MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	CAAT	2	8	187	194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017653	CAAT	2	8	1885	1892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017653	ATTG	2	8	1966	1973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017653	TATT	2	8	3261	3268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017653	GCCT	2	8	5194	5201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017653	GGAT	2	8	5797	5804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017653	AGTA	2	8	6600	6607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017653	ACTC	2	8	6759	6766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017653	GCTG	2	8	6991	6998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017653	TCAA	2	8	7450	7457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017653	TTAT	2	8	7667	7674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017653	TACA	2	8	7720	7727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017653	ATAG	2	8	15423	15430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017653	TAAT	2	8	19226	19233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017653	GAAA	2	8	19761	19768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017653	CAAA	2	8	19805	19812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017653	TCAT	2	8	28538	28545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017653	TTAA	2	8	28795	28802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017653	AATA	2	8	28817	28824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017653	TAGG	2	8	29767	29774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017653	TATT	2	8	44782	44789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017653	AACT	2	8	45281	45288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017653	CAAA	2	8	49775	49782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017653	GAAG	2	8	59216	59223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017653	CGTG	2	8	61182	61189	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017653	TTTG	2	8	61493	61500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017653	ATCC	2	8	65442	65449	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017653	GCCT	2	8	65487	65494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017653	AATT	2	8	76041	76048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017653	TCAC	2	8	76284	76291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017653	TCCT	2	8	78997	79004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017653	CAAT	2	8	80973	80980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.