MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017645	AAGA	2	8	710	717	75 %	0 %	25 %	0 %	386617343
2	NC_017645	GCCA	2	8	936	943	25 %	0 %	25 %	50 %	386617344
3	NC_017645	AAGA	2	8	1271	1278	75 %	0 %	25 %	0 %	386617345
4	NC_017645	GCCA	2	8	1420	1427	25 %	0 %	25 %	50 %	386617345
5	NC_017645	GCTC	2	8	2008	2015	0 %	25 %	25 %	50 %	386617345
6	NC_017645	GATC	2	8	3393	3400	25 %	25 %	25 %	25 %	386617347
7	NC_017645	AACG	2	8	3435	3442	50 %	0 %	25 %	25 %	386617347
8	NC_017645	ACTC	2	8	3503	3510	25 %	25 %	0 %	50 %	386617347
9	NC_017645	ATCC	2	8	3627	3634	25 %	25 %	0 %	50 %	386617347
10	NC_017645	ATCA	2	8	3727	3734	50 %	25 %	0 %	25 %	386617348
11	NC_017645	ATCC	2	8	5204	5211	25 %	25 %	0 %	50 %	386617349
12	NC_017645	TTGG	2	8	6013	6020	0 %	50 %	50 %	0 %	386617350
13	NC_017645	ATCC	2	8	6710	6717	25 %	25 %	0 %	50 %	386617351
14	NC_017645	TGGC	2	8	7478	7485	0 %	25 %	50 %	25 %	386617353
15	NC_017645	TCCA	2	8	8785	8792	25 %	25 %	0 %	50 %	386617355
16	NC_017645	TGAT	2	8	9296	9303	25 %	50 %	25 %	0 %	386617355
17	NC_017645	CAAA	2	8	9876	9883	75 %	0 %	0 %	25 %	386617356
18	NC_017645	TGGT	2	8	10511	10518	0 %	50 %	50 %	0 %	386617357
19	NC_017645	TGCC	2	8	11470	11477	0 %	25 %	25 %	50 %	386617359
20	NC_017645	CTAT	2	8	12143	12150	25 %	50 %	0 %	25 %	386617360
21	NC_017645	TCAT	2	8	12485	12492	25 %	50 %	0 %	25 %	386617361
22	NC_017645	GTTC	2	8	12555	12562	0 %	50 %	25 %	25 %	386617361
23	NC_017645	ATGG	2	8	12658	12665	25 %	25 %	50 %	0 %	386617361
24	NC_017645	TGCT	2	8	13030	13037	0 %	50 %	25 %	25 %	386617361
25	NC_017645	TGGA	2	8	13468	13475	25 %	25 %	50 %	0 %	386617362
26	NC_017645	CTGA	2	8	13617	13624	25 %	25 %	25 %	25 %	386617362
27	NC_017645	GAAC	2	8	14560	14567	50 %	0 %	25 %	25 %	386617364
28	NC_017645	TGAA	2	8	15564	15571	50 %	25 %	25 %	0 %	386617367
29	NC_017645	TGGC	2	8	16259	16266	0 %	25 %	50 %	25 %	386617368
30	NC_017645	GAGC	2	8	16982	16989	25 %	0 %	50 %	25 %	386617369
31	NC_017645	GCAA	2	8	17282	17289	50 %	0 %	25 %	25 %	386617370
32	NC_017645	GGAG	2	8	18107	18114	25 %	0 %	75 %	0 %	386617372
33	NC_017645	CGAC	2	8	18150	18157	25 %	0 %	25 %	50 %	386617372
34	NC_017645	GGAT	2	8	18841	18848	25 %	25 %	50 %	0 %	386617373
35	NC_017645	GGCG	2	8	19424	19431	0 %	0 %	75 %	25 %	386617374
36	NC_017645	CAGC	2	8	19741	19748	25 %	0 %	25 %	50 %	386617374
37	NC_017645	GCTG	2	8	20501	20508	0 %	25 %	50 %	25 %	386617375
38	NC_017645	CTCG	2	8	21389	21396	0 %	25 %	25 %	50 %	386617376
39	NC_017645	GCGG	2	8	23094	23101	0 %	0 %	75 %	25 %	386617378
40	NC_017645	GGGT	2	8	23330	23337	0 %	25 %	75 %	0 %	386617378
41	NC_017645	GGGT	2	8	23589	23596	0 %	25 %	75 %	0 %	386617378
42	NC_017645	TGAC	2	8	24391	24398	25 %	25 %	25 %	25 %	386617378
43	NC_017645	GCCG	2	8	24782	24789	0 %	0 %	50 %	50 %	386617379
44	NC_017645	AACA	2	8	24833	24840	75 %	0 %	0 %	25 %	386617379
45	NC_017645	CTGG	2	8	24862	24869	0 %	25 %	50 %	25 %	386617379
46	NC_017645	ACGG	2	8	25106	25113	25 %	0 %	50 %	25 %	386617379
