MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017645	AGAT	2	8	178	185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017645	AGAT	2	8	271	278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017645	AAAG	2	8	2267	2274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017645	CAGG	2	8	2331	2338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017645	AATA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017645	TGGT	2	8	6845	6852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017645	GAAG	2	8	13300	13307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017645	AAAC	2	8	14049	14056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017645	CTTA	2	8	15413	15420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017645	AGTA	2	8	15493	15500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017645	TTCA	2	8	17919	17926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017645	CTTT	2	8	18964	18971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017645	CTGG	2	8	22799	22806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017645	GGCA	2	8	22821	22828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017645	TGTA	2	8	22870	22877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017645	CTGG	2	8	27083	27090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017645	GGCA	2	8	27105	27112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017645	TGTA	2	8	27154	27161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017645	CACT	2	8	29324	29331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017645	GTTT	2	8	33063	33070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017645	CCTG	2	8	36242	36249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017645	TTAT	2	8	36468	36475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017645	AGAT	2	8	42131	42138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017645	GCGA	2	8	42165	42172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017645	TTCA	2	8	54153	54160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017645	GAAA	2	8	59049	59056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017645	TTCT	2	8	61901	61908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017645	AAAC	2	8	80842	80849	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017645	AGGG	2	8	81471	81478	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017645	AAAC	2	8	81886	81893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017645	AAAC	2	8	86721	86728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017645	AAAC	2	8	90553	90560	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017645	GGCT	2	8	94388	94395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017645	CAAA	2	8	94966	94973	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017645	GCTG	2	8	98737	98744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017645	AAAC	2	8	98749	98756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017645	CAAA	2	8	101940	101947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017645	CCAA	2	8	102212	102219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017645	AAAC	2	8	105006	105013	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017645	CAGC	2	8	105230	105237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017645	GCTT	2	8	108172	108179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017645	ATGA	2	8	108346	108353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017645	TAAA	2	8	109450	109457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017645	TTCA	2	8	115968	115975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017645	TCGG	2	8	117541	117548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017645	ACCC	2	8	120808	120815	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017645	CTGC	2	8	125752	125759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017645	TTTA	2	8	132386	132393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017645	CTCC	2	8	132406	132413	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017645	CAAG	2	8	133663	133670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017645	ATCT	2	8	134142	134149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017645	CATA	2	8	140382	140389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017645	CAAG	2	8	140440	140447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017645	CTGT	2	8	140591	140598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017645	TAAA	2	8	141507	141514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017645	ACGA	2	8	141718	141725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017645	ACAA	2	8	142756	142763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017645	GCTC	2	8	142847	142854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017645	GCAG	2	8	142913	142920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017645	ACCA	2	8	155538	155545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017645	CAAA	2	8	156133	156140	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017645	TTGC	2	8	160435	160442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.