MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10C

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017649	GGT	2	6	78	83	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017649	CAG	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017649	GCT	2	6	253	258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017649	GCG	2	6	614	619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017649	CGC	2	6	726	731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017649	CTG	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017649	TCG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017649	AGT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017649	TGT	3	9	1197	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017649	GTT	2	6	1219	1224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017649	GGT	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017649	AAT	2	6	1423	1428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017649	TGT	2	6	1526	1531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017649	CGT	2	6	1578	1583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017649	CGA	2	6	1584	1589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017649	GCT	2	6	1716	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017649	ATA	2	6	2134	2139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622391
18	NC_017649	GCT	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622391
19	NC_017649	TTA	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
20	NC_017649	ATT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
21	NC_017649	TAT	2	6	2664	2669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
22	NC_017649	TGA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622391
23	NC_017649	GTT	2	6	2970	2975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622391
24	NC_017649	GGT	2	6	2983	2988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622391
25	NC_017649	TCT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386622391
26	NC_017649	TTG	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622391
27	NC_017649	TTA	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392
28	NC_017649	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392
29	NC_017649	AAT	2	6	3418	3423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
30	NC_017649	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622392
31	NC_017649	TGA	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
32	NC_017649	ATG	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
33	NC_017649	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
34	NC_017649	AAC	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622392
35	NC_017649	AAG	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622392
36	NC_017649	GAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
37	NC_017649	GAG	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386622392
38	NC_017649	ACG	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622392
39	NC_017649	ATA	3	9	4001	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
40	NC_017649	AAT	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
41	NC_017649	TGT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622392
42	NC_017649	ATT	2	6	4160	4165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.