MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	GA	3	6	1161	1166	50 %	0 %	50 %	0 %	386617282
2	NC_017643	GT	4	8	2329	2336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017643	GT	3	6	2342	2347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017643	AG	3	6	2417	2422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017643	TC	3	6	2665	2670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017643	GA	3	6	3368	3373	50 %	0 %	50 %	0 %	386617285
7	NC_017643	CG	3	6	3612	3617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017643	AT	3	6	4249	4254	50 %	50 %	0 %	0 %	386617286
9	NC_017643	AC	3	6	4382	4387	50 %	0 %	0 %	50 %	386617286
10	NC_017643	CG	3	6	4492	4497	0 %	0 %	50 %	50 %	386617286
11	NC_017643	GC	3	6	5510	5515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017643	GT	3	6	6205	6210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017643	CA	3	6	6760	6765	50 %	0 %	0 %	50 %	386617289
14	NC_017643	CG	3	6	7444	7449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017643	TG	3	6	7564	7569	0 %	50 %	50 %	0 %	386617291
16	NC_017643	CA	3	6	8359	8364	50 %	0 %	0 %	50 %	386617291
17	NC_017643	GA	3	6	8601	8606	50 %	0 %	50 %	0 %	386617291
18	NC_017643	GT	3	6	8814	8819	0 %	50 %	50 %	0 %	386617291
19	NC_017643	TG	3	6	9641	9646	0 %	50 %	50 %	0 %	386617292
20	NC_017643	GT	3	6	10993	10998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017643	AT	5	10	11500	11509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017643	TC	3	6	11719	11724	0 %	50 %	0 %	50 %	386617293
23	NC_017643	AT	3	6	11733	11738	50 %	50 %	0 %	0 %	386617293
24	NC_017643	TG	3	6	13305	13310	0 %	50 %	50 %	0 %	386617295
25	NC_017643	TG	3	6	13440	13445	0 %	50 %	50 %	0 %	386617295
26	NC_017643	TG	3	6	13460	13465	0 %	50 %	50 %	0 %	386617295
27	NC_017643	AG	3	6	14192	14197	50 %	0 %	50 %	0 %	386617295
28	NC_017643	GA	3	6	15456	15461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017643	GT	3	6	15751	15756	0 %	50 %	50 %	0 %	386617296
30	NC_017643	GT	3	6	16029	16034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017643	AG	3	6	18522	18527	50 %	0 %	50 %	0 %	386617298
32	NC_017643	GC	3	6	19935	19940	0 %	0 %	50 %	50 %	386617299
33	NC_017643	AG	3	6	20321	20326	50 %	0 %	50 %	0 %	386617299
34	NC_017643	CA	3	6	20895	20900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017643	AT	3	6	21257	21262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017643	GA	3	6	21499	21504	50 %	0 %	50 %	0 %	386617300
37	NC_017643	TA	3	6	21893	21898	50 %	50 %	0 %	0 %	386617300
38	NC_017643	TA	3	6	22000	22005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017643	GT	3	6	22287	22292	0 %	50 %	50 %	0 %	386617301
40	NC_017643	GA	4	8	22439	22446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017643	GA	5	10	23317	23326	50 %	0 %	50 %	0 %	386617302
42	NC_017643	TA	3	6	23531	23536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017643	AT	4	8	23985	23992	50 %	50 %	0 %	0 %	386617303
44	NC_017643	GT	3	6	24201	24206	0 %	50 %	50 %	0 %	386617303
45	NC_017643	GT	3	6	24543	24548	0 %	50 %	50 %	0 %	386617303
46	NC_017643	GT	3	6	24597	24602	0 %	50 %	50 %	0 %	386617303
47	NC_017643	AT	3	6	26063	26068	50 %	50 %	0 %	0 %	386617304
48	NC_017643	AT	3	6	26603	26608	50 %	50 %	0 %	0 %	386617305
49	NC_017643	AT	3	6	26614	26619	50 %	50 %	0 %	0 %	386617305
50	NC_017643	TG	3	6	28215	28220	0 %	50 %	50 %	0 %	386617307
51	NC_017643	CA	3	6	29757	29762	50 %	0 %	0 %	50 %	386617308
52	NC_017643	GT	3	6	30065	30070	0 %	50 %	50 %	0 %	386617308
53	NC_017643	GT	3	6	32068	32073	0 %	50 %	50 %	0 %	386617309
54	NC_017643	AC	3	6	32487	32492	50 %	0 %	0 %	50 %	386617310
55	NC_017643	TG	3	6	32598	32603	0 %	50 %	50 %	0 %	386617310
56	NC_017643	AT	3	6	32724	32729	50 %	50 %	0 %	0 %	386617310
