MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10A

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017647	A	6	6	775	780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017647	A	7	7	2317	2323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017647	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017647	A	6	6	3120	3125	100 %	0 %	0 %	0 %	386627441
5	NC_017647	T	6	6	3234	3239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017647	T	7	7	4554	4560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017647	T	6	6	5342	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017647	T	6	6	5407	5412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017647	T	6	6	5430	5435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017647	T	6	6	5518	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	386627446
11	NC_017647	A	6	6	5729	5734	100 %	0 %	0 %	0 %	386627446
12	NC_017647	A	6	6	6900	6905	100 %	0 %	0 %	0 %	386627447
13	NC_017647	A	6	6	8534	8539	100 %	0 %	0 %	0 %	386627447
14	NC_017647	G	6	6	13876	13881	0 %	0 %	100 %	0 %	386627453
15	NC_017647	A	6	6	13918	13923	100 %	0 %	0 %	0 %	386627453
16	NC_017647	A	6	6	14481	14486	100 %	0 %	0 %	0 %	386627454
17	NC_017647	A	6	6	14813	14818	100 %	0 %	0 %	0 %	386627455
18	NC_017647	A	6	6	15228	15233	100 %	0 %	0 %	0 %	386627455
19	NC_017647	T	6	6	15558	15563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017647	A	6	6	16790	16795	100 %	0 %	0 %	0 %	386627458
21	NC_017647	T	6	6	18514	18519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017647	A	6	6	18826	18831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017647	T	6	6	19298	19303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017647	C	7	7	19304	19310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_017647	T	6	6	19837	19842	0 %	100 %	0 %	0 %	386627462
26	NC_017647	T	6	6	22720	22725	0 %	100 %	0 %	0 %	386627463
27	NC_017647	T	6	6	22737	22742	0 %	100 %	0 %	0 %	386627463
28	NC_017647	T	7	7	22895	22901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017647	T	7	7	24104	24110	0 %	100 %	0 %	0 %	386627465
30	NC_017647	T	8	8	24126	24133	0 %	100 %	0 %	0 %	386627465
31	NC_017647	G	6	6	24949	24954	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017647	G	6	6	24983	24988	0 %	0 %	100 %	0 %	386627466
33	NC_017647	T	6	6	25549	25554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017647	A	6	6	25813	25818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017647	A	7	7	26214	26220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017647	T	6	6	26284	26289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017647	T	6	6	26547	26552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017647	A	7	7	27238	27244	100 %	0 %	0 %	0 %	386627467
39	NC_017647	C	6	6	27398	27403	0 %	0 %	0 %	100 %	386627467
40	NC_017647	A	6	6	27594	27599	100 %	0 %	0 %	0 %	386627469
41	NC_017647	G	6	6	27740	27745	0 %	0 %	100 %	0 %	386627469
42	NC_017647	G	7	7	27839	27845	0 %	0 %	100 %	0 %	386627469
43	NC_017647	T	6	6	28849	28854	0 %	100 %	0 %	0 %	386627471
44	NC_017647	A	6	6	30454	30459	100 %	0 %	0 %	0 %	386627474
45	NC_017647	T	6	6	31599	31604	0 %	100 %	0 %	0 %	386627476
46	NC_017647	G	6	6	32898	32903	0 %	0 %	100 %	0 %	386627476
47	NC_017647	A	7	7	33932	33938	100 %	0 %	0 %	0 %	386627477
48	NC_017647	A	6	6	33985	33990	100 %	0 %	0 %	0 %	386627477
49	NC_017647	A	8	8	34737	34744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017647	A	7	7	34841	34847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017647	T	6	6	35204	35209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017647	G	6	6	35328	35333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017647	T	8	8	35998	36005	0 %	100 %	0 %	0 %	386627478
54	NC_017647	A	7	7	36023	36029	100 %	0 %	0 %	0 %	386627478
55	NC_017647	A	6	6	36628	36633	100 %	0 %	0 %	0 %	386627478
56	NC_017647	T	6	6	36664	36669	0 %	100 %	0 %	0 %	386627478
57	NC_017647	A	7	7	36696	36702	100 %	0 %	0 %	0 %	386627478
58	NC_017647	A	8	8	36711	36718	100 %	0 %	0 %	0 %	386627478
59	NC_017647	A	6	6	36951	36956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017647	T	6	6	38665	38670	0 %	100 %	0 %	0 %	386627480
61	NC_017647	T	8	8	39426	39433	0 %	100 %	0 %	0 %	386627480
62	NC_017647	T	6	6	39566	39571	0 %	100 %	0 %	0 %	386627481
63	NC_017647	T	6	6	40065	40070	0 %	100 %	0 %	0 %	386627482
64	NC_017647	T	6	6	41843	41848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017647	T	6	6	42065	42070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017647	A	8	8	42189	42196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017647	A	7	7	42305	42311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017647	T	6	6	42328	42333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017647	A	6	6	42828	42833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017647	C	6	6	42860	42865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_017647	A	6	6	43280	43285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017647	G	6	6	44488	44493	0 %	0 %	100 %	0 %	386627486
73	NC_017647	A	7	7	45064	45070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017647	T	6	6	45219	45224	0 %	100 %	0 %	0 %	386627487
75	NC_017647	A	6	6	46462	46467	100 %	0 %	0 %	0 %	386627489
76	NC_017647	A	7	7	46643	46649	100 %	0 %	0 %	0 %	386627489
77	NC_017647	A	6	6	47303	47308	100 %	0 %	0 %	0 %	386627490
78	NC_017647	A	6	6	47595	47600	100 %	0 %	0 %	0 %	386627490
79	NC_017647	A	6	6	47660	47665	100 %	0 %	0 %	0 %	386627490
80	NC_017647	T	6	6	48613	48618	0 %	100 %	0 %	0 %	386627492
81	NC_017647	T	6	6	49998	50003	0 %	100 %	0 %	0 %	386627494
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85	NC_017647	A	7	7	51241	51247	100 %	0 %	0 %	0 %	386627496
86	NC_017647	A	6	6	51428	51433	100 %	0 %	0 %	0 %	386627496
87	NC_017647	A	6	6	51636	51641	100 %	0 %	0 %	0 %	386627496
88	NC_017647	A	6	6	52046	52051	100 %	0 %	0 %	0 %	386627497
89	NC_017647	G	6	6	53164	53169	0 %	0 %	100 %	0 %	386627499
90	NC_017647	T	7	7	53352	53358	0 %	100 %	0 %	0 %	386627499
91	NC_017647	T	6	6	53406	53411	0 %	100 %	0 %	0 %	386627499
92	NC_017647	C	6	6	53968	53973	0 %	0 %	0 %	100 %	386627500
93	NC_017647	A	6	6	54107	54112	100 %	0 %	0 %	0 %	386627501

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.