MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 3414

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017646	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	386622415
2	NC_017646	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	386622416
3	NC_017646	CGCAG	2	10	8245	8254	20 %	0 %	40 %	40 %	386622421
4	NC_017646	CGTAC	2	10	9673	9682	20 %	20 %	20 %	40 %	386622422
5	NC_017646	GAATT	2	10	15812	15821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017646	CTGGA	2	10	17929	17938	20 %	20 %	40 %	20 %	386622430
7	NC_017646	CGGAC	2	10	17978	17987	20 %	0 %	40 %	40 %	386622430
8	NC_017646	AATGT	2	10	18341	18350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017646	TTCTT	2	10	18402	18411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017646	AAATG	2	10	19545	19554	60 %	20 %	20 %	0 %	386622431
11	NC_017646	CTCAT	2	10	19810	19819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017646	CCGAT	2	10	20302	20311	20 %	20 %	20 %	40 %	386622432
13	NC_017646	AGCGA	2	10	20690	20699	40 %	0 %	40 %	20 %	386622432
14	NC_017646	GCCTT	2	10	20989	20998	0 %	40 %	20 %	40 %	386622432
15	NC_017646	GTTTT	2	10	23107	23116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017646	TTTAT	2	10	24163	24172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017646	AATGT	2	10	25646	25655	40 %	40 %	20 %	0 %	386622435
18	NC_017646	TGCAA	2	10	25859	25868	40 %	20 %	20 %	20 %	386622435
19	NC_017646	ATAAA	2	10	25930	25939	80 %	20 %	0 %	0 %	386622435
20	NC_017646	TAAAA	2	10	26203	26212	80 %	20 %	0 %	0 %	386622435
21	NC_017646	GTAAT	2	10	28255	28264	40 %	40 %	20 %	0 %	386622437
22	NC_017646	TTAAT	2	10	28579	28588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017646	CAGTA	2	10	34854	34863	40 %	20 %	20 %	20 %	386622443
24	NC_017646	GCGAA	2	10	40649	40658	40 %	0 %	40 %	20 %	386622447
25	NC_017646	CCGTT	2	10	41543	41552	0 %	40 %	20 %	40 %	386622447
26	NC_017646	CACGG	2	10	41920	41929	20 %	0 %	40 %	40 %	386622447
27	NC_017646	GATGC	2	10	42911	42920	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017646	CGAAT	2	10	44662	44671	40 %	20 %	20 %	20 %	386622451
29	NC_017646	CCATG	2	10	46199	46208	20 %	20 %	20 %	40 %	386622452
30	NC_017646	CCGTA	2	10	47845	47854	20 %	20 %	20 %	40 %	386622453
31	NC_017646	TTAAA	2	10	48583	48592	60 %	40 %	0 %	0 %	386622453
32	NC_017646	ACCCA	2	10	49326	49335	40 %	0 %	0 %	60 %	386622454
33	NC_017646	TTTGA	2	10	50952	50961	20 %	60 %	20 %	0 %	386622455
34	NC_017646	CGGCG	2	10	51203	51212	0 %	0 %	60 %	40 %	386622455
35	NC_017646	AATCA	2	10	51485	51494	60 %	20 %	0 %	20 %	386622456
36	NC_017646	CGGTT	2	10	52440	52449	0 %	40 %	40 %	20 %	386622457
37	NC_017646	TGGCG	2	10	54131	54140	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017646	TGCAC	2	10	55893	55902	20 %	20 %	20 %	40 %	386622459
39	NC_017646	GAAAC	2	10	57825	57834	60 %	0 %	20 %	20 %	386622460
40	NC_017646	AATCC	2	10	58994	59003	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017646	AACGT	2	10	60298	60307	40 %	20 %	20 %	20 %	386622464
42	NC_017646	GCGTC	2	10	63282	63291	0 %	20 %	40 %	40 %	386622467
