MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017642	TCTT	2	8	311	318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017642	AACG	2	8	780	787	50 %	0 %	25 %	25 %	386611904
3	NC_017642	TCCG	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	386611904
4	NC_017642	CTGC	2	8	1328	1335	0 %	25 %	25 %	50 %	386611904
5	NC_017642	GCTG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	50 %	25 %	386611904
6	NC_017642	CAAA	2	8	1670	1677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017642	CCCG	2	8	2719	2726	0 %	0 %	25 %	75 %	386611906
8	NC_017642	GGGA	2	8	3491	3498	25 %	0 %	75 %	0 %	386611907
9	NC_017642	CTGG	2	8	3532	3539	0 %	25 %	50 %	25 %	386611907
10	NC_017642	GGCT	2	8	3732	3739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017642	ATAA	2	8	3938	3945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017642	TACT	2	8	4036	4043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017642	AAAG	2	8	5109	5116	75 %	0 %	25 %	0 %	386611908
14	NC_017642	GCAG	2	8	6111	6118	25 %	0 %	50 %	25 %	386611909
15	NC_017642	TGCT	2	8	6308	6315	0 %	50 %	25 %	25 %	386611909
16	NC_017642	ATCA	2	8	6994	7001	50 %	25 %	0 %	25 %	386611909
17	NC_017642	AATT	2	8	7056	7063	50 %	50 %	0 %	0 %	386611909
18	NC_017642	TGAT	2	8	7531	7538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017642	TAAA	2	8	7578	7585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017642	ACAG	2	8	7609	7616	50 %	0 %	25 %	25 %	386611910
21	NC_017642	AGAA	2	8	7632	7639	75 %	0 %	25 %	0 %	386611910
22	NC_017642	GCAA	2	8	7693	7700	50 %	0 %	25 %	25 %	386611910
23	NC_017642	CTTT	2	8	7950	7957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017642	CGGC	2	8	8776	8783	0 %	0 %	50 %	50 %	386611912
25	NC_017642	CAGC	2	8	8832	8839	25 %	0 %	25 %	50 %	386611912
26	NC_017642	CAGC	2	8	8966	8973	25 %	0 %	25 %	50 %	386611912
27	NC_017642	CATT	2	8	9100	9107	25 %	50 %	0 %	25 %	386611912
28	NC_017642	CATC	2	8	9274	9281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017642	TTTA	2	8	9746	9753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017642	TGAG	2	8	9833	9840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017642	ATTA	2	8	10095	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	386611913
32	NC_017642	GCAG	2	8	10184	10191	25 %	0 %	50 %	25 %	386611913
33	NC_017642	CTTC	2	8	10559	10566	0 %	50 %	0 %	50 %	386611914
34	NC_017642	TGTT	2	8	10635	10642	0 %	75 %	25 %	0 %	386611914
35	NC_017642	CCTC	2	8	10750	10757	0 %	25 %	0 %	75 %	386611914
36	NC_017642	CCTG	2	8	10923	10930	0 %	25 %	25 %	50 %	386611915
37	NC_017642	AGGA	2	8	11238	11245	50 %	0 %	50 %	0 %	386611915
38	NC_017642	CAGC	2	8	11301	11308	25 %	0 %	25 %	50 %	386611915
39	NC_017642	CAGG	2	8	11363	11370	25 %	0 %	50 %	25 %	386611915
40	NC_017642	CTGA	2	8	12186	12193	25 %	25 %	25 %	25 %	386611916
41	NC_017642	AACA	2	8	12501	12508	75 %	0 %	0 %	25 %	386611916
42	NC_017642	AACA	2	8	12577	12584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017642	TGTT	2	8	13279	13286	0 %	75 %	25 %	0 %	386611918
