MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	CG	3	6	313	318	0 %	0 %	50 %	50 %	387504722
2	NC_017653	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	387504723
3	NC_017653	CG	3	6	1320	1325	0 %	0 %	50 %	50 %	387504723
4	NC_017653	AG	3	6	2797	2802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017653	TA	3	6	2978	2983	50 %	50 %	0 %	0 %	387504725
6	NC_017653	GT	4	8	4909	4916	0 %	50 %	50 %	0 %	387504727
7	NC_017653	TG	3	6	5084	5089	0 %	50 %	50 %	0 %	387504727
8	NC_017653	AT	3	6	5724	5729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017653	TA	3	6	6617	6622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017653	AT	3	6	6919	6924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017653	GA	3	6	6999	7004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017653	AG	3	6	7477	7482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017653	CT	3	6	7839	7844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017653	TA	3	6	7905	7910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017653	TC	3	6	8206	8211	0 %	50 %	0 %	50 %	387504731
16	NC_017653	GC	4	8	9425	9432	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
17	NC_017653	GC	3	6	9799	9804	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
18	NC_017653	GC	3	6	10113	10118	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
19	NC_017653	GA	3	6	10357	10362	50 %	0 %	50 %	0 %	387504732
20	NC_017653	CG	3	6	10397	10402	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
21	NC_017653	TG	3	6	10427	10432	0 %	50 %	50 %	0 %	387504732
22	NC_017653	CG	3	6	12381	12386	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
23	NC_017653	GC	4	8	13863	13870	0 %	0 %	50 %	50 %	387504732
24	NC_017653	CA	4	8	14774	14781	50 %	0 %	0 %	50 %	387504732
25	NC_017653	GT	3	6	14872	14877	0 %	50 %	50 %	0 %	387504732
26	NC_017653	GT	3	6	15160	15165	0 %	50 %	50 %	0 %	387504732
27	NC_017653	CT	3	6	15857	15862	0 %	50 %	0 %	50 %	387504733
28	NC_017653	TG	3	6	15945	15950	0 %	50 %	50 %	0 %	387504733
29	NC_017653	GC	3	6	16534	16539	0 %	0 %	50 %	50 %	387504733
30	NC_017653	GC	3	6	16789	16794	0 %	0 %	50 %	50 %	387504733
31	NC_017653	AT	3	6	18303	18308	50 %	50 %	0 %	0 %	387504735
32	NC_017653	CG	3	6	18317	18322	0 %	0 %	50 %	50 %	387504735
33	NC_017653	GT	3	6	18894	18899	0 %	50 %	50 %	0 %	387504737
34	NC_017653	TA	3	6	19321	19326	50 %	50 %	0 %	0 %	387504738
35	NC_017653	GC	3	6	21110	21115	0 %	0 %	50 %	50 %	387504740
36	NC_017653	GC	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	387504742
37	NC_017653	TG	3	6	24015	24020	0 %	50 %	50 %	0 %	387504742
38	NC_017653	GC	3	6	24406	24411	0 %	0 %	50 %	50 %	387504742
39	NC_017653	CG	3	6	24505	24510	0 %	0 %	50 %	50 %	387504742
40	NC_017653	GC	3	6	26115	26120	0 %	0 %	50 %	50 %	387504744
41	NC_017653	CG	5	10	26677	26686	0 %	0 %	50 %	50 %	387504744
42	NC_017653	AT	3	6	27403	27408	50 %	50 %	0 %	0 %	387504745
43	NC_017653	AT	3	6	27763	27768	50 %	50 %	0 %	0 %	387504746
