MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	CCGG	2	8	427	434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017643	CCGG	2	8	1251	1258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017643	GGCG	2	8	2468	2475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017643	AGGA	2	8	2611	2618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017643	TTCC	2	8	2622	2629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017643	TGAA	2	8	2692	2699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017643	GCCT	2	8	3597	3604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017643	GTCC	2	8	7428	7435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017643	GGTT	2	8	10125	10132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017643	CAGC	2	8	10671	10678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017643	ATCC	2	8	10944	10951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017643	TGGT	2	8	10987	10994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017643	ACTG	2	8	11052	11059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017643	AACA	2	8	20576	20583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017643	GAAA	2	8	20615	20622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017643	GAAT	2	8	20706	20713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017643	CAAT	2	8	21230	21237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017643	CTTT	2	8	22602	22609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017643	AGAA	2	8	22724	22731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017643	CACG	2	8	22841	22848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017643	CGAT	2	8	46698	46705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017643	ATTT	2	8	46722	46729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017643	GAAA	2	8	46972	46979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017643	GCTG	2	8	48279	48286	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017643	TCCG	2	8	48363	48370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017643	ATCA	2	8	49006	49013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017643	ATTT	2	8	49528	49535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017643	GATT	2	8	49614	49621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017643	ACTC	2	8	49783	49790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017643	TGGA	2	8	49879	49886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017643	TTTG	2	8	50163	50170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017643	AGAA	2	8	56284	56291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017643	CAAT	2	8	58554	58561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017643	ACCC	2	8	60505	60512	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017643	TATT	2	8	60604	60611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017643	TTTA	2	8	60770	60777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017643	CTGG	2	8	62364	62371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017643	GCGG	2	8	63955	63962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.