MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	CAAT	2	8	187	194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017653	ACGC	2	8	335	342	25 %	0 %	25 %	50 %	387504722
3	NC_017653	GTTC	2	8	868	875	0 %	50 %	25 %	25 %	387504723
4	NC_017653	GATT	2	8	1244	1251	25 %	50 %	25 %	0 %	387504723
5	NC_017653	CTGT	2	8	1557	1564	0 %	50 %	25 %	25 %	387504724
6	NC_017653	CAAT	2	8	1885	1892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017653	ATTG	2	8	1966	1973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017653	TATT	2	8	3261	3268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017653	GACT	2	8	3408	3415	25 %	25 %	25 %	25 %	387504726
10	NC_017653	CGGA	2	8	4653	4660	25 %	0 %	50 %	25 %	387504727
11	NC_017653	CAGA	2	8	4785	4792	50 %	0 %	25 %	25 %	387504727
12	NC_017653	GCCT	2	8	5194	5201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017653	CTGG	2	8	5600	5607	0 %	25 %	50 %	25 %	387504728
14	NC_017653	AAGA	2	8	5640	5647	75 %	0 %	25 %	0 %	387504728
15	NC_017653	GCTG	2	8	5681	5688	0 %	25 %	50 %	25 %	387504728
16	NC_017653	GGAT	2	8	5797	5804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017653	AGTA	2	8	6600	6607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017653	ACTC	2	8	6759	6766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017653	GCTG	2	8	6991	6998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017653	TCAA	2	8	7450	7457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017653	TTAT	2	8	7667	7674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017653	TACA	2	8	7720	7727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017653	TGTT	2	8	8039	8046	0 %	75 %	25 %	0 %	387504730
24	NC_017653	CAGC	2	8	8774	8781	25 %	0 %	25 %	50 %	387504732
25	NC_017653	ACTC	2	8	10213	10220	25 %	25 %	0 %	50 %	387504732
26	NC_017653	TTTA	2	8	10259	10266	25 %	75 %	0 %	0 %	387504732
27	NC_017653	TTCT	2	8	10631	10638	0 %	75 %	0 %	25 %	387504732
28	NC_017653	CTGG	2	8	10926	10933	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
29	NC_017653	CCCA	2	8	11063	11070	25 %	0 %	0 %	75 %	387504732
30	NC_017653	TATC	2	8	11491	11498	25 %	50 %	0 %	25 %	387504732
31	NC_017653	ATCG	2	8	12095	12102	25 %	25 %	25 %	25 %	387504732
32	NC_017653	CCAT	2	8	12684	12691	25 %	25 %	0 %	50 %	387504732
33	NC_017653	ACTG	2	8	13338	13345	25 %	25 %	25 %	25 %	387504732
34	NC_017653	CTGG	2	8	13659	13666	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
35	NC_017653	CTGC	2	8	13930	13937	0 %	25 %	25 %	50 %	387504732
36	NC_017653	GGCT	2	8	14070	14077	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
37	NC_017653	TGAT	2	8	14113	14120	25 %	50 %	25 %	0 %	387504732
38	NC_017653	CGGT	2	8	14344	14351	0 %	25 %	50 %	25 %	387504732
39	NC_017653	GAAT	2	8	14918	14925	50 %	25 %	25 %	0 %	387504732
40	NC_017653	CAGC	2	8	14941	14948	25 %	0 %	25 %	50 %	387504732
41	NC_017653	CCAG	2	8	15210	15217	25 %	0 %	25 %	50 %	387504732
42	NC_017653	ATAG	2	8	15423	15430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017653	GCTG	2	8	15610	15617	0 %	25 %	50 %	25 %	387504733
44	NC_017653	TGGC	2	8	15708	15715	0 %	25 %	50 %	25 %	387504733
45	NC_017653	ACGC	2	8	15848	15855	25 %	0 %	25 %	50 %	387504733
46	NC_017653	TTCA	2	8	16823	16830	25 %	50 %	0 %	25 %	387504733
