MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017645	GA	3	6	60	65	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017645	AT	3	6	107	112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017645	TA	3	6	2422	2427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017645	AT	3	6	2637	2642	50 %	50 %	0 %	0 %	386617346
5	NC_017645	CA	3	6	2746	2751	50 %	0 %	0 %	50 %	386617346
6	NC_017645	CA	3	6	6422	6427	50 %	0 %	0 %	50 %	386617351
7	NC_017645	CA	3	6	6571	6576	50 %	0 %	0 %	50 %	386617351
8	NC_017645	AC	3	6	9365	9370	50 %	0 %	0 %	50 %	386617355
9	NC_017645	AC	3	6	9869	9874	50 %	0 %	0 %	50 %	386617356
10	NC_017645	CA	3	6	10900	10905	50 %	0 %	0 %	50 %	386617358
11	NC_017645	GA	3	6	11948	11953	50 %	0 %	50 %	0 %	386617360
12	NC_017645	TA	3	6	11973	11978	50 %	50 %	0 %	0 %	386617360
13	NC_017645	GA	3	6	13971	13976	50 %	0 %	50 %	0 %	386617362
14	NC_017645	GA	3	6	14263	14268	50 %	0 %	50 %	0 %	386617363
15	NC_017645	GA	3	6	14677	14682	50 %	0 %	50 %	0 %	386617364
16	NC_017645	TA	3	6	15436	15441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017645	AC	3	6	15738	15743	50 %	0 %	0 %	50 %	386617367
18	NC_017645	AG	3	6	15853	15858	50 %	0 %	50 %	0 %	386617367
19	NC_017645	TC	3	6	17851	17856	0 %	50 %	0 %	50 %	386617371
20	NC_017645	GC	3	6	19411	19416	0 %	0 %	50 %	50 %	386617374
21	NC_017645	GA	3	6	19530	19535	50 %	0 %	50 %	0 %	386617374
22	NC_017645	TC	3	6	20714	20719	0 %	50 %	0 %	50 %	386617375
23	NC_017645	CG	3	6	20832	20837	0 %	0 %	50 %	50 %	386617375
24	NC_017645	CG	3	6	21156	21161	0 %	0 %	50 %	50 %	386617376
25	NC_017645	CG	3	6	21292	21297	0 %	0 %	50 %	50 %	386617376
26	NC_017645	GC	3	6	21531	21536	0 %	0 %	50 %	50 %	386617376
27	NC_017645	TG	3	6	22762	22767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017645	GT	3	6	23490	23495	0 %	50 %	50 %	0 %	386617378
29	NC_017645	GC	3	6	26922	26927	0 %	0 %	50 %	50 %	386617381
30	NC_017645	CG	4	8	28151	28158	0 %	0 %	50 %	50 %	386617382
31	NC_017645	GC	3	6	28347	28352	0 %	0 %	50 %	50 %	386617382
32	NC_017645	CG	3	6	28581	28586	0 %	0 %	50 %	50 %	386617382
33	NC_017645	GC	4	8	28934	28941	0 %	0 %	50 %	50 %	386617383
34	NC_017645	CT	3	6	29453	29458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017645	CG	3	6	29514	29519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017645	GA	3	6	30027	30032	50 %	0 %	50 %	0 %	386617384
37	NC_017645	GC	3	6	30301	30306	0 %	0 %	50 %	50 %	386617384
38	NC_017645	GA	3	6	30447	30452	50 %	0 %	50 %	0 %	386617384
39	NC_017645	GC	3	6	30808	30813	0 %	0 %	50 %	50 %	386617385
40	NC_017645	GT	3	6	31647	31652	0 %	50 %	50 %	0 %	386617387
41	NC_017645	GC	4	8	31739	31746	0 %	0 %	50 %	50 %	386617387
42	NC_017645	GC	3	6	31923	31928	0 %	0 %	50 %	50 %	386617387
43	NC_017645	CG	3	6	32194	32199	0 %	0 %	50 %	50 %	386617387
44	NC_017645	CT	3	6	33656	33661	0 %	50 %	0 %	50 %	386617389
45	NC_017645	TG	3	6	34466	34471	0 %	50 %	50 %	0 %	386617390
46	NC_017645	AG	3	6	35172	35177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017645	TC	3	6	35728	35733	0 %	50 %	0 %	50 %	386617392
48	NC_017645	GA	3	6	35978	35983	50 %	0 %	50 %	0 %	386617392
49	NC_017645	GA	3	6	36120	36125	50 %	0 %	50 %	0 %	386617392
50	NC_017645	TG	3	6	36949	36954	0 %	50 %	50 %	0 %	386617393
51	NC_017645	AC	3	6	39547	39552	50 %	0 %	0 %	50 %	386617399
52	NC_017645	TC	3	6	40092	40097	0 %	50 %	0 %	50 %	386617399
53	NC_017645	AG	3	6	40352	40357	50 %	0 %	50 %	0 %	386617399
54	NC_017645	AG	3	6	40438	40443	50 %	0 %	50 %	0 %	386617399
