MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10B

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017648	GTT	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017648	TGA	2	6	58	63	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017648	TTG	2	6	102	107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017648	ATT	3	9	363	371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017648	GTT	2	6	390	395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017648	TTG	2	6	419	424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017648	GTT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017648	GAA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627432
9	NC_017648	GAT	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627432
10	NC_017648	CAG	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627432
11	NC_017648	CGT	2	6	1532	1537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627432
12	NC_017648	GCA	2	6	1854	1859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627432
13	NC_017648	AGC	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017648	TGG	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017648	CGC	2	6	2084	2089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017648	CGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017648	AAT	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017648	TGA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017648	TTC	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017648	CGG	2	6	2624	2629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017648	TCG	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017648	TGG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627433
23	NC_017648	GGC	2	6	2903	2908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627433
24	NC_017648	CGG	2	6	3080	3085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627433
25	NC_017648	ATG	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
26	NC_017648	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
27	NC_017648	ACG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627433
28	NC_017648	TGA	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
29	NC_017648	CAT	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627433
30	NC_017648	ATG	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
31	NC_017648	AGA	2	6	3676	3681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627434
32	NC_017648	ACA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627434
33	NC_017648	GCG	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627434
34	NC_017648	TGG	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627434
35	NC_017648	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017648	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017648	ATG	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017648	TAT	2	6	4488	4493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017648	TAT	2	6	4521	4526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017648	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017648	TTA	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017648	GTT	3	9	4754	4762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.