322	0 %	25 %	25 %	50 %	387504966
92	NC_017656	GGCG	2	8	37524	37531	0 %	0 %	75 %	25 %	387504966
93	NC_017656	TGGC	2	8	37778	37785	0 %	25 %	50 %	25 %	387504966
94	NC_017656	GCTG	2	8	37791	37798	0 %	25 %	50 %	25 %	387504966
95	NC_017656	GCAC	2	8	38376	38383	25 %	0 %	25 %	50 %	387504966
96	NC_017656	GGTG	2	8	38722	38729	0 %	25 %	75 %	0 %	387504967
97	NC_017656	AAGA	2	8	38957	38964	75 %	0 %	25 %	0 %	387504967
98	NC_017656	CCAT	2	8	39443	39450	25 %	25 %	0 %	50 %	387504968
99	NC_017656	ATTT	2	8	40657	40664	25 %	75 %	0 %	0 %	387504970
100	NC_017656	TTCT	2	8	40669	40676	0 %	75 %	0 %	25 %	387504970
101	NC_017656	TTCA	2	8	40800	40807	25 %	50 %	0 %	25 %	387504970
102	NC_017656	CAGC	2	8	41013	41020	25 %	0 %	25 %	50 %	387504970
103	NC_017656	CCCG	2	8	41176	41183	0 %	0 %	25 %	75 %	387504970
104	NC_017656	TCGG	2	8	41648	41655	0 %	25 %	50 %	25 %	387504970
105	NC_017656	GGCG	2	8	41927	41934	0 %	0 %	75 %	25 %	387504970
106	NC_017656	GGGC	2	8	42246	42253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017656	CCAT	2	8	42461	42468	25 %	25 %	0 %	50 %	387504971
108	NC_017656	TGAT	2	8	42483	42490	25 %	50 %	25 %	0 %	387504971
109	NC_017656	AGGC	2	8	43014	43021	25 %	0 %	50 %	25 %	387504971
110	NC_017656	CCGA	2	8	44100	44107	25 %	0 %	25 %	50 %	387504972
111	NC_017656	CCCG	2	8	44496	44503	0 %	0 %	25 %	75 %	387504972
112	NC_017656	TCCA	2	8	44548	44555	25 %	25 %	0 %	50 %	387504972
113	NC_017656	TTAA	2	8	44801	44808	50 %	50 %	0 %	0 %	387504973
114	NC_017656	TATC	2	8	45194	45201	25 %	50 %	0 %	25 %	387504973
115	NC_017656	CACC	2	8	45345	45352	25 %	0 %	0 %	75 %	387504973
116	NC_017656	AGCC	2	8	45912	45919	25 %	0 %	25 %	50 %	387504973
117	NC_017656	CCAG	2	8	46112	46119	25 %	0 %	25 %	50 %	387504973
118	NC_017656	AACC	2	8	46120	46127	50 %	0 %	0 %	50 %	387504973
119	NC_017656	GAAA	2	8	46271	46278	75 %	0 %	25 %	0 %	387504973
120	NC_017656	ATTT	2	8	46346	46353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017656	GTTT	2	8	46363	46370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017656	GTGC	2	8	46816	46823	0 %	25 %	50 %	25 %	387504974
123	NC_017656	TGAT	2	8	47052	47059	25 %	50 %	25 %	0 %	387504974
124	NC_017656	CTGC	2	8	47312	47319	0 %	25 %	25 %	50 %	387504974
125	NC_017656	GTCG	2	8	48178	48185	0 %	25 %	50 %	25 %	387504975
126	NC_017656	ATGG	2	8	48285	48292	25 %	25 %	50 %	0 %	387504975
127	NC_017656	GTTA	2	8	48662	48669	25 %	50 %	25 %	0 %	387504976
128	NC_017656	CACC	2	8	49213	49220	25 %	0 %	0 %	75 %	387504976
129	NC_017656	ATTG	2	8	49460	49467	25 %	50 %	25 %	0 %	387504976
130	NC_017656	CCTT	2	8	49672	49679	0 %	50 %	0 %	50 %	387504976
131	NC_017656	TGTT	2	8	50499	50506	0 %	75 %	25 %	0 %	387504978
132	NC_017656	TGTT	2	8	50744	50751	0 %	75 %	25 %	0 %	387504978
133	NC_017656	TGTT	2	8	50934	50941	0 %	75 %	25 %	0 %	387504978
134	NC_017656	CTGG	2	8	51199	51206	0 %	25 %	50 %	25 %	387504978
135	NC_017656	TGCG	2	8	52404	52411	0 %	25 %	50 %	25 %	387504980
136	NC_017656	ATGA	2	8	52559	52566	50 %	25 %	25 %	0 %	387504980
137	NC_017656	GGCG	2	8	52723	52730	0 %	0 %	75 %	25 %	387504980
138	NC_017656	GGCG	2	8	52900	52907	0 %	0 %	75 %	25 %	387504980
139	NC_017656	GGAT	2	8	53514	53521	25 %	25 %	50 %	0 %	387504980
140	NC_017656	AACC	2	8	53584	53591	50 %	0 %	0 %	50 %	387504980
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