MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017645	AAAAG	2	10	642	651	80 %	0 %	20 %	0 %	386617343
2	NC_017645	GCCCT	2	10	949	958	0 %	20 %	20 %	60 %	386617344
3	NC_017645	CGGAG	2	10	4715	4724	20 %	0 %	60 %	20 %	386617348
4	NC_017645	GTCAT	2	10	5819	5828	20 %	40 %	20 %	20 %	386617350
5	NC_017645	ACCAA	2	10	6463	6472	60 %	0 %	0 %	40 %	386617351
6	NC_017645	TTCCC	2	10	7462	7471	0 %	40 %	0 %	60 %	386617353
7	NC_017645	GCTGA	2	10	7679	7688	20 %	20 %	40 %	20 %	386617354
8	NC_017645	CAAAG	2	10	7843	7852	60 %	0 %	20 %	20 %	386617354
9	NC_017645	GTCAG	2	10	8063	8072	20 %	20 %	40 %	20 %	386617354
10	NC_017645	TCTGT	2	10	11388	11397	0 %	60 %	20 %	20 %	386617359
11	NC_017645	AGGTT	2	10	13485	13494	20 %	40 %	40 %	0 %	386617362
12	NC_017645	AGCAA	2	10	14115	14124	60 %	0 %	20 %	20 %	386617363
13	NC_017645	CTTTG	2	10	15215	15224	0 %	60 %	20 %	20 %	386617366
14	NC_017645	TCAGA	2	10	15695	15704	40 %	20 %	20 %	20 %	386617367
15	NC_017645	GGCCT	2	10	19211	19220	0 %	20 %	40 %	40 %	386617374
16	NC_017645	GAGCA	2	10	19400	19409	40 %	0 %	40 %	20 %	386617374
17	NC_017645	TGCTC	2	10	20840	20849	0 %	40 %	20 %	40 %	386617375
18	NC_017645	AGGCC	2	10	21029	21038	20 %	0 %	40 %	40 %	386617375
19	NC_017645	GCCCT	2	10	21573	21582	0 %	20 %	20 %	60 %	386617376
20	NC_017645	GCGCC	2	10	22256	22265	0 %	0 %	40 %	60 %	386617377
21	NC_017645	CGAAG	2	10	22373	22382	40 %	0 %	40 %	20 %	386617377
22	NC_017645	GCCGG	2	10	24699	24708	0 %	0 %	60 %	40 %	386617379
23	NC_017645	GATCG	2	10	24841	24850	20 %	20 %	40 %	20 %	386617379
24	NC_017645	TCGGA	2	10	25059	25068	20 %	20 %	40 %	20 %	386617379
25	NC_017645	TCAAG	2	10	26119	26128	40 %	20 %	20 %	20 %	386617380
26	NC_017645	GTTCA	2	10	26843	26852	20 %	40 %	20 %	20 %	386617381
27	NC_017645	AAAGG	2	10	28254	28263	60 %	0 %	40 %	0 %	386617382
28	NC_017645	GCTTC	2	10	28995	29004	0 %	40 %	20 %	40 %	386617383
29	NC_017645	CTCCC	2	10	30516	30525	0 %	20 %	0 %	80 %	386617384
30	NC_017645	AAGGC	2	10	30748	30757	40 %	0 %	40 %	20 %	386617385
31	NC_017645	CGATG	2	10	32957	32966	20 %	20 %	40 %	20 %	386617388
32	NC_017645	TGACT	2	10	34327	34336	20 %	40 %	20 %	20 %	386617390
33	NC_017645	GAAAA	2	10	35224	35233	80 %	0 %	20 %	0 %	386617391
34	NC_017645	AGGGG	2	10	39495	39504	20 %	0 %	80 %	0 %	386617399
35	NC_017645	GATCA	2	10	42389	42398	40 %	20 %	20 %	20 %	386617402
36	NC_017645	GCCGA	2	10	43053	43062	20 %	0 %	40 %	40 %	386617403
37	NC_017645	TTTCC	2	10	43316	43325	0 %	60 %	0 %	40 %	386617404
38	NC_017645	AGGGG	2	10	44562	44571	20 %	0 %	80 %	0 %	386617404
39	NC_017645	TGGTT	2	10	44587	44596	0 %	60 %	40 %	0 %	386617404
40	NC_017645	GCAAA	2	10	47912	47921	60 %	0 %	20 %	20 %	386617406
41	NC_017645	ATCTG	2	10	50603	50612	20 %	40 %	20 %	20 %	386617407
42	NC_017645	CCCAG	2	10	51143	51152	20 %	0 %	20 %	60 %	386617407
43	NC_017645	AGAGC	2	10	51242	51251	40 %	0 %	40 %	20 %	386617407
44	NC_017645	AGCTG	2	10	51413	51422	20 %	20 %	40 %	20 %	386617408
45	NC_017645	CGAAA	2	10	52856	52865	60 %	0 %	20 %	20 %	386617410
46	NC_017645	CCGAA	2	10	55896	55905	40 %	0 %	20 %	40 %	386617416
47	NC_017645	GAAGC	2	10	57500	57509	40 %	0 %	40 %	20 %	386617417
48	NC_017645	ATCGC	2	10	57753	57762	20 %	20 %	20 %	40 %	386617417
49	NC_017645	CTCAC	2	10	59854	59863	20 %	20 %	0 %	60 %	386617420
50	NC_017645	ATGAA	2	10	62407	62416	60 %	20 %	20 %	0 %	386617422
51	NC_017645	CCAAC	2	10	63682	63691	40 %	0 %	0 %	60 %	386617425
