MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017642	TGAAT	2	10	3031	3040	40 %	40 %	20 %	0 %	386611906
2	NC_017642	TCAGT	2	10	6470	6479	20 %	40 %	20 %	20 %	386611909
3	NC_017642	AGAAA	2	10	7016	7025	80 %	0 %	20 %	0 %	386611909
4	NC_017642	TGGGA	2	10	12404	12413	20 %	20 %	60 %	0 %	386611916
5	NC_017642	CAGAG	2	10	14634	14643	40 %	0 %	40 %	20 %	386611919
6	NC_017642	AGACC	2	10	14665	14674	40 %	0 %	20 %	40 %	386611919
7	NC_017642	GTTCA	2	10	14841	14850	20 %	40 %	20 %	20 %	386611920
8	NC_017642	CGTAC	2	10	15304	15313	20 %	20 %	20 %	40 %	386611920
9	NC_017642	CGCGG	2	10	17969	17978	0 %	0 %	60 %	40 %	386611924
10	NC_017642	ACGGG	2	10	18020	18029	20 %	0 %	60 %	20 %	386611924
11	NC_017642	GCTGG	2	10	18665	18674	0 %	20 %	60 %	20 %	386611925
12	NC_017642	CCGCC	2	10	20338	20347	0 %	0 %	20 %	80 %	386611927
13	NC_017642	GGCAC	2	10	20808	20817	20 %	0 %	40 %	40 %	386611928
14	NC_017642	ACCGT	2	10	21098	21107	20 %	20 %	20 %	40 %	386611929
15	NC_017642	TGTAC	2	10	21425	21434	20 %	40 %	20 %	20 %	386611930
16	NC_017642	CCGGC	2	10	22132	22141	0 %	0 %	40 %	60 %	386611931
17	NC_017642	ACTGA	2	10	25700	25709	40 %	20 %	20 %	20 %	386611934
18	NC_017642	CTGGT	2	10	26628	26637	0 %	40 %	40 %	20 %	386611935
19	NC_017642	GAGCA	2	10	28013	28022	40 %	0 %	40 %	20 %	386611936
20	NC_017642	GGCAC	2	10	28546	28555	20 %	0 %	40 %	40 %	386611937
21	NC_017642	TGACC	2	10	28674	28683	20 %	20 %	20 %	40 %	386611937
22	NC_017642	GTTAC	2	10	30984	30993	20 %	40 %	20 %	20 %	386611940
23	NC_017642	CTGAA	2	10	31604	31613	40 %	20 %	20 %	20 %	386611940
24	NC_017642	ATGAC	2	10	34684	34693	40 %	20 %	20 %	20 %	386611944
25	NC_017642	ATCGT	2	10	35251	35260	20 %	40 %	20 %	20 %	386611944
26	NC_017642	CAGGG	2	10	40884	40893	20 %	0 %	60 %	20 %	386611947
27	NC_017642	GGCCT	2	10	44144	44153	0 %	20 %	40 %	40 %	386611950
28	NC_017642	GAACG	2	10	44391	44400	40 %	0 %	40 %	20 %	386611950
29	NC_017642	ACCGG	2	10	45338	45347	20 %	0 %	40 %	40 %	386611951
30	NC_017642	CAGAA	2	10	47731	47740	60 %	0 %	20 %	20 %	386611953
31	NC_017642	CATAA	2	10	49673	49682	60 %	20 %	0 %	20 %	386611954
32	NC_017642	TGAGC	2	10	49683	49692	20 %	20 %	40 %	20 %	386611954
33	NC_017642	GTCTG	2	10	50726	50735	0 %	40 %	40 %	20 %	386611955
34	NC_017642	TCTTT	2	10	53947	53956	0 %	80 %	0 %	20 %	386611958
35	NC_017642	ACCGG	2	10	57576	57585	20 %	0 %	40 %	40 %	386611961
36	NC_017642	CCAGT	2	10	66198	66207	20 %	20 %	20 %	40 %	386611968
37	NC_017642	GACAG	2	10	66740	66749	40 %	0 %	40 %	20 %	386611969
38	NC_017642	CTATA	2	10	76787	76796	40 %	40 %	0 %	20 %	386611978
39	NC_017642	TGACA	2	10	78219	78228	40 %	20 %	20 %	20 %	386611981
40	NC_017642	GTTGT	2	10	81192	81201	0 %	60 %	40 %	0 %	386611983
41	NC_017642	ACTGA	2	10	81389	81398	40 %	20 %	20 %	20 %	386611984
42	NC_017642	TCCAG	2	10	83219	83228	20 %	20 %	20 %	40 %	386611985
43	NC_017642	GCTGT	2	10	85511	85520	0 %	40 %	40 %	20 %	386611987
44	NC_017642	TGGTG	2	10	86073	86082	0 %	40 %	60 %	0 %	386611988
45	NC_017642	CAGCA	2	10	89939	89948	40 %	0 %	20 %	40 %	386611992
46	NC_017642	GCTTC	2	10	89990	89999	0 %	40 %	20 %	40 %	386611992

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.