57	NC_017643	GT	3	6	32941	32946	0 %	50 %	50 %	0 %	386617311
58	NC_017643	TG	3	6	33928	33933	0 %	50 %	50 %	0 %	386617312
59	NC_017643	GT	3	6	35447	35452	0 %	50 %	50 %	0 %	386617314
60	NC_017643	TG	3	6	35541	35546	0 %	50 %	50 %	0 %	386617314
61	NC_017643	AC	3	6	35818	35823	50 %	0 %	0 %	50 %	386617314
62	NC_017643	TG	3	6	36422	36427	0 %	50 %	50 %	0 %	386617315
63	NC_017643	CA	3	6	38480	38485	50 %	0 %	0 %	50 %	386617317
64	NC_017643	GT	3	6	38998	39003	0 %	50 %	50 %	0 %	386617317
65	NC_017643	CG	3	6	40418	40423	0 %	0 %	50 %	50 %	386617317
66	NC_017643	TG	3	6	41038	41043	0 %	50 %	50 %	0 %	386617318
67	NC_017643	AC	3	6	42378	42383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017643	AG	3	6	42946	42951	50 %	0 %	50 %	0 %	386617320
69	NC_017643	GT	3	6	44603	44608	0 %	50 %	50 %	0 %	386617323
70	NC_017643	CT	3	6	44939	44944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017643	AT	3	6	45057	45062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017643	AG	3	6	45218	45223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017643	GT	3	6	45316	45321	0 %	50 %	50 %	0 %	386617325
74	NC_017643	CT	3	6	46556	46561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017643	AG	3	6	46948	46953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017643	GA	3	6	47053	47058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017643	GC	3	6	47473	47478	0 %	0 %	50 %	50 %	386617327
78	NC_017643	AC	4	8	47695	47702	50 %	0 %	0 %	50 %	386617327
79	NC_017643	GT	3	6	47840	47845	0 %	50 %	50 %	0 %	386617327
80	NC_017643	TC	3	6	48430	48435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017643	CT	3	6	48946	48951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017643	TA	3	6	49126	49131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017643	TA	3	6	49137	49142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017643	AG	3	6	50141	50146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017643	AG	3	6	50255	50260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017643	TA	3	6	50275	50280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017643	AT	3	6	50803	50808	50 %	50 %	0 %	0 %	386617329
88	NC_017643	AT	3	6	51879	51884	50 %	50 %	0 %	0 %	386617330
89	NC_017643	GC	3	6	51894	51899	0 %	0 %	50 %	50 %	386617330
90	NC_017643	GC	3	6	52199	52204	0 %	0 %	50 %	50 %	386617330
91	NC_017643	AT	3	6	52710	52715	50 %	50 %	0 %	0 %	386617330
92	NC_017643	AC	3	6	53306	53311	50 %	0 %	0 %	50 %	386617330
93	NC_017643	GA	3	6	54389	54394	50 %	0 %	50 %	0 %	386617331
94	NC_017643	AC	3	6	56571	56576	50 %	0 %	0 %	50 %	386617332
95	NC_017643	CT	3	6	57857	57862	0 %	50 %	0 %	50 %	386617333
96	NC_017643	AC	3	6	58384	58389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017643	AT	3	6	58410	58415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017643	AT	3	6	58418	58423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017643	TA	3	6	58511	58516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017643	AC	3	6	58938	58943	50 %	0 %	0 %	50 %	386617334
101	NC_017643	CG	3	6	59050	59055	0 %	0 %	50 %	50 %	386617334
102	NC_017643	TG	3	6	59496	59501	0 %	50 %	50 %	0 %	386617334
103	NC_017643	TG	3	6	60378	60383	0 %	50 %	50 %	0 %	386617335
104	NC_017643	AT	3	6	60498	60503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017643	TG	3	6	61901	61906	0 %	50 %	50 %	0 %	386617337
106	NC_017643	CA	3	6	63066	63071	50 %	0 %	0 %	50 %	386617338
107	NC_017643	GC	3	6	63297	63302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017643	GC	3	6	63662	63667	0 %	0 %	50 %	50 %	386617339
109	NC_017643	AC	3	6	63923	63928	50 %	0 %	0 %	50 %	386617339
110	NC_017643	GT	3	6	64597	64602	0 %	50 %	50 %	0 %	386617340

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.