MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_3

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017654	CCAA	2	8	233	240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017654	AAAG	2	8	493	500	75 %	0 %	25 %	0 %	387504829
3	NC_017654	AATC	2	8	746	753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017654	CCAG	2	8	966	973	25 %	0 %	25 %	50 %	387504830
5	NC_017654	TCCA	2	8	1018	1025	25 %	25 %	0 %	50 %	387504830
6	NC_017654	AGTA	2	8	1053	1060	50 %	25 %	25 %	0 %	387504830
7	NC_017654	TTCA	2	8	1140	1147	25 %	50 %	0 %	25 %	387504830
8	NC_017654	AAGT	2	8	1239	1246	50 %	25 %	25 %	0 %	387504830
9	NC_017654	CAGG	2	8	2533	2540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017654	TTCC	2	8	2764	2771	0 %	50 %	0 %	50 %	387504832
11	NC_017654	AACG	2	8	2961	2968	50 %	0 %	25 %	25 %	387504832
12	NC_017654	CGCT	2	8	3510	3517	0 %	25 %	25 %	50 %	387504832
13	NC_017654	GCTG	2	8	3635	3642	0 %	25 %	50 %	25 %	387504832
14	NC_017654	GGCA	2	8	4042	4049	25 %	0 %	50 %	25 %	387504832
15	NC_017654	ACAG	2	8	4138	4145	50 %	0 %	25 %	25 %	387504832
16	NC_017654	CTCC	2	8	4284	4291	0 %	25 %	0 %	75 %	387504832
17	NC_017654	CAAT	2	8	4645	4652	50 %	25 %	0 %	25 %	387504832
18	NC_017654	GACT	2	8	5110	5117	25 %	25 %	25 %	25 %	387504832
19	NC_017654	GCAG	2	8	5366	5373	25 %	0 %	50 %	25 %	387504832
20	NC_017654	AACT	2	8	5847	5854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017654	ATGG	2	8	6336	6343	25 %	25 %	50 %	0 %	387504833
22	NC_017654	TTGA	2	8	6411	6418	25 %	50 %	25 %	0 %	387504833
23	NC_017654	AAAC	2	8	6834	6841	75 %	0 %	0 %	25 %	387504834
24	NC_017654	ATTT	2	8	6962	6969	25 %	75 %	0 %	0 %	387504834
25	NC_017654	TAAA	2	8	7111	7118	75 %	25 %	0 %	0 %	387504834
26	NC_017654	TCGT	2	8	7696	7703	0 %	50 %	25 %	25 %	387504835
27	NC_017654	TGAT	2	8	7754	7761	25 %	50 %	25 %	0 %	387504835
28	NC_017654	TGAG	2	8	8408	8415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017654	GTCT	2	8	9071	9078	0 %	50 %	25 %	25 %	387504838
30	NC_017654	GCTG	2	8	9139	9146	0 %	25 %	50 %	25 %	387504838
31	NC_017654	AGGA	2	8	10216	10223	50 %	0 %	50 %	0 %	387504839
32	NC_017654	GGCG	2	8	10315	10322	0 %	0 %	75 %	25 %	387504839
33	NC_017654	GAGC	2	8	10692	10699	25 %	0 %	50 %	25 %	387504839
34	NC_017654	TGGT	2	8	10905	10912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017654	TCAG	2	8	10935	10942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017654	CTGG	2	8	11124	11131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017654	TCAG	2	8	11984	11991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017654	TTGA	2	8	12006	12013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.