MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 2868

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017646	CGCTG	2	10	691	700	0 %	20 %	40 %	40 %	386622415
2	NC_017646	ATTGC	2	10	3394	3403	20 %	40 %	20 %	20 %	386622416
3	NC_017646	CGCAG	2	10	8245	8254	20 %	0 %	40 %	40 %	386622421
4	NC_017646	CGTAC	2	10	9673	9682	20 %	20 %	20 %	40 %	386622422
5	NC_017646	CTGGA	2	10	17929	17938	20 %	20 %	40 %	20 %	386622430
6	NC_017646	CGGAC	2	10	17978	17987	20 %	0 %	40 %	40 %	386622430
7	NC_017646	AAATG	2	10	19545	19554	60 %	20 %	20 %	0 %	386622431
8	NC_017646	CCGAT	2	10	20302	20311	20 %	20 %	20 %	40 %	386622432
9	NC_017646	AGCGA	2	10	20690	20699	40 %	0 %	40 %	20 %	386622432
10	NC_017646	GCCTT	2	10	20989	20998	0 %	40 %	20 %	40 %	386622432
11	NC_017646	AATGT	2	10	25646	25655	40 %	40 %	20 %	0 %	386622435
12	NC_017646	TGCAA	2	10	25859	25868	40 %	20 %	20 %	20 %	386622435
13	NC_017646	ATAAA	2	10	25930	25939	80 %	20 %	0 %	0 %	386622435
14	NC_017646	TAAAA	2	10	26203	26212	80 %	20 %	0 %	0 %	386622435
15	NC_017646	GTAAT	2	10	28255	28264	40 %	40 %	20 %	0 %	386622437
16	NC_017646	CAGTA	2	10	34854	34863	40 %	20 %	20 %	20 %	386622443
17	NC_017646	GCGAA	2	10	40649	40658	40 %	0 %	40 %	20 %	386622447
18	NC_017646	CCGTT	2	10	41543	41552	0 %	40 %	20 %	40 %	386622447
19	NC_017646	CACGG	2	10	41920	41929	20 %	0 %	40 %	40 %	386622447
20	NC_017646	CGAAT	2	10	44662	44671	40 %	20 %	20 %	20 %	386622451
21	NC_017646	CCATG	2	10	46199	46208	20 %	20 %	20 %	40 %	386622452
22	NC_017646	CCGTA	2	10	47845	47854	20 %	20 %	20 %	40 %	386622453
23	NC_017646	TTAAA	2	10	48583	48592	60 %	40 %	0 %	0 %	386622453
24	NC_017646	ACCCA	2	10	49326	49335	40 %	0 %	0 %	60 %	386622454
25	NC_017646	TTTGA	2	10	50952	50961	20 %	60 %	20 %	0 %	386622455
26	NC_017646	CGGCG	2	10	51203	51212	0 %	0 %	60 %	40 %	386622455
27	NC_017646	AATCA	2	10	51485	51494	60 %	20 %	0 %	20 %	386622456
28	NC_017646	CGGTT	2	10	52440	52449	0 %	40 %	40 %	20 %	386622457
29	NC_017646	TGCAC	2	10	55893	55902	20 %	20 %	20 %	40 %	386622459
30	NC_017646	GAAAC	2	10	57825	57834	60 %	0 %	20 %	20 %	386622460
31	NC_017646	AACGT	2	10	60298	60307	40 %	20 %	20 %	20 %	386622464
32	NC_017646	GCGTC	2	10	63282	63291	0 %	20 %	40 %	40 %	386622467
33	NC_017646	ATGTT	2	10	64096	64105	20 %	60 %	20 %	0 %	386622468
34	NC_017646	CTTCG	2	10	64529	64538	0 %	40 %	20 %	40 %	386622468
35	NC_017646	TGCGT	2	10	64815	64824	0 %	40 %	40 %	20 %	386622468
36	NC_017646	AAAGT	2	10	70550	70559	60 %	20 %	20 %	0 %	386622471
37	NC_017646	GTGCT	2	10	71813	71822	0 %	40 %	40 %	20 %	386622472
38	NC_017646	GGTGA	2	10	72797	72806	20 %	20 %	60 %	0 %	386622472