52	NC_017645	TACAG	2	10	63917	63926	40 %	20 %	20 %	20 %	386617425
53	NC_017645	CAAAG	2	10	64106	64115	60 %	0 %	20 %	20 %	386617425
54	NC_017645	GGATG	2	10	65618	65627	20 %	20 %	60 %	0 %	386617425
55	NC_017645	GCCAG	2	10	65810	65819	20 %	0 %	40 %	40 %	386617425
56	NC_017645	GCTGG	2	10	66204	66213	0 %	20 %	60 %	20 %	386617425
57	NC_017645	TCATT	2	10	69774	69783	20 %	60 %	0 %	20 %	386617426
58	NC_017645	CGTTC	2	10	69795	69804	0 %	40 %	20 %	40 %	386617426
59	NC_017645	CCAAG	2	10	72876	72885	40 %	0 %	20 %	40 %	386617429
60	NC_017645	GATCA	2	10	73147	73156	40 %	20 %	20 %	20 %	386617429
61	NC_017645	GAAGA	2	10	73892	73901	60 %	0 %	40 %	0 %	386617430
62	NC_017645	CGACC	2	10	75593	75602	20 %	0 %	20 %	60 %	386617432
63	NC_017645	GGTTT	2	10	83755	83764	0 %	60 %	40 %	0 %	386617438
64	NC_017645	ATCTC	2	10	87350	87359	20 %	40 %	0 %	40 %	386617442
65	NC_017645	CGAGG	2	10	87898	87907	20 %	0 %	60 %	20 %	386617442
66	NC_017645	TCGAT	2	10	90742	90751	20 %	40 %	20 %	20 %	386617445
67	NC_017645	GTCTG	2	10	90759	90768	0 %	40 %	40 %	20 %	386617445
68	NC_017645	ACGAA	2	10	95646	95655	60 %	0 %	20 %	20 %	386617453
69	NC_017645	CAAAG	2	10	97689	97698	60 %	0 %	20 %	20 %	386617455
70	NC_017645	GTTGG	2	10	100230	100239	0 %	40 %	60 %	0 %	386617458
71	NC_017645	TTCGG	2	10	101020	101029	0 %	40 %	40 %	20 %	386617458
72	NC_017645	AATCC	2	10	102837	102846	40 %	20 %	0 %	40 %	386617459
73	NC_017645	CTTGG	2	10	103626	103635	0 %	40 %	40 %	20 %	386617462
74	NC_017645	GAGAA	2	10	106860	106869	60 %	0 %	40 %	0 %	386617465
75	NC_017645	GCCGT	2	10	109602	109611	0 %	20 %	40 %	40 %	386617468
76	NC_017645	GCGAA	2	10	110115	110124	40 %	0 %	40 %	20 %	386617468
77	NC_017645	AGCGC	2	10	111025	111034	20 %	0 %	40 %	40 %	386617468
78	NC_017645	GTTCG	2	10	114212	114221	0 %	40 %	40 %	20 %	386617471
79	NC_017645	ATTTT	2	10	118614	118623	20 %	80 %	0 %	0 %	386617476
80	NC_017645	CAGCG	2	10	119206	119215	20 %	0 %	40 %	40 %	386617477
81	NC_017645	GGGAT	2	10	119349	119358	20 %	20 %	60 %	0 %	386617477
82	NC_017645	TGCCA	2	10	121555	121564	20 %	20 %	20 %	40 %	386617480
83	NC_017645	GAGCA	2	10	126448	126457	40 %	0 %	40 %	20 %	386617484
84	NC_017645	TGGTC	2	10	127498	127507	0 %	40 %	40 %	20 %	386617485
85	NC_017645	TGCCA	2	10	127815	127824	20 %	20 %	20 %	40 %	386617485
86	NC_017645	CGAGG	2	10	131788	131797	20 %	0 %	60 %	20 %	386617490
87	NC_017645	AAGGG	2	10	135645	135654	40 %	0 %	60 %	0 %	386617494
88	NC_017645	ATCAC	2	10	136263	136272	40 %	20 %	0 %	40 %	386617494
89	NC_017645	CCGAC	2	10	139176	139185	20 %	0 %	20 %	60 %	386617494
90	NC_017645	CGGCA	2	10	144449	144458	20 %	0 %	40 %	40 %	386617500
91	NC_017645	CAAAG	2	10	144608	144617	60 %	0 %	20 %	20 %	386617500
92	NC_017645	CCAAA	2	10	149625	149634	60 %	0 %	0 %	40 %	386617506
93	NC_017645	GAAGC	2	10	149645	149654	40 %	0 %	40 %	20 %	386617506
94	NC_017645	AATGA	2	10	150597	150606	60 %	20 %	20 %	0 %	386617507
95	NC_017645	CAACA	2	10	150608	150617	60 %	0 %	0 %	40 %	386617507
96	NC_017645	GCAAA	2	10	152082	152091	60 %	0 %	20 %	20 %	386617508
97	NC_017645	GCCGC	2	10	154251	154260	0 %	0 %	40 %	60 %	386617508
98	NC_017645	CAGGT	2	10	154510	154519	20 %	20 %	40 %	20 %	386617508
99	NC_017645	CTGAA	2	10	154714	154723	40 %	20 %	20 %	20 %	386617508
100	NC_017645	CTTTT	2	10	158896	158905	0 %	80 %	0 %	20 %	386617514

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.