MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	GCCA	2	8	418	425	25 %	0 %	25 %	50 %	386627437
2	NC_017647	AGGC	2	8	475	482	25 %	0 %	50 %	25 %	386627437
3	NC_017647	GAAA	2	8	1052	1059	75 %	0 %	25 %	0 %	386627438
4	NC_017647	TACC	2	8	1780	1787	25 %	25 %	0 %	50 %	386627439
5	NC_017647	CCGA	2	8	1823	1830	25 %	0 %	25 %	50 %	386627439
6	NC_017647	AAAC	2	8	1918	1925	75 %	0 %	0 %	25 %	386627439
7	NC_017647	CAGA	2	8	2015	2022	50 %	0 %	25 %	25 %	386627439
8	NC_017647	CATT	2	8	2559	2566	25 %	50 %	0 %	25 %	386627440
9	NC_017647	GACA	2	8	2600	2607	50 %	0 %	25 %	25 %	386627440
10	NC_017647	GCTG	2	8	3405	3412	0 %	25 %	50 %	25 %	386627442
11	NC_017647	CTGG	2	8	4073	4080	0 %	25 %	50 %	25 %	386627443
12	NC_017647	CAGC	2	8	4348	4355	25 %	0 %	25 %	50 %	386627443
13	NC_017647	GAAA	2	8	4789	4796	75 %	0 %	25 %	0 %	386627444
14	NC_017647	GCTG	2	8	4831	4838	0 %	25 %	50 %	25 %	386627445
15	NC_017647	TTGA	2	8	6696	6703	25 %	50 %	25 %	0 %	386627447
16	NC_017647	CGCT	2	8	6907	6914	0 %	25 %	25 %	50 %	386627447
17	NC_017647	CTGG	2	8	8045	8052	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
18	NC_017647	CTGG	2	8	8246	8253	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
19	NC_017647	GCTG	2	8	8416	8423	0 %	25 %	50 %	25 %	386627447
20	NC_017647	ATGA	2	8	8695	8702	50 %	25 %	25 %	0 %	386627448
21	NC_017647	GGGC	2	8	9538	9545	0 %	0 %	75 %	25 %	386627449
22	NC_017647	GGCG	2	8	9625	9632	0 %	0 %	75 %	25 %	386627449
23	NC_017647	TGGT	2	8	9965	9972	0 %	50 %	50 %	0 %	386627449
24	NC_017647	GCCT	2	8	10223	10230	0 %	25 %	25 %	50 %	386627449
25	NC_017647	GAGG	2	8	10588	10595	25 %	0 %	75 %	0 %	386627449
26	NC_017647	TTGA	2	8	10771	10778	25 %	50 %	25 %	0 %	386627450
27	NC_017647	GGAG	2	8	10941	10948	25 %	0 %	75 %	0 %	386627450
28	NC_017647	TCAG	2	8	10976	10983	25 %	25 %	25 %	25 %	386627450
29	NC_017647	GCTG	2	8	11679	11686	0 %	25 %	50 %	25 %	386627450
30	NC_017647	GGCG	2	8	11913	11920	0 %	0 %	75 %	25 %	386627451
31	NC_017647	GACG	2	8	14628	14635	25 %	0 %	50 %	25 %	386627454
32	NC_017647	TGGC	2	8	15074	15081	0 %	25 %	50 %	25 %	386627455
33	NC_017647	GCCA	2	8	16183	16190	25 %	0 %	25 %	50 %	386627457
34	NC_017647	CAGT	2	8	16797	16804	25 %	25 %	25 %	25 %	386627458
35	NC_017647	ATAC	2	8	16959	16966	50 %	25 %	0 %	25 %	386627458
36	NC_017647	TGGG	2	8	17103	17110	0 %	25 %	75 %	0 %	386627458
37	NC_017647	CCAC	2	8	17352	17359	25 %	0 %	0 %	75 %	386627459
38	NC_017647	ATAC	2	8	17532	17539	50 %	25 %	0 %	25 %	386627459
39	NC_017647	GTAA	2	8	17719	17726	50 %	25 %	25 %	0 %	386627459
40	NC_017647	CCAC	2	8	17733	17740	25 %	0 %	0 %	75 %	386627459
