MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	GCCA	2	8	418	425	25 %	0 %	25 %	50 %	386627437
2	NC_017647	AGGC	2	8	475	482	25 %	0 %	50 %	25 %	386627437
3	NC_017647	GAAA	2	8	1052	1059	75 %	0 %	25 %	0 %	386627438
4	NC_017647	TGGC	2	8	1156	1163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017647	GCTC	2	8	1355	1362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017647	TACC	2	8	1780	1787	25 %	25 %	0 %	50 %	386627439
7	NC_017647	CCGA	2	8	1823	1830	25 %	0 %	25 %	50 %	386627439
8	NC_017647	AAAC	2	8	1918	1925	75 %	0 %	0 %	25 %	386627439
9	NC_017647	CAGA	2	8	2015	2022	50 %	0 %	25 %	25 %	386627439
10	NC_017647	CATT	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	386627440
11	NC_017647	GACA	2	8	2600	2607	50 %	0 %	25 %	25 %	386627440
12	NC_017647	CTGG	2	8	2828	2835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017647	ATCA	2	8	3003	3010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017647	GCTG	2	8	3405	3412	0 %	25 %	50 %	25 %	386627442
15	NC_017647	CTGG	2	8	4073	4080	0 %	25 %	50 %	25 %	386627443
16	NC_017647	CAGC	2	8	4348	4355	25 %	0 %	25 %	50 %	386627443
17	NC_017647	CAGA	2	8	4570	4577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017647	GAAA	2	8	4789	4796	75 %	0 %	25 %	0 %	386627444
19	NC_017647	GCTG	2	8	4831	4838	0 %	25 %	50 %	25 %	386627445
20	NC_017647	TGAA	2	8	5488	5495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017647	CTGC	2	8	6348	6355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017647	GCCT	2	8	6408	6415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017647	TTGA	2	8	6696	6703	25 %	50 %	25 %	0 %	386627447
24	NC_017647	CGCT	2	8	6907	6914	0 %	25 %	25 %	50 %	386627447
25	NC_017647	CTGG	2	8	8045	8052	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
26	NC_017647	CTGG	2	8	8246	8253	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
27	NC_017647	GCTG	2	8	8416	8423	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
28	NC_017647	ATGA	2	8	8695	8702	50 %	25 %	25 %	0 %	386627448
29	NC_017647	GGGC	2	8	9538	9545	0 %	0 %	75 %	25 %	386627449
30	NC_017647	GGCG	2	8	9625	9632	0 %	0 %	75 %	25 %	386627449
31	NC_017647	TGGT	2	8	9965	9972	0 %	50 %	50 %	0 %	386627449
32	NC_017647	GCCT	2	8	10223	10230	0 %	25 %	25 %	50 %	386627449
33	NC_017647	GAGG	2	8	10588	10595	25 %	0 %	75 %	0 %	386627449
34	NC_017647	TTGA	2	8	10771	10778	25 %	50 %	25 %	0 %	386627450
35	NC_017647	GGAG	2	8	10941	10948	25 %	0 %	75 %	0 %	386627450
36	NC_017647	TCAG	2	8	10976	10983	25 %	25 %	25 %	25 %	386627450
37	NC_017647	GCTG	2	8	11679	11686	0 %	25 %	50 %	25 %	386627450
38	NC_017647	GGCG	2	8	11913	11920	0 %	0 %	75 %	25 %	386627451
39	NC_017647	GACG	2	8	14628	14635	25 %	0 %	50 %	25 %	386627454
40	NC_017647	TGGC	2	8	15074	15081	0 %	25 %	50 %	25 %	386627455
41	NC_017647	GCCA	2	8	16183	16190	25 %	0 %	25 %	50 %	386627457
42	NC_017647	CAGT	2	8	16797	16804	25 %	25 %	25 %	25 %	386627458
43	NC_017647	ATAC	2	8	16959	16966	50 %	25 %	0 %	25 %	386627458
44	NC_017647	TGGG	2	8	17103	17110	0 %	25 %	75 %	0 %	386627458
45	NC_017647	CCAC	2	8	17352	17359	25 %	0 %	0 %	75 %	386627459
46	NC_017647	ATAC	2	8	17532	17539	50 %	25 %	0 %	25 %	386627459
47	NC_017647	GTAA	2	8	17719	17726	50 %	25 %	25 %	0 %	386627459
48	NC_017647	CCAC	2	8	17733	17740	25 %	0 %	0 %	75 %	386627459
49	NC_017647	TTCC	2	8	17898	17905	0 %	50 %	0 %	50 %	386627459
50	NC_017647	TCTT	2	8	17975	17982	0 %	75 %	0 %	25 %	386627459
