MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 8435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017656	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017656	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	387504935
3	NC_017656	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	387504935
4	NC_017656	TA	3	6	1030	1035	50 %	50 %	0 %	0 %	387504935
5	NC_017656	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	387504935
6	NC_017656	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	387504935
7	NC_017656	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	387504935
8	NC_017656	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	387504936
9	NC_017656	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	387504937
10	NC_017656	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	387504937
11	NC_017656	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	387504937
12	NC_017656	GA	3	6	5090	5095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017656	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017656	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	387504940
15	NC_017656	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	387504940
16	NC_017656	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017656	TC	3	6	8345	8350	0 %	50 %	0 %	50 %	387504941
18	NC_017656	CG	3	6	8432	8437	0 %	0 %	50 %	50 %	387504941
19	NC_017656	TG	3	6	9477	9482	0 %	50 %	50 %	0 %	387504942
20	NC_017656	AG	3	6	11612	11617	50 %	0 %	50 %	0 %	387504945
21	NC_017656	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017656	CG	3	6	13558	13563	0 %	0 %	50 %	50 %	387504946
23	NC_017656	CG	3	6	14501	14506	0 %	0 %	50 %	50 %	387504947
24	NC_017656	CT	3	6	15556	15561	0 %	50 %	0 %	50 %	387504948
25	NC_017656	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017656	CT	3	6	16684	16689	0 %	50 %	0 %	50 %	387504949
27	NC_017656	TG	3	6	16734	16739	0 %	50 %	50 %	0 %	387504949
28	NC_017656	GA	3	6	17358	17363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017656	TA	3	6	19166	19171	50 %	50 %	0 %	0 %	387504951
30	NC_017656	AT	4	8	19288	19295	50 %	50 %	0 %	0 %	387504952
31	NC_017656	TA	3	6	19502	19507	50 %	50 %	0 %	0 %	387504952
32	NC_017656	GC	3	6	19714	19719	0 %	0 %	50 %	50 %	387504952
33	NC_017656	AT	3	6	19937	19942	50 %	50 %	0 %	0 %	387504952
34	NC_017656	GT	3	6	20489	20494	0 %	50 %	50 %	0 %	387504952
35	NC_017656	AT	4	8	20642	20649	50 %	50 %	0 %	0 %	387504952
36	NC_017656	AT	3	6	20687	20692	50 %	50 %	0 %	0 %	387504952
37	NC_017656	AG	3	6	21018	21023	50 %	0 %	50 %	0 %	387504952
38	NC_017656	AT	3	6	23733	23738	50 %	50 %	0 %	0 %	387504955
39	NC_017656	AT	3	6	24376	24381	50 %	50 %	0 %	0 %	387504955
40	NC_017656	TC	3	6	24515	24520	0 %	50 %	0 %	50 %	387504955
41	NC_017656	TA	3	6	24908	24913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017656	GT	3	6	25115	25120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017656	TC	3	6	25121	25126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017656	GC	3	6	25434	25439	0 %	0 %	50 %	50 %	387504956
45	NC_017656	GT	3	6	25850	25855	0 %	50 %	50 %	0 %	387504958