47	NC_017645	CAGA	2	8	25746	25753	50 %	0 %	25 %	25 %	386617380
48	NC_017645	CGGT	2	8	26478	26485	0 %	25 %	50 %	25 %	386617380
49	NC_017645	GCAG	2	8	27002	27009	25 %	0 %	50 %	25 %	386617381
50	NC_017645	GGCA	2	8	27395	27402	25 %	0 %	50 %	25 %	386617382
51	NC_017645	CCTG	2	8	27561	27568	0 %	25 %	25 %	50 %	386617382
52	NC_017645	TTGC	2	8	27576	27583	0 %	50 %	25 %	25 %	386617382
53	NC_017645	AAGC	2	8	27609	27616	50 %	0 %	25 %	25 %	386617382
54	NC_017645	CCAT	2	8	27636	27643	25 %	25 %	0 %	50 %	386617382
55	NC_017645	CGGC	2	8	27852	27859	0 %	0 %	50 %	50 %	386617382
56	NC_017645	AGCG	2	8	27940	27947	25 %	0 %	50 %	25 %	386617382
57	NC_017645	CGGC	2	8	27970	27977	0 %	0 %	50 %	50 %	386617382
58	NC_017645	CAGG	2	8	28905	28912	25 %	0 %	50 %	25 %	386617383
59	NC_017645	CCAG	2	8	30156	30163	25 %	0 %	25 %	50 %	386617384
60	NC_017645	CAGA	2	8	31235	31242	50 %	0 %	25 %	25 %	386617385
61	NC_017645	TTTC	2	8	31595	31602	0 %	75 %	0 %	25 %	386617387
62	NC_017645	ACAG	2	8	31765	31772	50 %	0 %	25 %	25 %	386617387
63	NC_017645	CTGC	2	8	31985	31992	0 %	25 %	25 %	50 %	386617387
64	NC_017645	CGAG	2	8	32141	32148	25 %	0 %	50 %	25 %	386617387
65	NC_017645	AAAG	2	8	33280	33287	75 %	0 %	25 %	0 %	386617389
66	NC_017645	ATGG	2	8	33302	33309	25 %	25 %	50 %	0 %	386617389
67	NC_017645	TCAT	2	8	33459	33466	25 %	50 %	0 %	25 %	386617389
68	NC_017645	TGAT	2	8	33576	33583	25 %	50 %	25 %	0 %	386617389
69	NC_017645	TGAA	2	8	34542	34549	50 %	25 %	25 %	0 %	386617390
70	NC_017645	ACTG	2	8	34663	34670	25 %	25 %	25 %	25 %	386617390
71	NC_017645	GACC	2	8	35035	35042	25 %	0 %	25 %	50 %	386617390
72	NC_017645	GAAT	2	8	35355	35362	50 %	25 %	25 %	0 %	386617391
73	NC_017645	TCCA	2	8	35767	35774	25 %	25 %	0 %	50 %	386617392
74	NC_017645	AGCA	2	8	36733	36740	50 %	0 %	25 %	25 %	386617393
75	NC_017645	AGGC	2	8	36983	36990	25 %	0 %	50 %	25 %	386617393
76	NC_017645	CAAA	2	8	37483	37490	75 %	0 %	0 %	25 %	386617395
77	NC_017645	GTTC	2	8	37612	37619	0 %	50 %	25 %	25 %	386617395
78	NC_017645	AAGG	2	8	38651	38658	50 %	0 %	50 %	0 %	386617397
79	NC_017645	GAAA	2	8	38826	38833	75 %	0 %	25 %	0 %	386617397
80	NC_017645	TGGT	2	8	39078	39085	0 %	50 %	50 %	0 %	386617398
81	NC_017645	CAGA	2	8	39238	39245	50 %	0 %	25 %	25 %	386617398
82	NC_017645	GTTC	2	8	40329	40336	0 %	50 %	25 %	25 %	386617399
83	NC_017645	AAGG	2	8	40768	40775	50 %	0 %	50 %	0 %	386617399
84	NC_017645	CTCG	2	8	41523	41530	0 %	25 %	25 %	50 %	386617401
85	NC_017645	CCAT	2	8	42606	42613	25 %	25 %	0 %	50 %	386617402
86	NC_017645	AGAC	2	8	43629	43636	50 %	0 %	25 %	25 %	386617404
87	NC_017645	TTTG	2	8	43857	43864	0 %	75 %	25 %	0 %	386617404
88	NC_017645	GCAA	2	8	43907	43914	50 %	0 %	25 %	25 %	386617404
89	NC_017645	TTTG	2	8	43951	43958	0 %	75 %	25 %	0 %	386617404
90	NC_017645	CAAA	2	8	44079	44086	75 %	0 %	0 %	25 %	386617404
91	NC_017645	GCCA	2	8	44344	44351	25 %	0 %	25 %	50 %	386617404
92	NC_017645	ACAA	2	8	44803	44810	75 %	0 %	0 %	25 %	386617404
93	NC_017645	ACCA	2	8	44909	44916	50 %	0 %	0 %	50 %	386617404