44	NC_017642	GAAA	3	12	13678	13689	75 %	0 %	25 %	0 %	386611918
45	NC_017642	AAAT	2	8	14305	14312	75 %	25 %	0 %	0 %	386611919
46	NC_017642	GTTA	2	8	14425	14432	25 %	50 %	25 %	0 %	386611919
47	NC_017642	CAGC	2	8	14939	14946	25 %	0 %	25 %	50 %	386611920
48	NC_017642	GTGA	2	8	16016	16023	25 %	25 %	50 %	0 %	386611921
49	NC_017642	AGAA	2	8	16251	16258	75 %	0 %	25 %	0 %	386611921
50	NC_017642	CAGC	2	8	16432	16439	25 %	0 %	25 %	50 %	386611922
51	NC_017642	TGTA	2	8	16693	16700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017642	GCTG	2	8	17309	17316	0 %	25 %	50 %	25 %	386611923
53	NC_017642	TTCA	2	8	17617	17624	25 %	50 %	0 %	25 %	386611923
54	NC_017642	TGGC	2	8	17739	17746	0 %	25 %	50 %	25 %	386611923
55	NC_017642	CGGG	2	8	17897	17904	0 %	0 %	75 %	25 %	386611924
56	NC_017642	GCAG	2	8	18780	18787	25 %	0 %	50 %	25 %	386611925
57	NC_017642	ATGA	2	8	19029	19036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017642	CAGT	2	8	19923	19930	25 %	25 %	25 %	25 %	386611927
59	NC_017642	TGGC	2	8	19993	20000	0 %	25 %	50 %	25 %	386611927
60	NC_017642	ACGG	2	8	21289	21296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017642	ACGG	2	8	21381	21388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017642	GGCA	2	8	21714	21721	25 %	0 %	50 %	25 %	386611930
63	NC_017642	TCAG	2	8	22787	22794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017642	TAAG	2	8	23616	23623	50 %	25 %	25 %	0 %	386611933
65	NC_017642	AAGC	2	8	23718	23725	50 %	0 %	25 %	25 %	386611933
66	NC_017642	GAAC	2	8	24691	24698	50 %	0 %	25 %	25 %	386611933
67	NC_017642	ACGC	2	8	24988	24995	25 %	0 %	25 %	50 %	386611933
68	NC_017642	GAAG	2	8	25156	25163	50 %	0 %	50 %	0 %	386611933
69	NC_017642	TCAC	2	8	25788	25795	25 %	25 %	0 %	50 %	386611934
70	NC_017642	CTTT	2	8	26252	26259	0 %	75 %	0 %	25 %	386611935
71	NC_017642	TGGC	2	8	26356	26363	0 %	25 %	50 %	25 %	386611935
72	NC_017642	CCGT	2	8	26443	26450	0 %	25 %	25 %	50 %	386611935
73	NC_017642	GAAG	2	8	27507	27514	50 %	0 %	50 %	0 %	386611936
74	NC_017642	CAAA	2	8	27624	27631	75 %	0 %	0 %	25 %	386611936
75	NC_017642	GCTG	2	8	27844	27851	0 %	25 %	50 %	25 %	386611936
76	NC_017642	GCCT	2	8	29162	29169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017642	CTAT	2	8	30337	30344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017642	CTGG	2	8	31101	31108	0 %	25 %	50 %	25 %	386611940
79	NC_017642	TCAC	2	8	31619	31626	25 %	25 %	0 %	50 %	386611940
80	NC_017642	ATAA	2	8	32246	32253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017642	TACA	2	8	32511	32518	50 %	25 %	0 %	25 %	386611941
82	NC_017642	TGAT	2	8	33210	33217	25 %	50 %	25 %	0 %	386611942
83	NC_017642	CCTG	2	8	33723	33730	0 %	25 %	25 %	50 %	386611943
84	NC_017642	AGTG	2	8	34261	34268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017642	AAGA	2	8	34279	34286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017642	TGTT	2	8	34491	34498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017642	TTCG	2	8	34646	34653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017642	TGCC	2	8	35180	35187	0 %	25 %	25 %	50 %	386611944
