MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	A	6	6	325	330	100 %	0 %	0 %	0 %	387504722
2	NC_017653	A	6	6	1164	1169	100 %	0 %	0 %	0 %	387504723
3	NC_017653	A	7	7	1828	1834	100 %	0 %	0 %	0 %	387504724
4	NC_017653	A	6	6	1926	1931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017653	T	6	6	4647	4652	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
6	NC_017653	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
7	NC_017653	T	6	6	5059	5064	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
8	NC_017653	A	6	6	5348	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	387504728
9	NC_017653	T	6	6	5892	5897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017653	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	387504729
11	NC_017653	A	7	7	7423	7429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017653	A	6	6	7467	7472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017653	T	6	6	7583	7588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017653	A	7	7	7603	7609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017653	A	6	6	7714	7719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017653	T	6	6	8453	8458	0 %	100 %	0 %	0 %	387504731
17	NC_017653	T	6	6	9601	9606	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
18	NC_017653	T	6	6	11305	11310	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
19	NC_017653	T	6	6	11953	11958	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
20	NC_017653	A	6	6	17079	17084	100 %	0 %	0 %	0 %	387504733
21	NC_017653	T	6	6	19104	19109	0 %	100 %	0 %	0 %	387504737
22	NC_017653	A	6	6	19750	19755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017653	T	6	6	20059	20064	0 %	100 %	0 %	0 %	387504739
24	NC_017653	A	6	6	20194	20199	100 %	0 %	0 %	0 %	387504739
25	NC_017653	A	6	6	20537	20542	100 %	0 %	0 %	0 %	387504739
26	NC_017653	A	6	6	20740	20745	100 %	0 %	0 %	0 %	387504740
27	NC_017653	A	7	7	21406	21412	100 %	0 %	0 %	0 %	387504740
28	NC_017653	T	6	6	23112	23117	0 %	100 %	0 %	0 %	387504742
29	NC_017653	T	6	6	23219	23224	0 %	100 %	0 %	0 %	387504742
30	NC_017653	T	6	6	25464	25469	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
31	NC_017653	T	6	6	26374	26379	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
32	NC_017653	T	6	6	26500	26505	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
33	NC_017653	T	6	6	28716	28721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017653	A	6	6	28955	28960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017653	A	6	6	28978	28983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017653	A	6	6	29410	29415	100 %	0 %	0 %	0 %	387504748
37	NC_017653	G	7	7	31614	31620	0 %	0 %	100 %	0 %	387504752
38	NC_017653	G	6	6	31704	31709	0 %	0 %	100 %	0 %	387504752
39	NC_017653	T	6	6	33931	33936	0 %	100 %	0 %	0 %	387504754
40	NC_017653	A	6	6	35691	35696	100 %	0 %	0 %	0 %	387504756
41	NC_017653	T	6	6	36038	36043	0 %	100 %	0 %	0 %	387504757
42	NC_017653	T	6	6	38526	38531	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
43	NC_017653	C	6	6	39712	39717	0 %	0 %	0 %	100 %	387504759
44	NC_017653	T	6	6	40032	40037	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
45	NC_017653	A	7	7	40278	40284	100 %	0 %	0 %	0 %	387504759
46	NC_017653	T	7	7	40488	40494	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
47	NC_017653	T	6	6	40637	40642	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
48	NC_017653	T	6	6	40737	40742	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
49	NC_017653	T	6	6	41056	41061	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
50	NC_017653	G	6	6	43313	43318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017653	T	7	7	43409	43415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017653	T	7	7	43575	43581	0 %	100 %	0 %	0 %	387504763
53	NC_017653	T	7	7	43828	43834	0 %	100 %	0 %	0 %	387504763
54	NC_017653	T	6	6	44371	44376	0 %	100 %	0 %	0 %	387504764
55	NC_017653	A	8	8	44752	44759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017653	A	6	6	45186	45191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017653	G	6	6	45338	45343	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017653	A	6	6	45350	45355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017653	A	6	6	45620	45625	100 %	0 %	0 %	0 %	387504766
60	NC_017653	A	6	6	45777	45782	100 %	0 %	0 %	0 %	387504766
61	NC_017653	A	6	6	46397	46402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017653	A	6	6	46549	46554	100 %	0 %	0 %	0 %	387504767
