MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	GAGATG	2	12	7170	7181	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386627447
2	NC_017647	GCGAAG	2	12	7717	7728	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386627447
3	NC_017647	CTGGCG	2	12	9929	9940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386627449
4	NC_017647	CTGCGT	2	12	11921	11932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627451
5	NC_017647	TTCTGG	2	12	13142	13153	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386627452
6	NC_017647	TAACGG	2	12	16738	16749	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386627458
7	NC_017647	TCTTTT	2	12	23421	23432	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386627464
8	NC_017647	CAATAA	2	12	27529	27540	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386627468
9	NC_017647	TCAGGT	2	12	28545	28556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386627470
10	NC_017647	GCAGAA	2	12	31293	31304	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386627475
11	NC_017647	TAAGAA	2	12	31837	31848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386627476
12	NC_017647	AATAAA	2	12	36255	36266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386627478
13	NC_017647	TATCCA	2	12	39319	39330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627480
14	NC_017647	GTGTCA	2	12	39517	39528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386627480
15	NC_017647	GACAGC	2	12	43718	43729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627484
16	NC_017647	GGAAAA	2	12	47295	47306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627490
17	NC_017647	TGGGGA	2	12	49588	49599	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386627494
18	NC_017647	GCAGAA	2	12	52885	52896	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386627498

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.