MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017642	GTGAAA	2	12	1158	1169	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386611904
2	NC_017642	ATGCTC	2	12	5010	5021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386611908
3	NC_017642	TGCTGA	2	12	6198	6209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386611909
4	NC_017642	AACAGC	2	12	12685	12696	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386611917
5	NC_017642	GGCGCT	2	12	24274	24285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386611933
6	NC_017642	CAGGTG	2	12	24305	24316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386611933
7	NC_017642	GTGGCG	2	12	24395	24406	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386611933
8	NC_017642	GCCGGA	2	12	24646	24657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386611933
9	NC_017642	TCCACA	2	12	25582	25593	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386611933
10	NC_017642	GGCTGT	2	12	26184	26195	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386611935
11	NC_017642	GATATC	2	12	38517	38528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386611945
12	NC_017642	TGTGCC	2	12	48733	48744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611954
13	NC_017642	ACCGGT	2	12	53799	53810	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386611958
14	NC_017642	CTTTTC	2	12	56222	56233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611959
15	NC_017642	TTCCGG	2	12	56414	56425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611959
16	NC_017642	AGTGTC	2	12	62528	62539	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386611967
17	NC_017642	CGGCAA	2	12	64641	64652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611967
18	NC_017642	GGAAAA	2	12	71026	71037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611973
19	NC_017642	TTCGTC	2	12	79272	79283	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386611982
20	NC_017642	CGTAGT	2	12	82938	82949	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386611985

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.