51	NC_017647	GGAT	2	8	18596	18603	25 %	25 %	50 %	0 %	386627461
52	NC_017647	ACAA	2	8	19066	19073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017647	CATC	2	8	19843	19850	25 %	25 %	0 %	50 %	386627462
54	NC_017647	TATT	2	8	20211	20218	25 %	75 %	0 %	0 %	386627462
55	NC_017647	TGGG	2	8	20611	20618	0 %	25 %	75 %	0 %	386627463
56	NC_017647	TCGA	2	8	21656	21663	25 %	25 %	25 %	25 %	386627463
57	NC_017647	CGCC	2	8	21684	21691	0 %	0 %	25 %	75 %	386627463
58	NC_017647	AATT	2	8	21901	21908	50 %	50 %	0 %	0 %	386627463
59	NC_017647	ATTT	2	8	21972	21979	25 %	75 %	0 %	0 %	386627463
60	NC_017647	GCCA	2	8	22408	22415	25 %	0 %	25 %	50 %	386627463
61	NC_017647	ATTA	2	8	22868	22875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017647	GTCA	2	8	24530	24537	25 %	25 %	25 %	25 %	386627465
63	NC_017647	TCTG	2	8	24580	24587	0 %	50 %	25 %	25 %	386627465
64	NC_017647	ATTA	2	8	24692	24699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017647	GAAT	2	8	24715	24722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017647	GCTT	2	8	24855	24862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017647	CGGC	2	8	24941	24948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017647	ACGT	2	8	25009	25016	25 %	25 %	25 %	25 %	386627466
69	NC_017647	CCAG	2	8	25628	25635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017647	GTTT	2	8	25685	25692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017647	GTAC	2	8	25773	25780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017647	ATTT	2	8	26114	26121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017647	ATCT	2	8	26398	26405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017647	AGAA	2	8	26757	26764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017647	TAAA	2	8	27091	27098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017647	ACAG	2	8	27122	27129	50 %	0 %	25 %	25 %	386627467
77	NC_017647	AGAA	2	8	27145	27152	75 %	0 %	25 %	0 %	386627467
78	NC_017647	AGCA	2	8	27205	27212	50 %	0 %	25 %	25 %	386627467
79	NC_017647	CTTT	2	8	27463	27470	0 %	75 %	0 %	25 %	386627468
80	NC_017647	CAGC	2	8	28617	28624	25 %	0 %	25 %	50 %	386627470
81	NC_017647	CGTC	2	8	29537	29544	0 %	25 %	25 %	50 %	386627472
82	NC_017647	CAGC	2	8	29586	29593	25 %	0 %	25 %	50 %	386627472
83	NC_017647	CAGC	2	8	29720	29727	25 %	0 %	25 %	50 %	386627472
84	NC_017647	CATT	2	8	29854	29861	25 %	50 %	0 %	25 %	386627473
85	NC_017647	ATCC	2	8	30029	30036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017647	TTAC	2	8	30868	30875	25 %	50 %	0 %	25 %	386627475
87	NC_017647	GTAT	2	8	31055	31062	25 %	50 %	25 %	0 %	386627475
88	NC_017647	GTGG	2	8	31235	31242	0 %	25 %	75 %	0 %	386627475
89	NC_017647	AGCC	2	8	31577	31584	25 %	0 %	25 %	50 %	386627476
90	NC_017647	TTCC	2	8	32300	32307	0 %	50 %	0 %	50 %	386627476
91	NC_017647	CTGT	2	8	32677	32684	0 %	50 %	25 %	25 %	386627476
92	NC_017647	GATA	2	8	32756	32763	50 %	25 %	25 %	0 %	386627476
93	NC_017647	GTCC	2	8	33130	33137	0 %	25 %	25 %	50 %	386627476
94	NC_017647	CAGC	2	8	33792	33799	25 %	0 %	25 %	50 %	386627477
95	NC_017647	GCAA	2	8	33816	33823	50 %	0 %	25 %	25 %	386627477