46	NC_017656	CG	3	6	25896	25901	0 %	0 %	50 %	50 %	387504958
47	NC_017656	CG	3	6	27282	27287	0 %	0 %	50 %	50 %	387504959
48	NC_017656	GC	3	6	27955	27960	0 %	0 %	50 %	50 %	387504959
49	NC_017656	GC	4	8	28073	28080	0 %	0 %	50 %	50 %	387504959
50	NC_017656	CG	3	6	28757	28762	0 %	0 %	50 %	50 %	387504959
51	NC_017656	GC	3	6	29919	29924	0 %	0 %	50 %	50 %	387504960
52	NC_017656	AT	3	6	30729	30734	50 %	50 %	0 %	0 %	387504962
53	NC_017656	TG	3	6	31079	31084	0 %	50 %	50 %	0 %	387504962
54	NC_017656	CG	3	6	31353	31358	0 %	0 %	50 %	50 %	387504962
55	NC_017656	TC	3	6	32248	32253	0 %	50 %	0 %	50 %	387504963
56	NC_017656	CT	3	6	34298	34303	0 %	50 %	0 %	50 %	387504965
57	NC_017656	CG	3	6	34448	34453	0 %	0 %	50 %	50 %	387504965
58	NC_017656	GC	3	6	35261	35266	0 %	0 %	50 %	50 %	387504966
59	NC_017656	GC	3	6	35465	35470	0 %	0 %	50 %	50 %	387504966
60	NC_017656	CG	3	6	35601	35606	0 %	0 %	50 %	50 %	387504966
61	NC_017656	TC	4	8	35763	35770	0 %	50 %	0 %	50 %	387504966
62	NC_017656	CG	3	6	36502	36507	0 %	0 %	50 %	50 %	387504966
63	NC_017656	GC	3	6	36670	36675	0 %	0 %	50 %	50 %	387504966
64	NC_017656	AT	3	6	38569	38574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017656	TG	3	6	38656	38661	0 %	50 %	50 %	0 %	387504967
66	NC_017656	AG	3	6	38736	38741	50 %	0 %	50 %	0 %	387504967
67	NC_017656	CG	3	6	38915	38920	0 %	0 %	50 %	50 %	387504967
68	NC_017656	CT	3	6	39422	39427	0 %	50 %	0 %	50 %	387504968
69	NC_017656	CA	3	6	39490	39495	50 %	0 %	0 %	50 %	387504968
70	NC_017656	TC	3	6	40379	40384	0 %	50 %	0 %	50 %	387504969
71	NC_017656	GC	3	6	43992	43997	0 %	0 %	50 %	50 %	387504972
72	NC_017656	CG	3	6	44264	44269	0 %	0 %	50 %	50 %	387504972
73	NC_017656	TG	3	6	44467	44472	0 %	50 %	50 %	0 %	387504972
74	NC_017656	GC	4	8	45142	45149	0 %	0 %	50 %	50 %	387504973
75	NC_017656	CG	3	6	47025	47030	0 %	0 %	50 %	50 %	387504974
76	NC_017656	GC	3	6	48127	48132	0 %	0 %	50 %	50 %	387504975
77	NC_017656	GC	3	6	48934	48939	0 %	0 %	50 %	50 %	387504976
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80	NC_017656	AT	3	6	51585	51590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017656	CT	3	6	51735	51740	0 %	50 %	0 %	50 %	387504979
82	NC_017656	CT	3	6	52704	52709	0 %	50 %	0 %	50 %	387504980
83	NC_017656	CG	3	6	53861	53866	0 %	0 %	50 %	50 %	387504980
84	NC_017656	GA	3	6	54095	54100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017656	CA	3	6	54796	54801	50 %	0 %	0 %	50 %	387504982
86	NC_017656	GC	3	6	55274	55279	0 %	0 %	50 %	50 %	387504983
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88	NC_017656	CG	4	8	56051	56058	0 %	0 %	50 %	50 %	387504984
89	NC_017656	AC	3	6	56535	56540	50 %	0 %	0 %	50 %	387504985
90	NC_017656	AC	3	6	56755	56760	50 %	0 %	0 %	50 %	387504986
91	NC_017656	GA	3	6	58667	58672	50 %	0 %	50 %	0 %	387504988
92	NC_017656	GC	4	8	59053	59060	0 %	0 %	50 %	50 %	387504988
93	NC_017656	AT	3	6	60071	60076	50 %	50 %	0 %	0 %	387504989
94	NC_017656	GC	4	8	60525	60532	0 %	0 %	50 %	50 %	387504989
95	NC_017656	GT	3	6	62289	62294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017656	AT	3	6	62306	62311	50 %	50 %	0 %	0 %	387504990
