MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	CGTTC	2	10	844	853	0 %	40 %	20 %	40 %	386617282
2	NC_017643	AGGCC	2	10	1091	1100	20 %	0 %	40 %	40 %	386617282
3	NC_017643	AGGGA	2	10	1869	1878	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017643	GGCAC	2	10	3022	3031	20 %	0 %	40 %	40 %	386617285
5	NC_017643	GGCGG	2	10	3750	3759	0 %	0 %	80 %	20 %	386617286
6	NC_017643	TGCCA	2	10	3968	3977	20 %	20 %	20 %	40 %	386617286
7	NC_017643	GGATC	2	10	4464	4473	20 %	20 %	40 %	20 %	386617286
8	NC_017643	GACAC	2	10	6924	6933	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017643	ACTGA	2	10	8115	8124	40 %	20 %	20 %	20 %	386617291
10	NC_017643	TTTAT	2	10	11708	11717	20 %	80 %	0 %	0 %	386617293
11	NC_017643	GGTGA	2	10	15861	15870	20 %	20 %	60 %	0 %	386617296
12	NC_017643	GGCTT	2	10	17474	17483	0 %	40 %	40 %	20 %	386617297
13	NC_017643	CGCTG	2	10	20332	20341	0 %	20 %	40 %	40 %	386617299
14	NC_017643	GCTTT	2	10	20738	20747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017643	AGGGT	2	10	20767	20776	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017643	CTGGT	2	10	21800	21809	0 %	40 %	40 %	20 %	386617300
17	NC_017643	TTCAT	2	10	25178	25187	20 %	60 %	0 %	20 %	386617303
18	NC_017643	CCCAG	2	10	35264	35273	20 %	0 %	20 %	60 %	386617313
19	NC_017643	GAACT	2	10	37183	37192	40 %	20 %	20 %	20 %	386617316
20	NC_017643	GTTGT	2	10	38098	38107	0 %	60 %	40 %	0 %	386617317
21	NC_017643	CAGCA	2	10	38950	38959	40 %	0 %	20 %	40 %	386617317
22	NC_017643	CTGTG	2	10	40468	40477	0 %	40 %	40 %	20 %	386617317
23	NC_017643	TGTTC	2	10	43384	43393	0 %	60 %	20 %	20 %	386617321
24	NC_017643	TGTGC	2	10	44476	44485	0 %	40 %	40 %	20 %	386617323
25	NC_017643	TTTTC	2	10	45369	45378	0 %	80 %	0 %	20 %	386617325
26	NC_017643	TCAAG	2	10	46687	46696	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017643	GCAGC	2	10	48069	48078	20 %	0 %	40 %	40 %	386617327
28	NC_017643	GCCGC	2	10	48648	48657	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017643	GGTGA	2	10	48991	49000	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017643	CTGAA	2	10	49199	49208	40 %	20 %	20 %	20 %	386617328
31	NC_017643	TAAAA	2	10	50215	50224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017643	GACAG	2	10	54953	54962	40 %	0 %	40 %	20 %	386617331
33	NC_017643	TTATT	2	10	56483	56492	20 %	80 %	0 %	0 %	386617332
34	NC_017643	TTTTA	2	10	56513	56522	20 %	80 %	0 %	0 %	386617332
35	NC_017643	CAGGC	2	10	56733	56742	20 %	0 %	40 %	40 %	386617332
36	NC_017643	AGAGC	2	10	56937	56946	40 %	0 %	40 %	20 %	386617332
37	NC_017643	CGCGG	2	10	62288	62297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017643	ACGGG	2	10	62340	62349	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017643	GCTGG	2	10	62985	62994	0 %	20 %	60 %	20 %	386617338
40	NC_017643	TGGTC	4	20	64621	64640	0 %	40 %	40 %	20 %	386617340
41	NC_017643	CCGTC	2	10	64668	64677	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017643	TCCGG	2	10	65446	65455	0 %	20 %	40 %	40 %	386617341

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.