43	NC_017646	ATGTT	2	10	64096	64105	20 %	60 %	20 %	0 %	386622468
44	NC_017646	CTTCG	2	10	64529	64538	0 %	40 %	20 %	40 %	386622468
45	NC_017646	TGCGT	2	10	64815	64824	0 %	40 %	40 %	20 %	386622468
46	NC_017646	AAAGT	2	10	70550	70559	60 %	20 %	20 %	0 %	386622471
47	NC_017646	GTGCT	2	10	71813	71822	0 %	40 %	40 %	20 %	386622472
48	NC_017646	GGTGA	2	10	72797	72806	20 %	20 %	60 %	0 %	386622472
49	NC_017646	CAGCG	2	10	74080	74089	20 %	0 %	40 %	40 %	386622474
50	NC_017646	TTGAT	2	10	76160	76169	20 %	60 %	20 %	0 %	386622475
51	NC_017646	TTTTC	2	10	79769	79778	0 %	80 %	0 %	20 %	386622477
52	NC_017646	AAAGC	2	10	80073	80082	60 %	0 %	20 %	20 %	386622478
53	NC_017646	TAGTG	2	10	84623	84632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017646	GGCAA	2	10	85048	85057	40 %	0 %	40 %	20 %	386622483
55	NC_017646	TTGCT	2	10	85784	85793	0 %	60 %	20 %	20 %	386622484
56	NC_017646	GATGG	2	10	86520	86529	20 %	20 %	60 %	0 %	386622484
57	NC_017646	ATTTT	2	10	87348	87357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017646	GGGAG	2	10	87512	87521	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017646	CGCCA	2	10	87576	87585	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_017646	CCTGG	2	10	88773	88782	0 %	20 %	40 %	40 %	386622486
61	NC_017646	GACCG	2	10	91040	91049	20 %	0 %	40 %	40 %	386622488
62	NC_017646	ATGTT	2	10	93588	93597	20 %	60 %	20 %	0 %	386622489
63	NC_017646	AAAAC	2	10	94003	94012	80 %	0 %	0 %	20 %	386622489
64	NC_017646	TGCAT	2	10	94529	94538	20 %	40 %	20 %	20 %	386622490
65	NC_017646	ATTCC	2	10	94699	94708	20 %	40 %	0 %	40 %	386622490
66	NC_017646	AGTTC	2	10	99792	99801	20 %	40 %	20 %	20 %	386622495
67	NC_017646	TATCG	2	10	101672	101681	20 %	40 %	20 %	20 %	386622497
68	NC_017646	GGGCT	2	10	105544	105553	0 %	20 %	60 %	20 %	386622500
69	NC_017646	TCTGG	2	10	107251	107260	0 %	40 %	40 %	20 %	386622502
70	NC_017646	ACCGT	2	10	107917	107926	20 %	20 %	20 %	40 %	386622502
71	NC_017646	ATCAG	2	10	109690	109699	40 %	20 %	20 %	20 %	386622504
72	NC_017646	AGCCG	2	10	111458	111467	20 %	0 %	40 %	40 %	386622505
73	NC_017646	GCGCA	2	10	113786	113795	20 %	0 %	40 %	40 %	386622507
74	NC_017646	TGGCG	2	10	114781	114790	0 %	20 %	60 %	20 %	386622508
75	NC_017646	CGCGG	2	10	120957	120966	0 %	0 %	60 %	40 %	386622514
76	NC_017646	CATCG	2	10	123214	123223	20 %	20 %	20 %	40 %	386622517
77	NC_017646	TAACG	2	10	123908	123917	40 %	20 %	20 %	20 %	386622517
78	NC_017646	ATGCC	2	10	124367	124376	20 %	20 %	20 %	40 %	386622517
79	NC_017646	AATGC	2	10	125650	125659	40 %	20 %	20 %	20 %	386622518
80	NC_017646	TCTGT	2	10	126596	126605	0 %	60 %	20 %	20 %	386622520
81	NC_017646	AGCAG	2	10	129027	129036	40 %	0 %	40 %	20 %	386622523
82	NC_017646	CGAAG	2	10	130942	130951	40 %	0 %	40 %	20 %	386622524
83	NC_017646	ACACG	2	10	131075	131084	40 %	0 %	20 %	40 %	386622524
84	NC_017646	TCGCG	2	10	131336	131345	0 %	20 %	40 %	40 %	386622524
85	NC_017646	GCATC	2	10	131426	131435	20 %	20 %	20 %	40 %	386622524
86	NC_017646	GACTG	2	10	132744	132753	20 %	20 %	40 %	20 %	386622525