44	NC_017653	TG	3	6	28365	28370	0 %	50 %	50 %	0 %	387504747
45	NC_017653	CA	4	8	28778	28785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017653	CG	3	6	29096	29101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017653	TC	3	6	29359	29364	0 %	50 %	0 %	50 %	387504748
48	NC_017653	AC	3	6	29700	29705	50 %	0 %	0 %	50 %	387504748
49	NC_017653	AT	3	6	31849	31854	50 %	50 %	0 %	0 %	387504753
50	NC_017653	GA	3	6	32112	32117	50 %	0 %	50 %	0 %	387504753
51	NC_017653	CA	3	6	32266	32271	50 %	0 %	0 %	50 %	387504753
52	NC_017653	TA	3	6	32291	32296	50 %	50 %	0 %	0 %	387504753
53	NC_017653	AG	3	6	34247	34252	50 %	0 %	50 %	0 %	387504754
54	NC_017653	GC	3	6	34912	34917	0 %	0 %	50 %	50 %	387504755
55	NC_017653	AT	3	6	35544	35549	50 %	50 %	0 %	0 %	387504756
56	NC_017653	TG	3	6	37337	37342	0 %	50 %	50 %	0 %	387504758
57	NC_017653	AT	3	6	39568	39573	50 %	50 %	0 %	0 %	387504759
58	NC_017653	AC	3	6	40916	40921	50 %	0 %	0 %	50 %	387504759
59	NC_017653	GA	3	6	40925	40930	50 %	0 %	50 %	0 %	387504759
60	NC_017653	TG	3	6	41399	41404	0 %	50 %	50 %	0 %	387504760
61	NC_017653	AG	3	6	42760	42765	50 %	0 %	50 %	0 %	387504762
62	NC_017653	GT	3	6	43255	43260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017653	AT	4	8	43656	43663	50 %	50 %	0 %	0 %	387504763
64	NC_017653	AT	3	6	43709	43714	50 %	50 %	0 %	0 %	387504763
65	NC_017653	AG	3	6	43726	43731	50 %	0 %	50 %	0 %	387504763
66	NC_017653	AT	4	8	43813	43820	50 %	50 %	0 %	0 %	387504763
67	NC_017653	AG	3	6	43844	43849	50 %	0 %	50 %	0 %	387504763
68	NC_017653	GC	3	6	45899	45904	0 %	0 %	50 %	50 %	387504766
69	NC_017653	GC	3	6	46205	46210	0 %	0 %	50 %	50 %	387504766
70	NC_017653	AT	3	6	46582	46587	50 %	50 %	0 %	0 %	387504767
71	NC_017653	AC	3	6	47465	47470	50 %	0 %	0 %	50 %	387504768
72	NC_017653	GA	3	6	48876	48881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017653	GT	3	6	48897	48902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017653	TA	3	6	49532	49537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017653	AT	3	6	49981	49986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017653	CG	3	6	51887	51892	0 %	0 %	50 %	50 %	387504773
77	NC_017653	GT	4	8	51978	51985	0 %	50 %	50 %	0 %	387504773
78	NC_017653	AG	3	6	53487	53492	50 %	0 %	50 %	0 %	387504774
79	NC_017653	AC	3	6	53713	53718	50 %	0 %	0 %	50 %	387504774
80	NC_017653	CG	3	6	54171	54176	0 %	0 %	50 %	50 %	387504774
81	NC_017653	TG	3	6	54326	54331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017653	CG	3	6	55606	55611	0 %	0 %	50 %	50 %	387504776
83	NC_017653	CT	3	6	56085	56090	0 %	50 %	0 %	50 %	387504776
84	NC_017653	AC	3	6	56378	56383	50 %	0 %	0 %	50 %	387504776
85	NC_017653	AT	3	6	56460	56465	50 %	50 %	0 %	0 %	387504776
86	NC_017653	AC	3	6	57059	57064	50 %	0 %	0 %	50 %	387504777
87	NC_017653	AG	3	6	58448	58453	50 %	0 %	50 %	0 %	387504778
88	NC_017653	AC	3	6	58767	58772	50 %	0 %	0 %	50 %	387504778