41	NC_017647	TTCC	2	8	17898	17905	0 %	50 %	0 %	50 %	386627459
42	NC_017647	TCTT	2	8	17975	17982	0 %	75 %	0 %	25 %	386627459
43	NC_017647	GGAT	2	8	18596	18603	25 %	25 %	50 %	0 %	386627461
44	NC_017647	CATC	2	8	19843	19850	25 %	25 %	0 %	50 %	386627462
45	NC_017647	TATT	2	8	20211	20218	25 %	75 %	0 %	0 %	386627462
46	NC_017647	TGGG	2	8	20611	20618	0 %	25 %	75 %	0 %	386627463
47	NC_017647	TCGA	2	8	21656	21663	25 %	25 %	25 %	25 %	386627463
48	NC_017647	CGCC	2	8	21684	21691	0 %	0 %	25 %	75 %	386627463
49	NC_017647	AATT	2	8	21901	21908	50 %	50 %	0 %	0 %	386627463
50	NC_017647	ATTT	2	8	21972	21979	25 %	75 %	0 %	0 %	386627463
51	NC_017647	GCCA	2	8	22408	22415	25 %	0 %	25 %	50 %	386627463
52	NC_017647	GTCA	2	8	24530	24537	25 %	25 %	25 %	25 %	386627465
53	NC_017647	TCTG	2	8	24580	24587	0 %	50 %	25 %	25 %	386627465
54	NC_017647	ACGT	2	8	25009	25016	25 %	25 %	25 %	25 %	386627466
55	NC_017647	ACAG	2	8	27122	27129	50 %	0 %	25 %	25 %	386627467
56	NC_017647	AGAA	2	8	27145	27152	75 %	0 %	25 %	0 %	386627467
57	NC_017647	AGCA	2	8	27205	27212	50 %	0 %	25 %	25 %	386627467
58	NC_017647	CTTT	2	8	27463	27470	0 %	75 %	0 %	25 %	386627468
59	NC_017647	CAGC	2	8	28617	28624	25 %	0 %	25 %	50 %	386627470
60	NC_017647	CGTC	2	8	29537	29544	0 %	25 %	25 %	50 %	386627472
61	NC_017647	CAGC	2	8	29586	29593	25 %	0 %	25 %	50 %	386627472
62	NC_017647	CAGC	2	8	29720	29727	25 %	0 %	25 %	50 %	386627472
63	NC_017647	CATT	2	8	29854	29861	25 %	50 %	0 %	25 %	386627473
64	NC_017647	TTAC	2	8	30868	30875	25 %	50 %	0 %	25 %	386627475
65	NC_017647	GTAT	2	8	31055	31062	25 %	50 %	25 %	0 %	386627475
66	NC_017647	GTGG	2	8	31235	31242	0 %	25 %	75 %	0 %	386627475
67	NC_017647	AGCC	2	8	31577	31584	25 %	0 %	25 %	50 %	386627476
68	NC_017647	TTCC	2	8	32300	32307	0 %	50 %	0 %	50 %	386627476
69	NC_017647	CTGT	2	8	32677	32684	0 %	50 %	25 %	25 %	386627476
70	NC_017647	GATA	2	8	32756	32763	50 %	25 %	25 %	0 %	386627476
71	NC_017647	GTCC	2	8	33130	33137	0 %	25 %	25 %	50 %	386627476
72	NC_017647	CAGC	2	8	33792	33799	25 %	0 %	25 %	50 %	386627477
73	NC_017647	GCAA	2	8	33816	33823	50 %	0 %	25 %	25 %	386627477
74	NC_017647	AGAT	2	8	36400	36407	50 %	25 %	25 %	0 %	386627478
75	NC_017647	CCAG	2	8	36528	36535	25 %	0 %	25 %	50 %	386627478
76	NC_017647	AGTG	2	8	37739	37746	25 %	25 %	50 %	0 %	386627479
77	NC_017647	TGGA	2	8	37858	37865	25 %	25 %	50 %	0 %	386627479
78	NC_017647	GTGC	2	8	37899	37906	0 %	25 %	50 %	25 %	386627479
79	NC_017647	CGCC	2	8	37917	37924	0 %	0 %	25 %	75 %	386627479
80	NC_017647	CTGG	2	8	38190	38197	0 %	25 %	50 %	25 %	386627479
81	NC_017647	GAAT	2	8	39285	39292	50 %	25 %	25 %	0 %	386627480
