MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	TGGC	2	8	1156	1163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017647	GCTC	2	8	1355	1362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017647	CTGG	2	8	2828	2835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017647	ATCA	2	8	3003	3010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017647	CAGA	2	8	4570	4577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017647	TGAA	2	8	5488	5495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017647	CTGC	2	8	6348	6355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017647	GCCT	2	8	6408	6415	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017647	ACAA	2	8	19066	19073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017647	ATTA	2	8	22868	22875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017647	ATTA	2	8	24692	24699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017647	GAAT	2	8	24715	24722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017647	GCTT	2	8	24855	24862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017647	CGGC	2	8	24941	24948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017647	CCAG	2	8	25628	25635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017647	GTTT	2	8	25685	25692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017647	GTAC	2	8	25773	25780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017647	ATTT	2	8	26114	26121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017647	ATCT	2	8	26398	26405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017647	AGAA	2	8	26757	26764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017647	TAAA	2	8	27091	27098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017647	ATCC	2	8	30029	30036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017647	ATTT	2	8	34303	34310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017647	TACT	2	8	34559	34566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017647	CTCC	2	8	34633	34640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_017647	TCAT	2	8	35026	35033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017647	TCAT	2	8	35080	35087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017647	TCAT	2	8	35168	35175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017647	GATG	2	8	35240	35247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017647	AAAT	2	8	35412	35419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017647	GTAA	2	8	37057	37064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017647	ATTT	2	8	37077	37084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017647	CATG	2	8	37182	37189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017647	CAAA	2	8	37484	37491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017647	TCAC	2	8	38506	38513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017647	ACTT	2	8	39731	39738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017647	GTCG	2	8	40513	40520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017647	TGCC	2	8	40704	40711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017647	AATT	2	8	41821	41828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017647	TGAT	2	8	41939	41946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017647	TGTC	2	8	42039	42046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017647	GATG	2	8	42249	42256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017647	AGGT	2	8	42560	42567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017647	GATT	2	8	42699	42706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017647	GTTT	2	8	43520	43527	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017647	ATAA	2	8	43576	43583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017647	GGAA	2	8	53070	53077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017647	TCAT	2	8	54014	54021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017647	TAAT	2	8	54263	54270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.