94	NC_017645	CAAA	2	8	45022	45029	75 %	0 %	0 %	25 %	386617404
95	NC_017645	AGGG	2	8	45211	45218	25 %	0 %	75 %	0 %	386617404
96	NC_017645	GCCA	2	8	45358	45365	25 %	0 %	25 %	50 %	386617404
97	NC_017645	CAGC	2	8	48107	48114	25 %	0 %	25 %	50 %	386617406
98	NC_017645	CTGA	2	8	48286	48293	25 %	25 %	25 %	25 %	386617406
99	NC_017645	AACA	2	8	48302	48309	75 %	0 %	0 %	25 %	386617406
100	NC_017645	GCAA	2	8	48748	48755	50 %	0 %	25 %	25 %	386617406
101	NC_017645	AAAC	2	8	49085	49092	75 %	0 %	0 %	25 %	386617406
102	NC_017645	GGCT	2	8	49449	49456	0 %	25 %	50 %	25 %	386617407
103	NC_017645	GGCA	2	8	50212	50219	25 %	0 %	50 %	25 %	386617407
104	NC_017645	TGGT	2	8	50701	50708	0 %	50 %	50 %	0 %	386617407
105	NC_017645	ATGA	2	8	51322	51329	50 %	25 %	25 %	0 %	386617408
106	NC_017645	CAGC	2	8	51498	51505	25 %	0 %	25 %	50 %	386617408
107	NC_017645	GACA	2	8	51874	51881	50 %	0 %	25 %	25 %	386617409
108	NC_017645	AGGG	2	8	52422	52429	25 %	0 %	75 %	0 %	386617409
109	NC_017645	TTGC	2	8	52572	52579	0 %	50 %	25 %	25 %	386617410
110	NC_017645	GCTG	2	8	53131	53138	0 %	25 %	50 %	25 %	386617411
111	NC_017645	GGTT	2	8	53487	53494	0 %	50 %	50 %	0 %	386617412
112	NC_017645	AGCA	2	8	53879	53886	50 %	0 %	25 %	25 %	386617412
113	NC_017645	AACC	2	8	54923	54930	50 %	0 %	0 %	50 %	386617414
114	NC_017645	GGAT	2	8	54959	54966	25 %	25 %	50 %	0 %	386617414
115	NC_017645	TGAT	2	8	55368	55375	25 %	50 %	25 %	0 %	386617415
116	NC_017645	TGAA	2	8	55828	55835	50 %	25 %	25 %	0 %	386617416
117	NC_017645	AGCC	2	8	56193	56200	25 %	0 %	25 %	50 %	386617416
118	NC_017645	CGGT	2	8	56217	56224	0 %	25 %	50 %	25 %	386617416
119	NC_017645	AAGA	2	8	56687	56694	75 %	0 %	25 %	0 %	386617417
120	NC_017645	AAGA	2	8	56837	56844	75 %	0 %	25 %	0 %	386617417
121	NC_017645	TCTA	2	8	57242	57249	25 %	50 %	0 %	25 %	386617417
122	NC_017645	AGCG	2	8	57441	57448	25 %	0 %	50 %	25 %	386617417
123	NC_017645	GGGT	2	8	57977	57984	0 %	25 %	75 %	0 %	386617418
124	NC_017645	GGTG	2	8	58373	58380	0 %	25 %	75 %	0 %	386617418
125	NC_017645	TCGC	2	8	58703	58710	0 %	25 %	25 %	50 %	386617419
126	NC_017645	TTAA	2	8	59827	59834	50 %	50 %	0 %	0 %	386617420
127	NC_017645	AAAG	2	8	59992	59999	75 %	0 %	25 %	0 %	386617420
128	NC_017645	ACAG	2	8	60263	60270	50 %	0 %	25 %	25 %	386617420
129	NC_017645	GTAT	2	8	60294	60301	25 %	50 %	25 %	0 %	386617420
130	NC_017645	GAAC	2	8	61361	61368	50 %	0 %	25 %	25 %	386617421
131	NC_017645	GCCA	2	8	61500	61507	25 %	0 %	25 %	50 %	386617421
132	NC_017645	CCCG	2	8	61688	61695	0 %	0 %	25 %	75 %	386617421
133	NC_017645	CAAA	2	8	61801	61808	75 %	0 %	0 %	25 %	386617421
134	NC_017645	AGTG	2	8	62494	62501	25 %	25 %	50 %	0 %	386617422
135	NC_017645	ACAG	2	8	63334	63341	50 %	0 %	25 %	25 %	386617424
136	NC_017645	CTCC	2	8	63479	63486	0 %	25 %	0 %	75 %	386617424
137	NC_017645	TCGG	2	8	63752	63759	0 %	25 %	50 %	25 %	386617425
138	NC_017645	GTGG	2	8	63819	63826	0 %	25 %	75 %	0 %	386617425
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.