MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 8784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	GCT	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017656	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017656	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017656	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017656	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017656	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017656	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017656	CGC	2	6	5168	5173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017656	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017656	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017656	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017656	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017656	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017656	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017656	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017656	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017656	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017656	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017656	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017656	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017656	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017656	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017656	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017656	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017656	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017656	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017656	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017656	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017656	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017656	ACA	2	6	15891	15896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017656	TTC	2	6	16024	16029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017656	ATT	2	6	16049	16054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017656	GAT	2	6	16079	16084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017656	ATA	2	6	22442	22447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017656	ATC	2	6	23012	23017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017656	GTT	2	6	23072	23077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017656	ATT	2	6	23078	23083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017656	TGA	2	6	23124	23129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017656	ATT	2	6	23154	23159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017656	CTT	2	6	23162	23167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017656	AAG	2	6	23171	23176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017656	CAT	2	6	23187	23192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017656	ATT	2	6	23231	23236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017656	CTT	2	6	23293	23298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017656	TGA	2	6	24749	24754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017656	ACT	2	6	24787	24792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017656	AAG	2	6	24816	24821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017656	TAA	2	6	24861	24866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017656	GAG	2	6	24882	24887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017656	AGC	2	6	25139	25144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017656	CTT	2	6	25529	25534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017656	TGC	2	6	30123	30128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017656	AGC	2	6	31590	31595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017656	ATG	3	9	33565	33573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017656	TCT	2	6	33685	33690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017656	TGT	2	6	33696	33701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017656	TCT	2	6	33761	33766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017656	TGC	2	6	33767	33772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017656	GAT	2	6	33797	33802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017656	ATA	2	6	33846	33851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017656	GCC	2	6	33901	33906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017656	TCG	2	6	33920	33925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017656	TCA	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017656	TGA	2	6	38456	38461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017656	TGA	2	6	38512	38517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017656	GAT	2	6	39060	39065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017656	CAG	2	6	39128	39133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017656	CGC	2	6	39152	39157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017656	GAC	2	6	40579	40584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017656	ATT	2	6	40623	40628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017656	GCG	2	6	43546	43551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017656	ATT	3	9	46394	46402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017656	ATT	2	6	46519	46524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017656	ACC	2	6	46748	46753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017656	ACG	2	6	46761	46766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017656	CGC	2	6	50159	50164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017656	ATT	2	6	51562	51567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017656	GCG	2	6	54081	54086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017656	CAG	2	6	54113	54118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017656	CAT	2	6	54138	54143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017656	CGA	2	6	54156	54161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017656	CAA	2	6	59700	59705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017656	CAT	2	6	62074	62079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017656	GTG	2	6	62164	62169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017656	ATG	2	6	63134	63139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017656	GCC	2	6	63167	63172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017656	CTT	2	6	63183	63188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017656	TGG	2	6	63212	63217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017656	GAT	2	6	64218	64223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017656	ATG	2	6	64245	64250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017656	AGA	2	6	64257	64262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017656	CGT	2	6	64279	64284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017656	ACG	2	6	64287	64292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017656	GAA	2	6	64405	64410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017656	CAA	2	6	64473	64478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017656	ACC	2	6	68189	68194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017656	GTG	2	6	68216	68221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017656	TAA	2	6	75070	75075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017656	TCT	2	6	75159	75164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017656	CGC	2	6	76983	76988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017656	CTT	2	6	81301	81306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017656	AAT	2	6	83138	83143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017656	AGG	2	6	83160	83165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017656	GAA	2	6	83262	83267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017656	ACT	2	6	83296	83301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017656	CAT	2	6	83312	83317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017656	CTG	2	6	83363	83368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017656	AGA	2	6	88221	88226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017656	TAG	4	12	88233	88244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017656	TGC	2	6	88396	88401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017656	TGA	2	6	88537	88542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017656	ATT	2	6	88594	88599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017656	ATT	2	6	88643	88648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017656	GAT	2	6	88675	88680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017656	CAA	2	6	88717	88722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017656	ATT	2	6	88734	88739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017656	ATT	2	6	88871	88876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017656	GTG	2	6	90003	90008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017656	TAT	2	6	90023	90028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017656	GGA	2	6	90048	90053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017656	TCC	2	6	90076	90081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017656	TTA	2	6	90091	90096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017656	TAT	2	6	93692	93697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017656	AAT	2	6	93750	93755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017656	ATT	2	6	93783	93788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017656	TGA	2	6	93981	93986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017656	AAC	2	6	94053	94058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017656	TCC	2	6	94126	94131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017656	AAG	2	6	105305	105310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017656	CGA	2	6	109818	109823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017656	CCG	2	6	111064	111069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017656	ATA	2	6	111110	111115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017656	TTA	2	6	112801	112806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017656	CGC	2	6	116011	116016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017656	TCA	2	6	117683	117688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017656	TGA	2	6	117730	117735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017656	GGT	2	6	120203	120208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017656	GCG	2	6	120415	120420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017656	TGC	2	6	120459	120464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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