55	NC_017645	GA	3	6	40476	40481	50 %	0 %	50 %	0 %	386617399
56	NC_017645	GA	3	6	40892	40897	50 %	0 %	50 %	0 %	386617400
57	NC_017645	GA	4	8	42270	42277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017645	TC	3	6	43479	43484	0 %	50 %	0 %	50 %	386617404
59	NC_017645	TC	3	6	44787	44792	0 %	50 %	0 %	50 %	386617404
60	NC_017645	GT	3	6	46337	46342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017645	CT	3	6	46605	46610	0 %	50 %	0 %	50 %	386617406
62	NC_017645	AG	3	6	47181	47186	50 %	0 %	50 %	0 %	386617406
63	NC_017645	AC	3	6	47429	47434	50 %	0 %	0 %	50 %	386617406
64	NC_017645	TC	3	6	48546	48551	0 %	50 %	0 %	50 %	386617406
65	NC_017645	TC	3	6	48728	48733	0 %	50 %	0 %	50 %	386617406
66	NC_017645	GA	3	6	49760	49765	50 %	0 %	50 %	0 %	386617407
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71	NC_017645	AG	3	6	52878	52883	50 %	0 %	50 %	0 %	386617410
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73	NC_017645	AC	3	6	53140	53145	50 %	0 %	0 %	50 %	386617411
74	NC_017645	AG	3	6	53273	53278	50 %	0 %	50 %	0 %	386617412
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81	NC_017645	AC	3	6	60661	60666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017645	GC	3	6	61258	61263	0 %	0 %	50 %	50 %	386617421
83	NC_017645	GC	3	6	62100	62105	0 %	0 %	50 %	50 %	386617422
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85	NC_017645	TG	3	6	62878	62883	0 %	50 %	50 %	0 %	386617423
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92	NC_017645	CT	3	6	66573	66578	0 %	50 %	0 %	50 %	386617425
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105	NC_017645	CT	3	6	74612	74617	0 %	50 %	0 %	50 %	386617431
106	NC_017645	CT	3	6	74748	74753	0 %	50 %	0 %	50 %	386617431
107	NC_017645	AG	3	6	75370	75375	50 %	0 %	50 %	0 %	386617432
108	NC_017645	TA	3	6	78223	78228	50 %	50 %	0 %	0 %	386617433
109	NC_017645	AT	3	6	78451	78456	50 %	50 %	0 %	0 %	386617433
110	NC_017645	CT	3	6	78637	78642	0 %	50 %	0 %	50 %	386617433
111	NC_017645	GC	3	6	78971	78976	0 %	0 %	50 %	50 %	386617433
112	NC_017645	AG	3	6	80236	80241	50 %	0 %	50 %	0 %	386617435
113	NC_017645	TC	3	6	81412	81417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017645	CT	3	6	81487	81492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017645	TC	3	6	83340	83345	0 %	50 %	0 %	50 %	386617438
116	NC_017645	AG	3	6	84075	84080	50 %	0 %	50 %	0 %	386617439
117	NC_017645	GA	3	6	85594	85599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017645	GA	3	6	85910	85915	50 %	0 %	50 %	0 %	386617441
119	NC_017645	AG	4	8	86195	86202	50 %	0 %	50 %	0 %	386617441
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121	NC_017645	CA	3	6	90420	90425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017645	CT	3	6	90516	90521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017645	TG	3	6	90605	90610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017645	CA	3	6	90630	90635	50 %	0 %	0 %	50 %	386617445
125	NC_017645	TC	4	8	90669	90676	0 %	50 %	0 %	50 %	386617445
126	NC_017645	CT	3	6	90959	90964	0 %	50 %	0 %	50 %	386617445
127	NC_017645	TG	3	6	92391	92396	0 %	50 %	50 %	0 %	386617447
128	NC_017645	GA	3	6	92626	92631	50 %	0 %	50 %	0 %	386617447
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133	NC_017645	GA	3	6	95841	95846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017645	CT	3	6	96655	96660	0 %	50 %	0 %	50 %	386617454
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143	NC_017645	GA	3	6	101949	101954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.