MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 plasmid p12579_1

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017653	A	6	6	325	330	100 %	0 %	0 %	0 %	387504722
2	NC_017653	A	6	6	1164	1169	100 %	0 %	0 %	0 %	387504723
3	NC_017653	A	7	7	1828	1834	100 %	0 %	0 %	0 %	387504724
4	NC_017653	T	6	6	4647	4652	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
5	NC_017653	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
6	NC_017653	T	6	6	5059	5064	0 %	100 %	0 %	0 %	387504727
7	NC_017653	A	6	6	5348	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	387504728
8	NC_017653	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	387504729
9	NC_017653	T	6	6	8453	8458	0 %	100 %	0 %	0 %	387504731
10	NC_017653	T	6	6	9601	9606	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
11	NC_017653	T	6	6	11305	11310	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
12	NC_017653	T	6	6	11953	11958	0 %	100 %	0 %	0 %	387504732
13	NC_017653	A	6	6	17079	17084	100 %	0 %	0 %	0 %	387504733
14	NC_017653	T	6	6	19104	19109	0 %	100 %	0 %	0 %	387504737
15	NC_017653	T	6	6	20059	20064	0 %	100 %	0 %	0 %	387504739
16	NC_017653	A	6	6	20194	20199	100 %	0 %	0 %	0 %	387504739
17	NC_017653	A	6	6	20537	20542	100 %	0 %	0 %	0 %	387504739
18	NC_017653	A	6	6	20740	20745	100 %	0 %	0 %	0 %	387504740
19	NC_017653	A	7	7	21406	21412	100 %	0 %	0 %	0 %	387504740
20	NC_017653	T	6	6	23112	23117	0 %	100 %	0 %	0 %	387504742
21	NC_017653	T	6	6	23219	23224	0 %	100 %	0 %	0 %	387504742
22	NC_017653	T	6	6	25464	25469	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
23	NC_017653	T	6	6	26374	26379	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
24	NC_017653	T	6	6	26500	26505	0 %	100 %	0 %	0 %	387504744
25	NC_017653	A	6	6	29410	29415	100 %	0 %	0 %	0 %	387504748
26	NC_017653	G	7	7	31614	31620	0 %	0 %	100 %	0 %	387504752
27	NC_017653	G	6	6	31704	31709	0 %	0 %	100 %	0 %	387504752
28	NC_017653	T	6	6	33931	33936	0 %	100 %	0 %	0 %	387504754
29	NC_017653	A	6	6	35691	35696	100 %	0 %	0 %	0 %	387504756
30	NC_017653	T	6	6	36038	36043	0 %	100 %	0 %	0 %	387504757
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32	NC_017653	C	6	6	39712	39717	0 %	0 %	0 %	100 %	387504759
33	NC_017653	T	6	6	40032	40037	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
34	NC_017653	A	7	7	40278	40284	100 %	0 %	0 %	0 %	387504759
35	NC_017653	T	7	7	40488	40494	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
36	NC_017653	T	6	6	40637	40642	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
37	NC_017653	T	6	6	40737	40742	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
38	NC_017653	T	6	6	41056	41061	0 %	100 %	0 %	0 %	387504759
39	NC_017653	T	7	7	43575	43581	0 %	100 %	0 %	0 %	387504763
40	NC_017653	T	7	7	43828	43834	0 %	100 %	0 %	0 %	387504763
41	NC_017653	T	6	6	44371	44376	0 %	100 %	0 %	0 %	387504764
42	NC_017653	A	6	6	45620	45625	100 %	0 %	0 %	0 %	387504766
43	NC_017653	A	6	6	45777	45782	100 %	0 %	0 %	0 %	387504766
44	NC_017653	A	6	6	46549	46554	100 %	0 %	0 %	0 %	387504767
45	NC_017653	A	6	6	47011	47016	100 %	0 %	0 %	0 %	387504767
46	NC_017653	T	6	6	47821	47826	0 %	100 %	0 %	0 %	387504768
47	NC_017653	A	7	7	47906	47912	100 %	0 %	0 %	0 %	387504768
48	NC_017653	A	6	6	47954	47959	100 %	0 %	0 %	0 %	387504768
49	NC_017653	A	6	6	48014	48019	100 %	0 %	0 %	0 %	387504768
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.