89	NC_017653	TG	3	6	58907	58912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017653	CT	3	6	61268	61273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017653	TG	3	6	61399	61404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017653	GC	3	6	62209	62214	0 %	0 %	50 %	50 %	387504784
93	NC_017653	CA	3	6	62441	62446	50 %	0 %	0 %	50 %	387504784
94	NC_017653	GC	3	6	62973	62978	0 %	0 %	50 %	50 %	387504785
95	NC_017653	GC	3	6	64578	64583	0 %	0 %	50 %	50 %	387504785
96	NC_017653	GC	3	6	66092	66097	0 %	0 %	50 %	50 %	387504786
97	NC_017653	TA	3	6	66509	66514	50 %	50 %	0 %	0 %	387504787
98	NC_017653	CT	3	6	67184	67189	0 %	50 %	0 %	50 %	387504788
99	NC_017653	GC	3	6	67315	67320	0 %	0 %	50 %	50 %	387504788
100	NC_017653	CG	3	6	68230	68235	0 %	0 %	50 %	50 %	387504789
101	NC_017653	TG	3	6	70039	70044	0 %	50 %	50 %	0 %	387504790
102	NC_017653	CG	3	6	70246	70251	0 %	0 %	50 %	50 %	387504790
103	NC_017653	AG	3	6	71535	71540	50 %	0 %	50 %	0 %	387504792
104	NC_017653	AT	3	6	73033	73038	50 %	50 %	0 %	0 %	387504794
105	NC_017653	GC	3	6	73816	73821	0 %	0 %	50 %	50 %	387504795
106	NC_017653	CG	3	6	74549	74554	0 %	0 %	50 %	50 %	387504795
107	NC_017653	CA	3	6	74937	74942	50 %	0 %	0 %	50 %	387504796
108	NC_017653	AG	3	6	75896	75901	50 %	0 %	50 %	0 %	387504798
109	NC_017653	GC	3	6	76627	76632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017653	CG	3	6	76839	76844	0 %	0 %	50 %	50 %	387504801
111	NC_017653	GC	3	6	77869	77874	0 %	0 %	50 %	50 %	387504802
112	NC_017653	GC	3	6	78616	78621	0 %	0 %	50 %	50 %	387504803
113	NC_017653	CG	3	6	79664	79669	0 %	0 %	50 %	50 %	387504804
114	NC_017653	TG	3	6	81493	81498	0 %	50 %	50 %	0 %	387504806
115	NC_017653	GA	3	6	82893	82898	50 %	0 %	50 %	0 %	387504809
116	NC_017653	CA	3	6	83695	83700	50 %	0 %	0 %	50 %	387504811
117	NC_017653	AC	3	6	84300	84305	50 %	0 %	0 %	50 %	387504812
118	NC_017653	TA	3	6	85060	85065	50 %	50 %	0 %	0 %	387504814
119	NC_017653	GC	3	6	86569	86574	0 %	0 %	50 %	50 %	387504817
120	NC_017653	GC	3	6	86714	86719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017653	TG	3	6	86983	86988	0 %	50 %	50 %	0 %	387504818
122	NC_017653	CG	3	6	87283	87288	0 %	0 %	50 %	50 %	387504819
123	NC_017653	AT	3	6	87488	87493	50 %	50 %	0 %	0 %	387504820
124	NC_017653	AT	3	6	87677	87682	50 %	50 %	0 %	0 %	387504820
125	NC_017653	GC	3	6	88944	88949	0 %	0 %	50 %	50 %	387504822
126	NC_017653	CT	3	6	89462	89467	0 %	50 %	0 %	50 %	387504823
127	NC_017653	CG	4	8	90214	90221	0 %	0 %	50 %	50 %	387504824
128	NC_017653	CG	3	6	90727	90732	0 %	0 %	50 %	50 %	387504824
129	NC_017653	GC	3	6	92127	92132	0 %	0 %	50 %	50 %	387504825
130	NC_017653	GC	3	6	92451	92456	0 %	0 %	50 %	50 %	387504826
131	NC_017653	AT	3	6	92590	92595	50 %	50 %	0 %	0 %	387504826
132	NC_017653	AC	3	6	92715	92720	50 %	0 %	0 %	50 %	387504826
133	NC_017653	CA	3	6	92721	92726	50 %	0 %	0 %	50 %	387504826
134	NC_017653	TG	3	6	93712	93717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017653	TC	3	6	93926	93931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.