96	NC_017647	ATTT	2	8	34303	34310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017647	TACT	2	8	34559	34566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017647	CTCC	2	8	34633	34640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017647	TCAT	2	8	35026	35033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017647	TCAT	2	8	35080	35087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017647	TCAT	2	8	35168	35175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017647	GATG	2	8	35240	35247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017647	AAAT	2	8	35412	35419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017647	AGAT	2	8	36400	36407	50 %	25 %	25 %	0 %	386627478
105	NC_017647	CCAG	2	8	36528	36535	25 %	0 %	25 %	50 %	386627478
106	NC_017647	GTAA	2	8	37057	37064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017647	ATTT	2	8	37077	37084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017647	CATG	2	8	37182	37189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017647	CAAA	2	8	37484	37491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017647	AGTG	2	8	37739	37746	25 %	25 %	50 %	0 %	386627479
111	NC_017647	TGGA	2	8	37858	37865	25 %	25 %	50 %	0 %	386627479
112	NC_017647	GTGC	2	8	37899	37906	0 %	25 %	50 %	25 %	386627479
113	NC_017647	CGCC	2	8	37917	37924	0 %	0 %	25 %	75 %	386627479
114	NC_017647	CTGG	2	8	38190	38197	0 %	25 %	50 %	25 %	386627479
115	NC_017647	TCAC	2	8	38506	38513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017647	GAAT	2	8	39285	39292	50 %	25 %	25 %	0 %	386627480
117	NC_017647	CCCA	2	8	39297	39304	25 %	0 %	0 %	75 %	386627480
118	NC_017647	GGTA	2	8	39455	39462	25 %	25 %	50 %	0 %	386627480
119	NC_017647	ACTG	2	8	39658	39665	25 %	25 %	25 %	25 %	386627481
120	NC_017647	ACTT	2	8	39731	39738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017647	TCAT	2	8	39882	39889	25 %	50 %	0 %	25 %	386627482
122	NC_017647	GTCT	2	8	40076	40083	0 %	50 %	25 %	25 %	386627482
123	NC_017647	GTCG	2	8	40513	40520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017647	TGCC	2	8	40704	40711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017647	CAGT	2	8	40759	40766	25 %	25 %	25 %	25 %	386627483
126	NC_017647	ATAA	2	8	40822	40829	75 %	25 %	0 %	0 %	386627483
127	NC_017647	TGGC	2	8	40932	40939	0 %	25 %	50 %	25 %	386627483
128	NC_017647	TCAG	2	8	41224	41231	25 %	25 %	25 %	25 %	386627483
129	NC_017647	CTGG	2	8	41235	41242	0 %	25 %	50 %	25 %	386627483
130	NC_017647	CCGG	2	8	41257	41264	0 %	0 %	50 %	50 %	386627483
131	NC_017647	AATT	2	8	41821	41828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017647	TGAT	2	8	41939	41946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017647	TGTC	2	8	42039	42046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017647	GATG	2	8	42249	42256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017647	AGGT	2	8	42560	42567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017647	GATT	2	8	42699	42706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017647	GTTT	2	8	43520	43527	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017647	ATAA	2	8	43576	43583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017647	AGTG	2	8	44384	44391	25 %	25 %	50 %	0 %	386627486
140	NC_017647	TCGC	2	8	44499	44506	0 %	25 %	25 %	50 %	386627486
141	NC_017647	GTCA	2	8	44634	44641	25 %	25 %	25 %	25 %	386627486
142	NC_017647	CAGG	2	8	44698	44705	25 %	0 %	50 %	25 %	386627486
143	NC_017647	TGCT	2	8	45413	45420	0 %	50 %	25 %	25 %	386627487
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145	NC_017647	TTCA	2	8	45847	45854	25 %	50 %	0 %	25 %	386627488
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.