47	NC_017653	GAAC	2	8	17101	17108	50 %	0 %	25 %	25 %	387504733
48	NC_017653	GTAT	2	8	17297	17304	25 %	50 %	25 %	0 %	387504734
49	NC_017653	GGCG	2	8	17613	17620	0 %	0 %	75 %	25 %	387504734
50	NC_017653	GCAG	2	8	17792	17799	25 %	0 %	50 %	25 %	387504734
51	NC_017653	TCAA	2	8	18216	18223	50 %	25 %	0 %	25 %	387504734
52	NC_017653	TTTC	2	8	18343	18350	0 %	75 %	0 %	25 %	387504735
53	NC_017653	TGGA	2	8	18673	18680	25 %	25 %	50 %	0 %	387504737
54	NC_017653	TGGT	2	8	18991	18998	0 %	50 %	50 %	0 %	387504737
55	NC_017653	GACT	2	8	19146	19153	25 %	25 %	25 %	25 %	387504737
56	NC_017653	TAAT	2	8	19226	19233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017653	GAAT	2	8	19365	19372	50 %	25 %	25 %	0 %	387504738
58	NC_017653	GAGT	2	8	19458	19465	25 %	25 %	50 %	0 %	387504738
59	NC_017653	AACC	2	8	19642	19649	50 %	0 %	0 %	50 %	387504738
60	NC_017653	GAAA	2	8	19761	19768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017653	CAAA	2	8	19805	19812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017653	CATT	2	8	20281	20288	25 %	50 %	0 %	25 %	387504739
63	NC_017653	TTCC	2	8	21167	21174	0 %	50 %	0 %	50 %	387504740
64	NC_017653	CCAG	2	8	21523	21530	25 %	0 %	25 %	50 %	387504741
65	NC_017653	TTAC	2	8	21915	21922	25 %	50 %	0 %	25 %	387504742
66	NC_017653	ATGT	2	8	24804	24811	25 %	50 %	25 %	0 %	387504743
67	NC_017653	ACTC	2	8	25620	25627	25 %	25 %	0 %	50 %	387504744
68	NC_017653	TTGA	2	8	27137	27144	25 %	50 %	25 %	0 %	387504745
69	NC_017653	CATC	2	8	28294	28301	25 %	25 %	0 %	50 %	387504747
70	NC_017653	TCAT	2	8	28538	28545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017653	TTAA	2	8	28795	28802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017653	AATA	2	8	28817	28824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017653	AATT	2	8	29368	29375	50 %	50 %	0 %	0 %	387504748
74	NC_017653	CTGT	2	8	29447	29454	0 %	50 %	25 %	25 %	387504748
75	NC_017653	TAGG	2	8	29767	29774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017653	GCTG	2	8	29863	29870	0 %	25 %	50 %	25 %	387504749
77	NC_017653	GGCT	2	8	30340	30347	0 %	25 %	50 %	25 %	387504750
78	NC_017653	GACG	2	8	30457	30464	25 %	0 %	50 %	25 %	387504750
79	NC_017653	CAGG	2	8	31802	31809	25 %	0 %	50 %	25 %	387504753
80	NC_017653	GTCA	2	8	32178	32185	25 %	25 %	25 %	25 %	387504753
81	NC_017653	TTGA	2	8	32186	32193	25 %	50 %	25 %	0 %	387504753
82	NC_017653	GCAG	2	8	32254	32261	25 %	0 %	50 %	25 %	387504753
83	NC_017653	AATT	2	8	32577	32584	50 %	50 %	0 %	0 %	387504754
84	NC_017653	GCTT	2	8	33038	33045	0 %	50 %	25 %	25 %	387504754
85	NC_017653	ATCA	2	8	34030	34037	50 %	25 %	0 %	25 %	387504754
86	NC_017653	TCCA	2	8	34327	34334	25 %	25 %	0 %	50 %	387504754
87	NC_017653	GTAA	2	8	34495	34502	50 %	25 %	25 %	0 %	387504754
88	NC_017653	TCAT	2	8	34523	34530	25 %	50 %	0 %	25 %	387504754
89	NC_017653	AAAG	2	8	36080	36087	75 %	0 %	25 %	0 %	387504757
90	NC_017653	TTTG	2	8	36290	36297	0 %	75 %	25 %	0 %	387504757
91	NC_017653	AAAT	2	8	36310	36317	75 %	25 %	0 %	0 %	387504757
92	NC_017653	CAAC	2	8	36943	36950	50 %	0 %	0 %	50 %	387504757
93	NC_017653	CAGC	2	8	37153	37160	25 %	0 %	25 %	50 %	387504757
94	NC_017653	GAAT	2	8	37253	37260	50 %	25 %	25 %	0 %	387504757
