MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	CAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017653	GCA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017653	GTG	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017653	TCA	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017653	TAC	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017653	CCG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017653	AAC	2	6	2442	2447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017653	CAA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017653	TAC	2	6	2704	2709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017653	TAA	2	6	2893	2898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017653	TCA	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017653	TTC	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017653	TAA	2	6	5137	5142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017653	ATG	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017653	AAT	2	6	5210	5215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017653	GAT	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017653	TTC	2	6	5241	5246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017653	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017653	ATC	2	6	5778	5783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017653	TGT	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017653	GCC	2	6	5872	5877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017653	TGG	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017653	GTT	2	6	5928	5933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017653	TGA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017653	ATT	2	6	6775	6780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017653	GAA	2	6	6812	6817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017653	GCT	2	6	6818	6823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017653	GTT	2	6	7106	7111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017653	ATT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017653	TAT	2	6	7237	7242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017653	TCC	2	6	7280	7285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017653	TAA	2	6	7463	7468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017653	TCC	2	6	7531	7536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017653	TCA	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017653	AAT	2	6	7561	7566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017653	ACA	2	6	7875	7880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017653	ATT	2	6	15492	15497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017653	ATT	2	6	19216	19221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017653	GGT	2	6	19772	19777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017653	TGG	2	6	19875	19880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017653	CCG	2	6	21415	21420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017653	CCT	2	6	28385	28390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017653	AGG	2	6	28399	28404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017653	AAT	2	6	28483	28488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017653	CGG	2	6	28590	28595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017653	AAG	2	6	28678	28683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017653	ACA	2	6	28728	28733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017653	AAC	2	6	28742	28747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017653	AGC	2	6	28949	28954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017653	ACA	2	6	29032	29037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017653	CAG	2	6	29064	29069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017653	AAC	2	6	29729	29734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017653	TGT	2	6	34993	34998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017653	TTC	2	6	41102	41107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017653	AGT	2	6	43275	43280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017653	TTG	2	6	43304	43309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017653	GTT	2	6	43369	43374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017653	TTA	2	6	44764	44769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017653	TAA	2	6	44805	44810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017653	CAT	2	6	44846	44851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017653	CCG	2	6	44883	44888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017653	AGC	2	6	44915	44920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017653	TGG	2	6	45001	45006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017653	CTG	2	6	45029	45034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017653	AGC	2	6	45084	45089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017653	GTT	2	6	45099	45104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017653	CAC	2	6	45192	45197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017653	GCA	2	6	45213	45218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017653	ATT	2	6	45525	45530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017653	GCA	2	6	45566	45571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017653	AGG	2	6	45582	45587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017653	TAA	2	6	46475	46480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017653	GTA	2	6	47360	47365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017653	ACC	2	6	47369	47374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017653	AGA	2	6	48583	48588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017653	GAA	2	6	49540	49545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017653	ATG	2	6	49642	49647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017653	ACC	2	6	49692	49697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017653	ATC	2	6	49726	49731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017653	GCG	2	6	49741	49746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017653	CGG	2	6	49812	49817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017653	GTT	2	6	49864	49869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017653	GCC	2	6	49966	49971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017653	CCT	3	9	50108	50116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017653	TTG	2	6	54367	54372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017653	GGA	2	6	54417	54422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017653	TGC	2	6	56782	56787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017653	ATA	2	6	56793	56798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017653	AGG	2	6	56869	56874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017653	TGA	2	6	57732	57737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017653	CCA	2	6	57835	57840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017653	CCA	2	6	57950	57955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017653	CAA	2	6	59008	59013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017653	CAA	2	6	59029	59034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017653	TCT	2	6	59124	59129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017653	TCC	2	6	60225	60230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017653	GAA	2	6	60232	60237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017653	AGT	2	6	61256	61261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017653	TCC	2	6	61294	61299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017653	TTG	2	6	61323	61328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017653	TCA	2	6	61343	61348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017653	TAA	2	6	61430	61435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017653	GTC	2	6	61503	61508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017653	TTA	2	6	64714	64719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017653	GCG	2	6	64782	64787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017653	GCG	2	6	64947	64952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017653	GAT	2	6	64986	64991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017653	TGA	2	6	64993	64998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017653	AAG	2	6	65011	65016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017653	GTC	2	6	65037	65042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017653	TCT	2	6	65181	65186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017653	TGA	2	6	65624	65629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017653	CGG	2	6	65683	65688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017653	TCA	2	6	65745	65750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017653	TGA	2	6	65820	65825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017653	AGA	2	6	65848	65853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017653	AAT	2	6	66449	66454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017653	CCA	2	6	67608	67613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017653	CGT	2	6	67645	67650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017653	TGT	2	6	67736	67741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017653	TGA	2	6	67824	67829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017653	GAT	2	6	75080	75085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017653	TTG	2	6	75107	75112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017653	ATT	2	6	75136	75141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017653	TTC	2	6	75187	75192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017653	ATA	2	6	76035	76040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017653	AAT	2	6	76093	76098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017653	TGC	2	6	76304	76309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017653	ATC	2	6	76332	76337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017653	GCT	2	6	76551	76556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017653	AGT	2	6	76571	76576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017653	CAG	2	6	76683	76688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017653	TAA	2	6	78764	78769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017653	TCA	2	6	78798	78803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017653	ACT	2	6	78862	78867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017653	CGG	2	6	78893	78898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017653	TCA	2	6	78910	78915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017653	CAA	2	6	78926	78931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017653	TGG	2	6	80344	80349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017653	CCA	2	6	80357	80362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017653	GAG	2	6	80381	80386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.