MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 66489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504935
2	NC_017656	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504935
3	NC_017656	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
4	NC_017656	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504935
5	NC_017656	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504935
6	NC_017656	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504935
7	NC_017656	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504935
8	NC_017656	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504935
9	NC_017656	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504935
10	NC_017656	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504935
11	NC_017656	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504935
12	NC_017656	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504935
13	NC_017656	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504935
14	NC_017656	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504935
15	NC_017656	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
16	NC_017656	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504935
17	NC_017656	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504935
18	NC_017656	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504935
19	NC_017656	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504935
20	NC_017656	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504935
21	NC_017656	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504935
22	NC_017656	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504935
23	NC_017656	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504935
24	NC_017656	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
25	NC_017656	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504935
26	NC_017656	CTG	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504935
27	NC_017656	GAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504935
28	NC_017656	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504935
29	NC_017656	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504935
30	NC_017656	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504935
31	NC_017656	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504935
32	NC_017656	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504935
33	NC_017656	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
34	NC_017656	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
35	NC_017656	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
36	NC_017656	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504935
37	NC_017656	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504935
38	NC_017656	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
39	NC_017656	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504935
40	NC_017656	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504935
41	NC_017656	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504935
42	NC_017656	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504936
43	NC_017656	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504936
44	NC_017656	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504936
45	NC_017656	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504936
46	NC_017656	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504936
47	NC_017656	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504936
48	NC_017656	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504936
49	NC_017656	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504936
50	NC_017656	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504936
51	NC_017656	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504936
52	NC_017656	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504936
53	NC_017656	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504936
54	NC_017656	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504937
55	NC_017656	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504937
56	NC_017656	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504937
57	NC_017656	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504937
58	NC_017656	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504937
59	NC_017656	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504937
60	NC_017656	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504937
61	NC_017656	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504937
62	NC_017656	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504937
63	NC_017656	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504937
64	NC_017656	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504937
65	NC_017656	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504937
66	NC_017656	GCC	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504937
67	NC_017656	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504937
68	NC_017656	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504937
69	NC_017656	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504937
70	NC_017656	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504937
71	NC_017656	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504937
72	NC_017656	TTA	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504938
73	NC_017656	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504938
74	NC_017656	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504938
75	NC_017656	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504938
76	NC_017656	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504938
77	NC_017656	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504938
78	NC_017656	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504938
79	NC_017656	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504938
80	NC_017656	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504939
81	NC_017656	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504939
82	NC_017656	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504939
83	NC_017656	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504939
84	NC_017656	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504939
85	NC_017656	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504939
86	NC_017656	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504939
87	NC_017656	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504939
88	NC_017656	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504939
89	NC_017656	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504939
90	NC_017656	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504939
91	NC_017656	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504939
92	NC_017656	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504939
93	NC_017656	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504939
94	NC_017656	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504940
95	NC_017656	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504940
96	NC_017656	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504940
97	NC_017656	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504940
98	NC_017656	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504940
99	NC_017656	CGC	2	6	7101	7106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504940
100	NC_017656	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504940
101	NC_017656	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504940
102	NC_017656	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504940
103	NC_017656	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504940
104	NC_017656	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504940
105	NC_017656	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504940
106	NC_017656	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504940
107	NC_017656	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504940
108	NC_017656	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504941
109	NC_017656	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504941
110	NC_017656	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504941
111	NC_017656	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504941
112	NC_017656	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504941
113	NC_017656	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504941
114	NC_017656	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504941
115	NC_017656	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504941
116	NC_017656	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504941
117	NC_017656	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504941
118	NC_017656	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504941
119	NC_017656	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504941
120	NC_017656	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504942
121	NC_017656	GCG	2	6	9354	9359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504942
122	NC_017656	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504942
123	NC_017656	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504942
124	NC_017656	TGG	2	6	9486	9491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504942
125	NC_017656	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387504942
126	NC_017656	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504942
127	NC_017656	TGC	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504942
128	NC_017656	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504943
129	NC_017656	GCG	2	6	10051	10056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504943
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253	NC_017656	AAC	2	6	18828	18833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504951
254	NC_017656	TCT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504951
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277	NC_017656	TAT	2	6	20458	20463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504952
278	NC_017656	ATT	2	6	20501	20506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504952
279	NC_017656	TAC	2	6	20512	20517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504952
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362	NC_017656	ATC	2	6	27297	27302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504959
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499	NC_017656	CTG	2	6	38062	38067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504966
500	NC_017656	CAT	2	6	38208	38213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504966

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