39	NC_017646	CAGCG	2	10	74080	74089	20 %	0 %	40 %	40 %	386622474
40	NC_017646	TTGAT	2	10	76160	76169	20 %	60 %	20 %	0 %	386622475
41	NC_017646	TTTTC	2	10	79769	79778	0 %	80 %	0 %	20 %	386622477
42	NC_017646	AAAGC	2	10	80073	80082	60 %	0 %	20 %	20 %	386622478
43	NC_017646	GGCAA	2	10	85048	85057	40 %	0 %	40 %	20 %	386622483
44	NC_017646	TTGCT	2	10	85784	85793	0 %	60 %	20 %	20 %	386622484
45	NC_017646	GATGG	2	10	86520	86529	20 %	20 %	60 %	0 %	386622484
46	NC_017646	CCTGG	2	10	88773	88782	0 %	20 %	40 %	40 %	386622486
47	NC_017646	GACCG	2	10	91040	91049	20 %	0 %	40 %	40 %	386622488
48	NC_017646	ATGTT	2	10	93588	93597	20 %	60 %	20 %	0 %	386622489
49	NC_017646	AAAAC	2	10	94003	94012	80 %	0 %	0 %	20 %	386622489
50	NC_017646	TGCAT	2	10	94529	94538	20 %	40 %	20 %	20 %	386622490
51	NC_017646	ATTCC	2	10	94699	94708	20 %	40 %	0 %	40 %	386622490
52	NC_017646	AGTTC	2	10	99792	99801	20 %	40 %	20 %	20 %	386622495
53	NC_017646	TATCG	2	10	101672	101681	20 %	40 %	20 %	20 %	386622497
54	NC_017646	GGGCT	2	10	105544	105553	0 %	20 %	60 %	20 %	386622500
55	NC_017646	TCTGG	2	10	107251	107260	0 %	40 %	40 %	20 %	386622502
56	NC_017646	ACCGT	2	10	107917	107926	20 %	20 %	20 %	40 %	386622502
57	NC_017646	ATCAG	2	10	109690	109699	40 %	20 %	20 %	20 %	386622504
58	NC_017646	AGCCG	2	10	111458	111467	20 %	0 %	40 %	40 %	386622505
59	NC_017646	GCGCA	2	10	113786	113795	20 %	0 %	40 %	40 %	386622507
60	NC_017646	TGGCG	2	10	114781	114790	0 %	20 %	60 %	20 %	386622508
61	NC_017646	CGCGG	2	10	120957	120966	0 %	0 %	60 %	40 %	386622514
62	NC_017646	CATCG	2	10	123214	123223	20 %	20 %	20 %	40 %	386622517
63	NC_017646	TAACG	2	10	123908	123917	40 %	20 %	20 %	20 %	386622517
64	NC_017646	ATGCC	2	10	124367	124376	20 %	20 %	20 %	40 %	386622517
65	NC_017646	AATGC	2	10	125650	125659	40 %	20 %	20 %	20 %	386622518
66	NC_017646	TCTGT	2	10	126596	126605	0 %	60 %	20 %	20 %	386622520
67	NC_017646	AGCAG	2	10	129027	129036	40 %	0 %	40 %	20 %	386622523
68	NC_017646	CGAAG	2	10	130942	130951	40 %	0 %	40 %	20 %	386622524
69	NC_017646	ACACG	2	10	131075	131084	40 %	0 %	20 %	40 %	386622524
70	NC_017646	TCGCG	2	10	131336	131345	0 %	20 %	40 %	40 %	386622524
71	NC_017646	GCATC	2	10	131426	131435	20 %	20 %	20 %	40 %	386622524
72	NC_017646	GACTG	2	10	132744	132753	20 %	20 %	40 %	20 %	386622525
73	NC_017646	AGAGC	2	10	133154	133163	40 %	0 %	40 %	20 %	386622525
74	NC_017646	AGGCG	2	10	138310	138319	20 %	0 %	60 %	20 %	386622527
75	NC_017646	TCTGG	2	10	141709	141718	0 %	40 %	40 %	20 %	386622528
76	NC_017646	GGGCA	2	10	143120	143129	20 %	0 %	60 %	20 %	386622529