97	NC_017656	GC	3	6	63379	63384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017656	AG	3	6	63885	63890	50 %	0 %	50 %	0 %	387504991
99	NC_017656	CG	3	6	66682	66687	0 %	0 %	50 %	50 %	387504993
100	NC_017656	AG	3	6	67562	67567	50 %	0 %	50 %	0 %	387504993
101	NC_017656	CG	3	6	67636	67641	0 %	0 %	50 %	50 %	387504993
102	NC_017656	CG	4	8	67755	67762	0 %	0 %	50 %	50 %	387504993
103	NC_017656	GC	3	6	71795	71800	0 %	0 %	50 %	50 %	387504996
104	NC_017656	TG	3	6	72409	72414	0 %	50 %	50 %	0 %	387504996
105	NC_017656	CG	3	6	72724	72729	0 %	0 %	50 %	50 %	387504996
106	NC_017656	GT	3	6	72895	72900	0 %	50 %	50 %	0 %	387504996
107	NC_017656	CG	3	6	73463	73468	0 %	0 %	50 %	50 %	387504997
108	NC_017656	GC	3	6	74618	74623	0 %	0 %	50 %	50 %	387504997
109	NC_017656	AG	3	6	74891	74896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017656	GA	3	6	75418	75423	50 %	0 %	50 %	0 %	387504998
111	NC_017656	CG	3	6	75487	75492	0 %	0 %	50 %	50 %	387504998
112	NC_017656	TG	3	6	76928	76933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017656	GC	3	6	77927	77932	0 %	0 %	50 %	50 %	387505001
114	NC_017656	AC	3	6	78538	78543	50 %	0 %	0 %	50 %	387505001
115	NC_017656	GC	3	6	79056	79061	0 %	0 %	50 %	50 %	387505001
116	NC_017656	AG	3	6	79087	79092	50 %	0 %	50 %	0 %	387505001
117	NC_017656	GA	3	6	79100	79105	50 %	0 %	50 %	0 %	387505001
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119	NC_017656	CG	3	6	82324	82329	0 %	0 %	50 %	50 %	387505004
120	NC_017656	GC	3	6	83893	83898	0 %	0 %	50 %	50 %	387505005
121	NC_017656	TG	3	6	83990	83995	0 %	50 %	50 %	0 %	387505005
122	NC_017656	CG	3	6	84357	84362	0 %	0 %	50 %	50 %	387505006
123	NC_017656	CG	3	6	84477	84482	0 %	0 %	50 %	50 %	387505006
124	NC_017656	GC	3	6	85188	85193	0 %	0 %	50 %	50 %	387505006
125	NC_017656	GC	3	6	85291	85296	0 %	0 %	50 %	50 %	387505006
126	NC_017656	AT	3	6	85348	85353	50 %	50 %	0 %	0 %	387505006
127	NC_017656	GC	3	6	86239	86244	0 %	0 %	50 %	50 %	387505007
128	NC_017656	TC	3	6	89792	89797	0 %	50 %	0 %	50 %	387505009
129	NC_017656	TG	3	6	89950	89955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017656	CT	3	6	89958	89963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017656	GC	4	8	90374	90381	0 %	0 %	50 %	50 %	387505010
132	NC_017656	GC	3	6	90781	90786	0 %	0 %	50 %	50 %	387505010
133	NC_017656	GC	3	6	91261	91266	0 %	0 %	50 %	50 %	387505010
134	NC_017656	TC	3	6	91743	91748	0 %	50 %	0 %	50 %	387505010
135	NC_017656	GA	3	6	91904	91909	50 %	0 %	50 %	0 %	387505010
136	NC_017656	GC	3	6	92153	92158	0 %	0 %	50 %	50 %	387505011
137	NC_017656	CG	3	6	92384	92389	0 %	0 %	50 %	50 %	387505011
138	NC_017656	GC	3	6	93145	93150	0 %	0 %	50 %	50 %	387505012
139	NC_017656	CG	3	6	93214	93219	0 %	0 %	50 %	50 %	387505012
140	NC_017656	AG	3	6	95578	95583	50 %	0 %	50 %	0 %	387505014
141	NC_017656	AG	3	6	97203	97208	50 %	0 %	50 %	0 %	387505016
142	NC_017656	GA	3	6	97794	97799	50 %	0 %	50 %	0 %	387505017
143	NC_017656	AT	3	6	97876	97881	50 %	50 %	0 %	0 %	387505017
144	NC_017656	GT	3	6	98869	98874	0 %	50 %	50 %	0 %	387505017
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