87	NC_017646	AGAGC	2	10	133154	133163	40 %	0 %	40 %	20 %	386622525
88	NC_017646	AGGCG	2	10	138310	138319	20 %	0 %	60 %	20 %	386622527
89	NC_017646	TCTGG	2	10	141709	141718	0 %	40 %	40 %	20 %	386622528
90	NC_017646	GGGCA	2	10	143120	143129	20 %	0 %	60 %	20 %	386622529
91	NC_017646	CAGCG	2	10	143399	143408	20 %	0 %	40 %	40 %	386622530
92	NC_017646	ACGAC	2	10	144679	144688	40 %	0 %	20 %	40 %	386622531
93	NC_017646	TTCAG	2	10	148867	148876	20 %	40 %	20 %	20 %	386622534
94	NC_017646	AGCGC	2	10	149437	149446	20 %	0 %	40 %	40 %	386622534
95	NC_017646	CCGTC	2	10	150229	150238	0 %	20 %	20 %	60 %	386622535
96	NC_017646	GTGAA	2	10	150239	150248	40 %	20 %	40 %	0 %	386622535
97	NC_017646	GGCAT	2	10	150401	150410	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017646	GTTCA	2	10	150626	150635	20 %	40 %	20 %	20 %	386622536
99	NC_017646	ATCCA	2	10	150952	150961	40 %	20 %	0 %	40 %	386622536
100	NC_017646	GTAAG	2	10	151165	151174	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017646	TTTAT	2	10	152216	152225	20 %	80 %	0 %	0 %	386622538
102	NC_017646	ATTTG	2	10	152828	152837	20 %	60 %	20 %	0 %	386622538
103	NC_017646	TCCTC	2	10	152885	152894	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_017646	CGGGC	2	10	153630	153639	0 %	0 %	60 %	40 %	386622540
105	NC_017646	TTTCA	2	10	154755	154764	20 %	60 %	0 %	20 %	386622541
106	NC_017646	TGTGG	2	10	160519	160528	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017646	AAATT	2	10	167114	167123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017646	GCGAG	2	10	168482	168491	20 %	0 %	60 %	20 %	386622556
109	NC_017646	TGGCG	2	10	168919	168928	0 %	20 %	60 %	20 %	386622556
110	NC_017646	ACCAC	2	10	171823	171832	40 %	0 %	0 %	60 %	386622560
111	NC_017646	GGCGT	2	10	173526	173535	0 %	20 %	60 %	20 %	386622561
112	NC_017646	CTGCG	2	10	176599	176608	0 %	20 %	40 %	40 %	386622562
113	NC_017646	TTATC	2	10	177375	177384	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017646	GCAAA	2	10	178631	178640	60 %	0 %	20 %	20 %	386622563
115	NC_017646	TGGCG	2	10	178977	178986	0 %	20 %	60 %	20 %	386622563
116	NC_017646	AACCT	2	10	180794	180803	40 %	20 %	0 %	40 %	386622565
117	NC_017646	TGGTC	2	10	180836	180845	0 %	40 %	40 %	20 %	386622565
118	NC_017646	TGGCG	2	10	182081	182090	0 %	20 %	60 %	20 %	386622566
119	NC_017646	CGGCG	2	10	182711	182720	0 %	0 %	60 %	40 %	386622566
120	NC_017646	TTCCA	2	10	183322	183331	20 %	40 %	0 %	40 %	386622566
121	NC_017646	GGTCC	2	10	187645	187654	0 %	20 %	40 %	40 %	386622571
122	NC_017646	ACGGG	2	10	189562	189571	20 %	0 %	60 %	20 %	386622573
123	NC_017646	GTGAT	2	10	191721	191730	20 %	40 %	40 %	0 %	386622574
124	NC_017646	GTGAT	2	10	192012	192021	20 %	40 %	40 %	0 %	386622574
125	NC_017646	TACGT	2	10	192257	192266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017646	TGGCC	2	10	193947	193956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017646	GCCAG	2	10	195696	195705	20 %	0 %	40 %	40 %	386622578
128	NC_017646	GCTGT	2	10	196050	196059	0 %	40 %	40 %	20 %	386622578