77	NC_017646	CAGCG	2	10	143399	143408	20 %	0 %	40 %	40 %	386622530
78	NC_017646	ACGAC	2	10	144679	144688	40 %	0 %	20 %	40 %	386622531
79	NC_017646	TTCAG	2	10	148867	148876	20 %	40 %	20 %	20 %	386622534
80	NC_017646	AGCGC	2	10	149437	149446	20 %	0 %	40 %	40 %	386622534
81	NC_017646	CCGTC	2	10	150229	150238	0 %	20 %	20 %	60 %	386622535
82	NC_017646	GTGAA	2	10	150239	150248	40 %	20 %	40 %	0 %	386622535
83	NC_017646	GTTCA	2	10	150626	150635	20 %	40 %	20 %	20 %	386622536
84	NC_017646	ATCCA	2	10	150952	150961	40 %	20 %	0 %	40 %	386622536
85	NC_017646	TTTAT	2	10	152216	152225	20 %	80 %	0 %	0 %	386622538
86	NC_017646	ATTTG	2	10	152828	152837	20 %	60 %	20 %	0 %	386622538
87	NC_017646	CGGGC	2	10	153630	153639	0 %	0 %	60 %	40 %	386622540
88	NC_017646	TTTCA	2	10	154755	154764	20 %	60 %	0 %	20 %	386622541
89	NC_017646	GCGAG	2	10	168482	168491	20 %	0 %	60 %	20 %	386622556
90	NC_017646	TGGCG	2	10	168919	168928	0 %	20 %	60 %	20 %	386622556
91	NC_017646	ACCAC	2	10	171823	171832	40 %	0 %	0 %	60 %	386622560
92	NC_017646	GGCGT	2	10	173526	173535	0 %	20 %	60 %	20 %	386622561
93	NC_017646	CTGCG	2	10	176599	176608	0 %	20 %	40 %	40 %	386622562
94	NC_017646	GCAAA	2	10	178631	178640	60 %	0 %	20 %	20 %	386622563
95	NC_017646	TGGCG	2	10	178977	178986	0 %	20 %	60 %	20 %	386622563
96	NC_017646	AACCT	2	10	180794	180803	40 %	20 %	0 %	40 %	386622565
97	NC_017646	TGGTC	2	10	180836	180845	0 %	40 %	40 %	20 %	386622565
98	NC_017646	TGGCG	2	10	182081	182090	0 %	20 %	60 %	20 %	386622566
99	NC_017646	CGGCG	2	10	182711	182720	0 %	0 %	60 %	40 %	386622566
100	NC_017646	TTCCA	2	10	183322	183331	20 %	40 %	0 %	40 %	386622566
101	NC_017646	GGTCC	2	10	187645	187654	0 %	20 %	40 %	40 %	386622571
102	NC_017646	ACGGG	2	10	189562	189571	20 %	0 %	60 %	20 %	386622573
103	NC_017646	GTGAT	2	10	191721	191730	20 %	40 %	40 %	0 %	386622574
104	NC_017646	GTGAT	2	10	192012	192021	20 %	40 %	40 %	0 %	386622574
105	NC_017646	GCCAG	2	10	195696	195705	20 %	0 %	40 %	40 %	386622578
106	NC_017646	GCTGT	2	10	196050	196059	0 %	40 %	40 %	20 %	386622578
107	NC_017646	GGCGT	2	10	196534	196543	0 %	20 %	60 %	20 %	386622578
108	NC_017646	GTTCT	2	10	197137	197146	0 %	60 %	20 %	20 %	386622578
109	NC_017646	CTGAA	2	10	199129	199138	40 %	20 %	20 %	20 %	386622580
110	NC_017646	AAGCG	2	10	199193	199202	40 %	0 %	40 %	20 %	386622580
111	NC_017646	TGGTG	2	10	200976	200985	0 %	40 %	60 %	0 %	386622582
112	NC_017646	TGCAC	2	10	201102	201111	20 %	20 %	20 %	40 %	386622582
113	NC_017646	TGCGC	2	10	201495	201504	0 %	20 %	40 %	40 %	386622582
114	NC_017646	CATGG	2	10	203196	203205	20 %	20 %	40 %	20 %	386622584
