MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	GAAGGG	2	12	8144	8155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617291
2	NC_017643	GCCGTT	2	12	9101	9112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617291
3	NC_017643	TAAAAA	2	12	9659	9670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386617292
4	NC_017643	TGAAAA	2	12	9839	9850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386617292
5	NC_017643	CGTCAG	2	12	12944	12955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386617295
6	NC_017643	TACGGG	2	12	14173	14184	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386617295
7	NC_017643	TTGTTA	2	12	15777	15788	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386617296
8	NC_017643	CTGATT	2	12	17058	17069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386617297
9	NC_017643	AGAGAA	2	12	20269	20280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617299
10	NC_017643	ATTTCC	2	12	23172	23183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386617302
11	NC_017643	TGCAAA	2	12	23929	23940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386617303
12	NC_017643	TTTTCA	2	12	24360	24371	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386617303
13	NC_017643	TCTGCT	2	12	27805	27816	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386617307
14	NC_017643	GCGCTG	2	12	28601	28612	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386617308
15	NC_017643	TGGTTT	2	12	29082	29093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386617308
16	NC_017643	CATGAC	2	12	30388	30399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617308
17	NC_017643	GGTTCA	2	12	32499	32510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386617310
18	NC_017643	TCAGCA	2	12	32832	32843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617310
19	NC_017643	CCGGTG	2	12	34127	34138	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386617312
20	NC_017643	CTGTGC	2	12	37454	37465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617316
21	NC_017643	GCGGAA	2	12	45641	45652	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386617325
22	NC_017643	GGTACT	2	12	46096	46107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386617326
23	NC_017643	TGCGTA	2	12	47558	47569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386617327
24	NC_017643	GTGAAA	2	12	47975	47986	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386617327
25	NC_017643	ATGCAG	2	12	51791	51802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386617330
26	NC_017643	TTCAGG	2	12	53420	53431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386617330
27	NC_017643	GTCAAC	2	12	55984	55995	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386617331
28	NC_017643	AGCTGA	2	12	56693	56704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386617332

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.