95	NC_017653	ATCA	2	8	37676	37683	50 %	25 %	0 %	25 %	387504758
96	NC_017653	TCAT	2	8	37696	37703	25 %	50 %	0 %	25 %	387504759
97	NC_017653	GCAA	2	8	37819	37826	50 %	0 %	25 %	25 %	387504759
98	NC_017653	GGTT	2	8	37959	37966	0 %	50 %	50 %	0 %	387504759
99	NC_017653	TTTC	2	8	38501	38508	0 %	75 %	0 %	25 %	387504759
100	NC_017653	GCTT	2	8	38596	38603	0 %	50 %	25 %	25 %	387504759
101	NC_017653	TATT	2	8	38803	38810	25 %	75 %	0 %	0 %	387504759
102	NC_017653	TTTC	2	8	39206	39213	0 %	75 %	0 %	25 %	387504759
103	NC_017653	CCGT	2	8	40220	40227	0 %	25 %	25 %	50 %	387504759
104	NC_017653	CAGC	2	8	41882	41889	25 %	0 %	25 %	50 %	387504760
105	NC_017653	GTTG	2	8	42393	42400	0 %	50 %	50 %	0 %	387504761
106	NC_017653	GGTA	2	8	42454	42461	25 %	25 %	50 %	0 %	387504761
107	NC_017653	GATA	2	8	42804	42811	50 %	25 %	25 %	0 %	387504762
108	NC_017653	GCAA	2	8	43062	43069	50 %	0 %	25 %	25 %	387504762
109	NC_017653	ATTG	2	8	44061	44068	25 %	50 %	25 %	0 %	387504763
110	NC_017653	TCTT	2	8	44123	44130	0 %	75 %	0 %	25 %	387504763
111	NC_017653	TAAT	2	8	44257	44264	50 %	50 %	0 %	0 %	387504764
112	NC_017653	TTTA	2	8	44348	44355	25 %	75 %	0 %	0 %	387504764
113	NC_017653	AAAC	2	8	44531	44538	75 %	0 %	0 %	25 %	387504764
114	NC_017653	ATAA	2	8	44670	44677	75 %	25 %	0 %	0 %	387504765
115	NC_017653	TATT	2	8	44782	44789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017653	AACT	2	8	45281	45288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017653	ACAA	2	8	45876	45883	75 %	0 %	0 %	25 %	387504766
118	NC_017653	CGAC	2	8	46651	46658	25 %	0 %	25 %	50 %	387504767
119	NC_017653	AGCG	2	8	46694	46701	25 %	0 %	50 %	25 %	387504767
120	NC_017653	TTCG	2	8	46802	46809	0 %	50 %	25 %	25 %	387504767
121	NC_017653	TTTC	2	8	47257	47264	0 %	75 %	0 %	25 %	387504767
122	NC_017653	TTCA	2	8	47543	47550	25 %	50 %	0 %	25 %	387504768
123	NC_017653	TCTG	2	8	47638	47645	0 %	50 %	25 %	25 %	387504768
124	NC_017653	TTTA	2	8	47812	47819	25 %	75 %	0 %	0 %	387504768
125	NC_017653	CAAA	2	8	49775	49782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017653	TCAG	2	8	50298	50305	25 %	25 %	25 %	25 %	387504772
127	NC_017653	CTTA	2	8	50941	50948	25 %	50 %	0 %	25 %	387504773
128	NC_017653	AGAC	2	8	51494	51501	50 %	0 %	25 %	25 %	387504773
129	NC_017653	ATCA	2	8	51656	51663	50 %	25 %	0 %	25 %	387504773
130	NC_017653	CGCA	2	8	51770	51777	25 %	0 %	25 %	50 %	387504773
131	NC_017653	GGCT	2	8	52976	52983	0 %	25 %	50 %	25 %	387504774
132	NC_017653	GTCG	2	8	53165	53172	0 %	25 %	50 %	25 %	387504774
133	NC_017653	CAGG	2	8	53863	53870	25 %	0 %	50 %	25 %	387504774
134	NC_017653	GAGG	2	8	55706	55713	25 %	0 %	75 %	0 %	387504776
135	NC_017653	ATCA	2	8	56022	56029	50 %	25 %	0 %	25 %	387504776
136	NC_017653	TTTC	2	8	56033	56040	0 %	75 %	0 %	25 %	387504776
137	NC_017653	TCAG	2	8	56671	56678	25 %	25 %	25 %	25 %	387504776
138	NC_017653	GCTG	2	8	56720	56727	0 %	25 %	50 %	25 %	387504776
139	NC_017653	AGCA	2	8	57344	57351	50 %	0 %	25 %	25 %	387504777
140	NC_017653	TCCC	2	8	57401	57408	0 %	25 %	0 %	75 %	387504777
141	NC_017653	ATCG	2	8	58506	58513	25 %	25 %	25 %	25 %	387504778
142	NC_017653	CCCA	2	8	58586	58593	25 %	0 %	0 %	75 %	387504778
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.