115	NC_017646	CAGAT	2	10	204235	204244	40 %	20 %	20 %	20 %	386622585
116	NC_017646	ACTTT	2	10	204368	204377	20 %	60 %	0 %	20 %	386622585
117	NC_017646	GACGT	2	10	208288	208297	20 %	20 %	40 %	20 %	386622588
118	NC_017646	CGACG	2	10	210115	210124	20 %	0 %	40 %	40 %	386622590
119	NC_017646	ATGCC	2	10	212683	212692	20 %	20 %	20 %	40 %	386622593
120	NC_017646	TGGCC	2	10	214009	214018	0 %	20 %	40 %	40 %	386622595
121	NC_017646	ACCGC	2	10	214022	214031	20 %	0 %	20 %	60 %	386622595
122	NC_017646	AGCCG	2	10	215380	215389	20 %	0 %	40 %	40 %	386622595
123	NC_017646	GGTGG	2	10	215489	215498	0 %	20 %	80 %	0 %	386622595
124	NC_017646	ACGGT	2	10	227635	227644	20 %	20 %	40 %	20 %	386622608
125	NC_017646	AGCTC	2	10	228323	228332	20 %	20 %	20 %	40 %	386622608
126	NC_017646	TGATT	2	10	230476	230485	20 %	60 %	20 %	0 %	386622611
127	NC_017646	GTGAA	2	10	242295	242304	40 %	20 %	40 %	0 %	386622618
128	NC_017646	TAATT	2	10	242479	242488	40 %	60 %	0 %	0 %	386622618
129	NC_017646	ACTGG	2	10	245418	245427	20 %	20 %	40 %	20 %	386622621
130	NC_017646	CGCGG	2	10	246463	246472	0 %	0 %	60 %	40 %	386622623
131	NC_017646	AAACG	2	10	253464	253473	60 %	0 %	20 %	20 %	386622629
132	NC_017646	TTGCT	2	10	254469	254478	0 %	60 %	20 %	20 %	386622632
133	NC_017646	AGGGA	2	10	257299	257308	40 %	0 %	60 %	0 %	386622634
134	NC_017646	CGATG	2	10	258114	258123	20 %	20 %	40 %	20 %	386622635
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151	NC_017646	ACCTT	2	10	287571	287580	20 %	40 %	0 %	40 %	386622663
152	NC_017646	TACCG	2	10	294088	294097	20 %	20 %	20 %	40 %	386622665
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248	NC_017646	TTAAG	2	10	469345	469354	40 %	40 %	20 %	0 %	386622834
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250	NC_017646	GTTCC	2	10	476867	476876	0 %	40 %	20 %	40 %	386622840
251	NC_017646	CGCTG	2	10	478347	478356	0 %	20 %	40 %	40 %	386622841
252	NC_017646	ATCGT	2	10	482489	482498	20 %	40 %	20 %	20 %	386622845
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254	NC_017646	AAATA	2	10	484563	484572	80 %	20 %	0 %	0 %	386622847
255	NC_017646	CTTCT	2	10	486818	486827	0 %	60 %	0 %	40 %	386622849
256	NC_017646	CCAGC	2	10	487712	487721	20 %	0 %	20 %	60 %	386622849
257	NC_017646	GGCGT	2	10	489741	489750	0 %	20 %	60 %	20 %	386622851
258	NC_017646	GAAGC	2	10	490305	490314	40 %	0 %	40 %	20 %	386622851
259	NC_017646	AGGTG	2	10	491354	491363	20 %	20 %	60 %	0 %	386622851
260	NC_017646	ATCGG	2	10	491623	491632	20 %	20 %	40 %	20 %	386622852
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