82	NC_017647	CCCA	2	8	39297	39304	25 %	0 %	0 %	75 %	386627480
83	NC_017647	GGTA	2	8	39455	39462	25 %	25 %	50 %	0 %	386627480
84	NC_017647	ACTG	2	8	39658	39665	25 %	25 %	25 %	25 %	386627481
85	NC_017647	TCAT	2	8	39882	39889	25 %	50 %	0 %	25 %	386627482
86	NC_017647	GTCT	2	8	40076	40083	0 %	50 %	25 %	25 %	386627482
87	NC_017647	CAGT	2	8	40759	40766	25 %	25 %	25 %	25 %	386627483
88	NC_017647	ATAA	2	8	40822	40829	75 %	25 %	0 %	0 %	386627483
89	NC_017647	TGGC	2	8	40932	40939	0 %	25 %	50 %	25 %	386627483
90	NC_017647	TCAG	2	8	41224	41231	25 %	25 %	25 %	25 %	386627483
91	NC_017647	CTGG	2	8	41235	41242	0 %	25 %	50 %	25 %	386627483
92	NC_017647	CCGG	2	8	41257	41264	0 %	0 %	50 %	50 %	386627483
93	NC_017647	AGTG	2	8	44384	44391	25 %	25 %	50 %	0 %	386627486
94	NC_017647	TCGC	2	8	44499	44506	0 %	25 %	25 %	50 %	386627486
95	NC_017647	GTCA	2	8	44634	44641	25 %	25 %	25 %	25 %	386627486
96	NC_017647	CAGG	2	8	44698	44705	25 %	0 %	50 %	25 %	386627486
97	NC_017647	TGCT	2	8	45413	45420	0 %	50 %	25 %	25 %	386627487
98	NC_017647	TCAT	2	8	45452	45459	25 %	50 %	0 %	25 %	386627488
99	NC_017647	TTCA	2	8	45847	45854	25 %	50 %	0 %	25 %	386627488
100	NC_017647	ATGG	2	8	46403	46410	25 %	25 %	50 %	0 %	386627489
101	NC_017647	ATTT	2	8	47410	47417	25 %	75 %	0 %	0 %	386627490
102	NC_017647	GCCT	2	8	47448	47455	0 %	25 %	25 %	50 %	386627490
103	NC_017647	TCAG	2	8	47514	47521	25 %	25 %	25 %	25 %	386627490
104	NC_017647	TGGA	2	8	47527	47534	25 %	25 %	50 %	0 %	386627490
105	NC_017647	AATG	2	8	47635	47642	50 %	25 %	25 %	0 %	386627490
106	NC_017647	CCAC	2	8	47830	47837	25 %	0 %	0 %	75 %	386627491
107	NC_017647	ATAC	2	8	48010	48017	50 %	25 %	0 %	25 %	386627491
108	NC_017647	GTAA	2	8	48197	48204	50 %	25 %	25 %	0 %	386627491
109	NC_017647	CCAC	2	8	48211	48218	25 %	0 %	0 %	75 %	386627491
110	NC_017647	TCTT	2	8	48453	48460	0 %	75 %	0 %	25 %	386627491
111	NC_017647	GCTG	2	8	49073	49080	0 %	25 %	50 %	25 %	386627493
112	NC_017647	GTGG	2	8	49709	49716	0 %	25 %	75 %	0 %	386627494
113	NC_017647	CAGC	2	8	50494	50501	25 %	0 %	25 %	50 %	386627495
114	NC_017647	TGAA	2	8	50541	50548	50 %	25 %	25 %	0 %	386627495
115	NC_017647	TGCC	2	8	51496	51503	0 %	25 %	25 %	50 %	386627496
116	NC_017647	TTAC	2	8	52460	52467	25 %	50 %	0 %	25 %	386627498
117	NC_017647	GTAT	2	8	52647	52654	25 %	50 %	25 %	0 %	386627498
118	NC_017647	GTGG	2	8	52827	52834	0 %	25 %	75 %	0 %	386627498
119	NC_017647	GAAT	2	8	53828	53835	50 %	25 %	25 %	0 %	386627500
120	NC_017647	TAAA	2	8	53991	53998	75 %	25 %	0 %	0 %	386627500

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.