MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_5

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017655	ATT	2	6	88	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017655	ACA	2	6	251	256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504925
3	NC_017655	ATT	2	6	295	300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504925
4	NC_017655	AGA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504925
5	NC_017655	TCA	3	9	502	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504925
6	NC_017655	CTA	2	6	576	581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504925
7	NC_017655	TAA	2	6	601	606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504925
8	NC_017655	GAA	2	6	648	653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504925
9	NC_017655	TAT	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504926
10	NC_017655	ATA	2	6	796	801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504926
11	NC_017655	GTG	2	6	857	862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504926
12	NC_017655	GAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504926
13	NC_017655	TTA	2	6	1100	1105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504926
14	NC_017655	TAA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387504926
15	NC_017655	TTA	2	6	1213	1218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504926
16	NC_017655	ATC	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504926
17	NC_017655	TTC	2	6	1341	1346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504926
18	NC_017655	CTT	2	6	1363	1368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504926
19	NC_017655	CTT	2	6	1468	1473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504926
20	NC_017655	TAT	2	6	1557	1562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504926
21	NC_017655	GAT	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504926
22	NC_017655	TAT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504926
23	NC_017655	TGG	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504926
24	NC_017655	TCT	2	6	1807	1812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387504926
25	NC_017655	TTA	2	6	1831	1836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387504926
26	NC_017655	TAT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017655	GCT	2	6	2203	2208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017655	CAC	2	6	2359	2364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017655	GCT	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017655	GCG	2	6	2774	2779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017655	CGC	2	6	2884	2889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017655	CAG	2	6	3305	3310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504927
33	NC_017655	TGA	3	9	3457	3465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504928
34	NC_017655	AAC	2	6	3498	3503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387504928
35	NC_017655	GCG	2	6	3517	3522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504928
36	NC_017655	CCG	2	6	3575	3580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504928
37	NC_017655	GCC	2	6	3596	3601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504928
38	NC_017655	GGT	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504928
39	NC_017655	GAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504928
40	NC_017655	GGT	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504929
41	NC_017655	CTG	2	6	3807	3812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504929
42	NC_017655	GAA	2	6	3861	3866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504929
43	NC_017655	GAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504929
44	NC_017655	GCC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504929
45	NC_017655	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387504929
46	NC_017655	TAC	2	6	4116	4121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387504929
47	NC_017655	CCG	2	6	4208	4213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387504929
48	NC_017655	CGG	2	6	4403	4408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387504929
49	NC_017655	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504929
50	NC_017655	ACG	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504929
51	NC_017655	GAT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504929
52	NC_017655	GCA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504929
53	NC_017655	ATG	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387504929
54	NC_017655	GAA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504929
55	NC_017655	GAA	2	6	4810	4815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387504929
56	NC_017655	CAG	2	6	5128	5133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504929
57	NC_017655	GCA	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387504929
58	NC_017655	TGT	2	6	5321	5326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017655	TTG	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504932
60	NC_017655	TCT	2	6	5531	5536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017655	CAG	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017655	GGT	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504933
63	NC_017655	TTG	2	6	5670	5675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387504933
64	NC_017655	CTG	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387504933
65	NC_017655	GTG	2	6	5721	5726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387504933
66	NC_017655	TGG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017655	ATT	2	6	5835	5840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017655	TAT	2	6	5876	5881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017655	AGG	2	6	5914	5919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.