MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	CGTTC	2	10	844	853	0 %	40 %	20 %	40 %	386617282
2	NC_017643	AGGCC	2	10	1091	1100	20 %	0 %	40 %	40 %	386617282
3	NC_017643	GGCAC	2	10	3022	3031	20 %	0 %	40 %	40 %	386617285
4	NC_017643	GGCGG	2	10	3750	3759	0 %	0 %	80 %	20 %	386617286
5	NC_017643	TGCCA	2	10	3968	3977	20 %	20 %	20 %	40 %	386617286
6	NC_017643	GGATC	2	10	4464	4473	20 %	20 %	40 %	20 %	386617286
7	NC_017643	ACTGA	2	10	8115	8124	40 %	20 %	20 %	20 %	386617291
8	NC_017643	TTTAT	2	10	11708	11717	20 %	80 %	0 %	0 %	386617293
9	NC_017643	GGTGA	2	10	15861	15870	20 %	20 %	60 %	0 %	386617296
10	NC_017643	GGCTT	2	10	17474	17483	0 %	40 %	40 %	20 %	386617297
11	NC_017643	CGCTG	2	10	20332	20341	0 %	20 %	40 %	40 %	386617299
12	NC_017643	CTGGT	2	10	21800	21809	0 %	40 %	40 %	20 %	386617300
13	NC_017643	TTCAT	2	10	25178	25187	20 %	60 %	0 %	20 %	386617303
14	NC_017643	CCCAG	2	10	35264	35273	20 %	0 %	20 %	60 %	386617313
15	NC_017643	GAACT	2	10	37183	37192	40 %	20 %	20 %	20 %	386617316
16	NC_017643	GTTGT	2	10	38098	38107	0 %	60 %	40 %	0 %	386617317
17	NC_017643	CAGCA	2	10	38950	38959	40 %	0 %	20 %	40 %	386617317
18	NC_017643	CTGTG	2	10	40468	40477	0 %	40 %	40 %	20 %	386617317
19	NC_017643	TGTTC	2	10	43384	43393	0 %	60 %	20 %	20 %	386617321
20	NC_017643	TGTGC	2	10	44476	44485	0 %	40 %	40 %	20 %	386617323
21	NC_017643	TTTTC	2	10	45369	45378	0 %	80 %	0 %	20 %	386617325
22	NC_017643	GCAGC	2	10	48069	48078	20 %	0 %	40 %	40 %	386617327
23	NC_017643	CTGAA	2	10	49199	49208	40 %	20 %	20 %	20 %	386617328
24	NC_017643	GACAG	2	10	54953	54962	40 %	0 %	40 %	20 %	386617331
25	NC_017643	TTATT	2	10	56483	56492	20 %	80 %	0 %	0 %	386617332
26	NC_017643	TTTTA	2	10	56513	56522	20 %	80 %	0 %	0 %	386617332
27	NC_017643	CAGGC	2	10	56733	56742	20 %	0 %	40 %	40 %	386617332
28	NC_017643	AGAGC	2	10	56937	56946	40 %	0 %	40 %	20 %	386617332
29	NC_017643	GCTGG	2	10	62985	62994	0 %	20 %	60 %	20 %	386617338
30	NC_017643	TGGTC	4	20	64621	64640	0 %	40 %	40 %	20 %	386617340
31	NC_017643	TCCGG	2	10	65446	65455	0 %	20 %	40 %	40 %	386617341

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.