129	NC_017646	GGCGT	2	10	196534	196543	0 %	20 %	60 %	20 %	386622578
130	NC_017646	GTTCT	2	10	197137	197146	0 %	60 %	20 %	20 %	386622578
131	NC_017646	CTGAA	2	10	199129	199138	40 %	20 %	20 %	20 %	386622580
132	NC_017646	AAGCG	2	10	199193	199202	40 %	0 %	40 %	20 %	386622580
133	NC_017646	TGGTG	2	10	200976	200985	0 %	40 %	60 %	0 %	386622582
134	NC_017646	TGCAC	2	10	201102	201111	20 %	20 %	20 %	40 %	386622582
135	NC_017646	TGCGC	2	10	201495	201504	0 %	20 %	40 %	40 %	386622582
136	NC_017646	GTCTG	2	10	201660	201669	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017646	CATGG	2	10	203196	203205	20 %	20 %	40 %	20 %	386622584
138	NC_017646	CAGAT	2	10	204235	204244	40 %	20 %	20 %	20 %	386622585
139	NC_017646	ACTTT	2	10	204368	204377	20 %	60 %	0 %	20 %	386622585
140	NC_017646	GACGT	2	10	208288	208297	20 %	20 %	40 %	20 %	386622588
141	NC_017646	CGACG	2	10	210115	210124	20 %	0 %	40 %	40 %	386622590
142	NC_017646	ATGCC	2	10	212683	212692	20 %	20 %	20 %	40 %	386622593
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144	NC_017646	ACCGC	2	10	214022	214031	20 %	0 %	20 %	60 %	386622595
145	NC_017646	AGCCG	2	10	215380	215389	20 %	0 %	40 %	40 %	386622595
146	NC_017646	GGTGG	2	10	215489	215498	0 %	20 %	80 %	0 %	386622595
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149	NC_017646	TGATT	2	10	230476	230485	20 %	60 %	20 %	0 %	386622611
150	NC_017646	CGGTT	2	10	233439	233448	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017646	GTGAA	2	10	242295	242304	40 %	20 %	40 %	0 %	386622618
152	NC_017646	TAATT	2	10	242479	242488	40 %	60 %	0 %	0 %	386622618
153	NC_017646	ACTGG	2	10	245418	245427	20 %	20 %	40 %	20 %	386622621
154	NC_017646	CGCGG	2	10	246463	246472	0 %	0 %	60 %	40 %	386622623
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158	NC_017646	AGGGA	2	10	257299	257308	40 %	0 %	60 %	0 %	386622634
159	NC_017646	CGATG	2	10	258114	258123	20 %	20 %	40 %	20 %	386622635
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162	NC_017646	GATGC	2	10	264882	264891	20 %	20 %	40 %	20 %	386622642
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172	NC_017646	TGTGT	2	10	280469	280478	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_017646	AATGC	2	10	302320	302329	40 %	20 %	20 %	20 %	386622673
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242	NC_017646	GATGG	2	10	380960	380969	20 %	20 %	60 %	0 %	386622745
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249	NC_017646	TCTTT	2	10	393221	393230	0 %	80 %	0 %	20 %	386622758
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262	NC_017646	GTTTC	2	10	413148	413157	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_017646	TCGTT	2	10	414321	414330	0 %	60 %	20 %	20 %	386622777
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265	NC_017646	CACTT	2	10	415542	415551	20 %	40 %	0 %	40 %	386622778
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267	NC_017646	CCCAA	2	10	416289	416298	40 %	0 %	0 %	60 %	386622780
268	NC_017646	AGGCG	2	10	416746	416755	20 %	0 %	60 %	20 %	386622780
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