63	NC_017653	A	6	6	47011	47016	100 %	0 %	0 %	0 %	387504767
64	NC_017653	T	6	6	47821	47826	0 %	100 %	0 %	0 %	387504768
65	NC_017653	A	7	7	47906	47912	100 %	0 %	0 %	0 %	387504768
66	NC_017653	A	6	6	47954	47959	100 %	0 %	0 %	0 %	387504768
67	NC_017653	A	6	6	48014	48019	100 %	0 %	0 %	0 %	387504768
68	NC_017653	T	6	6	48291	48296	0 %	100 %	0 %	0 %	387504769
69	NC_017653	A	7	7	48507	48513	100 %	0 %	0 %	0 %	387504769
70	NC_017653	A	6	6	48937	48942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017653	T	6	6	50198	50203	0 %	100 %	0 %	0 %	387504772
72	NC_017653	T	6	6	50234	50239	0 %	100 %	0 %	0 %	387504772
73	NC_017653	A	6	6	50915	50920	100 %	0 %	0 %	0 %	387504772
74	NC_017653	T	6	6	51839	51844	0 %	100 %	0 %	0 %	387504773
75	NC_017653	T	6	6	52646	52651	0 %	100 %	0 %	0 %	387504774
76	NC_017653	T	7	7	54392	54398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017653	T	7	7	54400	54406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017653	A	6	6	56879	56884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017653	A	6	6	57093	57098	100 %	0 %	0 %	0 %	387504777
80	NC_017653	T	6	6	58052	58057	0 %	100 %	0 %	0 %	387504778
81	NC_017653	A	6	6	59403	59408	100 %	0 %	0 %	0 %	387504779
82	NC_017653	T	6	6	61010	61015	0 %	100 %	0 %	0 %	387504782
83	NC_017653	T	6	6	61442	61447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017653	A	6	6	62041	62046	100 %	0 %	0 %	0 %	387504784
85	NC_017653	A	6	6	62864	62869	100 %	0 %	0 %	0 %	387504785
86	NC_017653	A	6	6	63674	63679	100 %	0 %	0 %	0 %	387504785
87	NC_017653	T	7	7	64912	64918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017653	A	6	6	65050	65055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017653	T	6	6	66435	66440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017653	T	6	6	66652	66657	0 %	100 %	0 %	0 %	387504787
91	NC_017653	A	6	6	66662	66667	100 %	0 %	0 %	0 %	387504787
92	NC_017653	A	7	7	66686	66692	100 %	0 %	0 %	0 %	387504787
93	NC_017653	A	6	6	67257	67262	100 %	0 %	0 %	0 %	387504788
94	NC_017653	G	6	6	67673	67678	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017653	A	6	6	70261	70266	100 %	0 %	0 %	0 %	387504790
96	NC_017653	C	6	6	70379	70384	0 %	0 %	0 %	100 %	387504791
97	NC_017653	T	6	6	70582	70587	0 %	100 %	0 %	0 %	387504791
98	NC_017653	T	6	6	71371	71376	0 %	100 %	0 %	0 %	387504792
99	NC_017653	T	6	6	72690	72695	0 %	100 %	0 %	0 %	387504793
100	NC_017653	T	6	6	73588	73593	0 %	100 %	0 %	0 %	387504795
101	NC_017653	T	7	7	73681	73687	0 %	100 %	0 %	0 %	387504795
102	NC_017653	T	6	6	73732	73737	0 %	100 %	0 %	0 %	387504795
103	NC_017653	T	6	6	74146	74151	0 %	100 %	0 %	0 %	387504795
104	NC_017653	T	6	6	74773	74778	0 %	100 %	0 %	0 %	387504796
105	NC_017653	A	6	6	75770	75775	100 %	0 %	0 %	0 %	387504798
106	NC_017653	T	6	6	76261	76266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017653	A	6	6	76315	76320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017653	A	6	6	76704	76709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017653	T	6	6	76900	76905	0 %	100 %	0 %	0 %	387504801
110	NC_017653	A	6	6	77062	77067	100 %	0 %	0 %	0 %	387504801
111	NC_017653	A	6	6	77260	77265	100 %	0 %	0 %	0 %	387504801
112	NC_017653	T	6	6	78732	78737	0 %	100 %	0 %	0 %	387504803
113	NC_017653	T	6	6	78806	78811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017653	T	7	7	79191	79197	0 %	100 %	0 %	0 %	387504804
115	NC_017653	A	7	7	79636	79642	100 %	0 %	0 %	0 %	387504804
116	NC_017653	A	6	6	79684	79689	100 %	0 %	0 %	0 %	387504804
117	NC_017653	T	7	7	80366	80372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017653	A	6	6	81569	81574	100 %	0 %	0 %	0 %	387504807
119	NC_017653	A	6	6	82755	82760	100 %	0 %	0 %	0 %	387504809
120	NC_017653	A	6	6	83476	83481	100 %	0 %	0 %	0 %	387504810
121	NC_017653	A	6	6	83867	83872	100 %	0 %	0 %	0 %	387504811
122	NC_017653	T	6	6	83892	83897	0 %	100 %	0 %	0 %	387504811
123	NC_017653	A	7	7	85834	85840	100 %	0 %	0 %	0 %	387504815
124	NC_017653	A	7	7	86665	86671	100 %	0 %	0 %	0 %	387504817
125	NC_017653	A	6	6	87401	87406	100 %	0 %	0 %	0 %	387504819
126	NC_017653	T	6	6	88271	88276	0 %	100 %	0 %	0 %	387504822
127	NC_017653	T	7	7	91308	91314	0 %	100 %	0 %	0 %	387504825
128	NC_017653	A	6	6	92281	92286	100 %	0 %	0 %	0 %	387504825
129	NC_017653	T	7	7	92560	92566	0 %	100 %	0 %	0 %	387504826
130	NC_017653	T	7	7	93226	93232	0 %	100 %	0 %	0 %	387504826

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.