MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	CCTGT	2	10	2589	2598	0 %	40 %	20 %	40 %	386627440
2	NC_017647	GCCCC	2	10	2744	2753	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_017647	TGCTC	2	10	3744	3753	0 %	40 %	20 %	40 %	386627442
4	NC_017647	AGGCC	2	10	3933	3942	20 %	0 %	40 %	40 %	386627442
5	NC_017647	ATCTG	2	10	4378	4387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017647	GCTGC	2	10	10792	10801	0 %	20 %	40 %	40 %	386627450
7	NC_017647	CCCGG	2	10	11832	11841	0 %	0 %	40 %	60 %	386627450
8	NC_017647	GTAAC	2	10	16707	16716	40 %	20 %	20 %	20 %	386627458
9	NC_017647	CTGAA	2	10	21439	21448	40 %	20 %	20 %	20 %	386627463
10	NC_017647	CGTTA	2	10	21886	21895	20 %	40 %	20 %	20 %	386627463
11	NC_017647	GTCTG	2	10	22018	22027	0 %	40 %	40 %	20 %	386627463
12	NC_017647	AAATT	2	10	22943	22952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017647	TACAC	2	10	25703	25712	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017647	CGGCC	2	10	29525	29534	0 %	0 %	40 %	60 %	386627472
15	NC_017647	ATCCC	2	10	31803	31812	20 %	20 %	0 %	60 %	386627476
16	NC_017647	TAACT	2	10	32365	32374	40 %	40 %	0 %	20 %	386627476
17	NC_017647	CTGTG	2	10	32840	32849	0 %	40 %	40 %	20 %	386627476
18	NC_017647	TCTAT	2	10	34582	34591	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017647	TAAAA	2	10	35088	35097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017647	CAAGT	2	10	35674	35683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017647	CATAA	3	15	37198	37212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017647	CATAA	2	10	38378	38387	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017647	AAGGA	2	10	40679	40688	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017647	GTAAT	2	10	40954	40963	40 %	40 %	20 %	0 %	386627483
25	NC_017647	TCAGC	2	10	41434	41443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017647	TACCA	2	10	41671	41680	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017647	CTTCC	2	10	45984	45993	0 %	40 %	0 %	60 %	386627488
28	NC_017647	ATGTG	2	10	46091	46100	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017647	TGATG	2	10	46734	46743	20 %	40 %	40 %	0 %	386627489
30	NC_017647	ACCTG	2	10	49046	49055	20 %	20 %	20 %	40 %	386627493
31	NC_017647	TCTGG	2	10	49383	49392	0 %	40 %	40 %	20 %	386627494
32	NC_017647	CCGGG	2	10	53853	53862	0 %	0 %	60 %	40 %	386627500
33	NC_017647	AAAAC	2	10	54049	54058	80 %	0 %	0 %	20 %	386627501

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.