MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017645	CAAAGA	2	12	1189	1200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386617345
2	NC_017645	GGTGAA	2	12	1408	1419	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386617345
3	NC_017645	TGCCAA	2	12	3545	3556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617347
4	NC_017645	GAGCTT	2	12	7637	7648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386617353
5	NC_017645	ACGGCC	2	12	18044	18055	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386617372
6	NC_017645	TGCTTT	2	12	18133	18144	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386617372
7	NC_017645	CAGAGC	2	12	20207	20218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017645	CGGGAT	2	12	22934	22945	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386617378
9	NC_017645	GGGGCA	2	12	24114	24125	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386617378
10	NC_017645	TCGCCG	2	12	26853	26864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386617381
11	NC_017645	CGGGAT	2	12	27218	27229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017645	CCCGAA	2	12	28114	28125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386617382
13	NC_017645	ACTACG	2	12	33561	33572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617389
14	NC_017645	GGAAGC	2	12	37936	37947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386617395
15	NC_017645	CCGGAG	2	12	43643	43654	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386617404
16	NC_017645	GAACTC	2	12	44170	44181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617404
17	NC_017645	GCCTTT	2	12	45899	45910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386617405
18	NC_017645	GATGGC	2	12	49544	49555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386617407
19	NC_017645	GAAAGC	2	12	54133	54144	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017645	AGCGGA	2	12	58155	58166	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386617418
21	NC_017645	CTCTTC	2	12	58525	58536	0 %	50 %	0 %	50 %	386617419
22	NC_017645	ACTTCA	2	12	59430	59441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017645	ATTGAT	2	12	59521	59532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386617420
24	NC_017645	GCCGTT	2	12	60867	60878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617421
25	NC_017645	TTGCGC	2	12	61537	61548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617421
26	NC_017645	GCATGG	2	12	69458	69469	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386617426
27	NC_017645	GGGACC	2	12	71148	71159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386617427
28	NC_017645	CAATCG	2	12	72351	72362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617428
29	NC_017645	GACAAA	2	12	74234	74245	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386617430
30	NC_017645	AGGTAG	2	12	79132	79143	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386617434
31	NC_017645	TGCCGG	2	12	89103	89114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386617443
32	NC_017645	CGCAAT	2	12	91242	91253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017645	GCGAGA	2	12	114692	114703	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386617472
34	NC_017645	ATTCAA	2	12	116061	116072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017645	GAATGG	2	12	117066	117077	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386617474
36	NC_017645	GCGAGA	2	12	117803	117814	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386617475
37	NC_017645	TGCCTG	2	12	121281	121292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617480
38	NC_017645	CGTGGG	2	12	125317	125328	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386617483
39	NC_017645	GACAGG	2	12	128238	128249	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386617485
40	NC_017645	GAGCGT	2	12	129728	129739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386617488
41	NC_017645	AGCTTA	2	12	131883	131894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017645	GGTGCT	2	12	134786	134797	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386617493
43	NC_017645	TCCAGT	2	12	136329	136340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386617494
44	NC_017645	CAGTAC	2	12	136391	136402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617494
45	NC_017645	GCTATG	2	12	138483	138494	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386617494
46	NC_017645	GCCGCA	2	12	140321	140332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017645	AAACAA	2	12	141933	141944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386617497
48	NC_017645	CCCCTC	2	12	145360	145371	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
49	NC_017645	CACCGG	2	12	151994	152005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386617508
50	NC_017645	CCTTGG	2	12	157106	157117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617511

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.