89	NC_017642	GATG	2	8	35453	35460	25 %	25 %	50 %	0 %	386611944
90	NC_017642	AAAG	2	8	36054	36061	75 %	0 %	25 %	0 %	386611944
91	NC_017642	TTTG	2	8	36317	36324	0 %	75 %	25 %	0 %	386611944
92	NC_017642	GCTG	2	8	36359	36366	0 %	25 %	50 %	25 %	386611944
93	NC_017642	ACAA	2	8	37084	37091	75 %	0 %	0 %	25 %	386611944
94	NC_017642	GAAG	2	8	37194	37201	50 %	0 %	50 %	0 %	386611944
95	NC_017642	GGTT	2	8	37367	37374	0 %	50 %	50 %	0 %	386611945
96	NC_017642	TCAA	2	8	37960	37967	50 %	25 %	0 %	25 %	386611945
97	NC_017642	ATCT	2	8	37977	37984	25 %	50 %	0 %	25 %	386611945
98	NC_017642	CGGT	2	8	39929	39936	0 %	25 %	50 %	25 %	386611946
99	NC_017642	CAGG	2	8	40034	40041	25 %	0 %	50 %	25 %	386611946
100	NC_017642	GTTC	2	8	40061	40068	0 %	50 %	25 %	25 %	386611946
101	NC_017642	GCAG	2	8	40449	40456	25 %	0 %	50 %	25 %	386611946
102	NC_017642	ATCA	2	8	40501	40508	50 %	25 %	0 %	25 %	386611946
103	NC_017642	ATTT	2	8	41970	41977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017642	ATCA	2	8	42130	42137	50 %	25 %	0 %	25 %	386611948
105	NC_017642	ATCA	2	8	43098	43105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017642	ACTG	2	8	43584	43591	25 %	25 %	25 %	25 %	386611949
107	NC_017642	GCCG	2	8	43985	43992	0 %	0 %	50 %	50 %	386611949
108	NC_017642	CTGG	2	8	44101	44108	0 %	25 %	50 %	25 %	386611950
109	NC_017642	CCGG	2	8	44810	44817	0 %	0 %	50 %	50 %	386611951
110	NC_017642	ATCC	2	8	45354	45361	25 %	25 %	0 %	50 %	386611951
111	NC_017642	TGCA	2	8	45493	45500	25 %	25 %	25 %	25 %	386611951
112	NC_017642	GTTG	2	8	46224	46231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017642	TAAT	2	8	46528	46535	50 %	50 %	0 %	0 %	386611952
114	NC_017642	AATG	2	8	46555	46562	50 %	25 %	25 %	0 %	386611952
115	NC_017642	GCTG	2	8	46564	46571	0 %	25 %	50 %	25 %	386611952
116	NC_017642	TGTC	2	8	46685	46692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017642	AGTG	2	8	46856	46863	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017642	GATT	2	8	46886	46893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017642	GGAG	2	8	47161	47168	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017642	GATA	2	8	47447	47454	50 %	25 %	25 %	0 %	386611953
121	NC_017642	TTGT	2	8	47564	47571	0 %	75 %	25 %	0 %	386611953
122	NC_017642	AAGA	2	8	47754	47761	75 %	0 %	25 %	0 %	386611953
123	NC_017642	TCTG	2	8	47808	47815	0 %	50 %	25 %	25 %	386611953
124	NC_017642	CTAT	2	8	47856	47863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017642	AATA	2	8	48007	48014	75 %	25 %	0 %	0 %	386611954
126	NC_017642	AGGT	2	8	48091	48098	25 %	25 %	50 %	0 %	386611954
127	NC_017642	GAAT	2	8	48462	48469	50 %	25 %	25 %	0 %	386611954
128	NC_017642	CAGC	2	8	48987	48994	25 %	0 %	25 %	50 %	386611954
129	NC_017642	ACCC	2	8	49049	49056	25 %	0 %	0 %	75 %	386611954
130	NC_017642	GGCT	2	8	49380	49387	0 %	25 %	50 %	25 %	386611954
131	NC_017642	TTAA	2	8	50123	50130	50 %	50 %	0 %	0 %	386611954
132	NC_017642	GCCA	2	8	50214	50221	25 %	0 %	25 %	50 %	386611955
133	NC_017642	TGGC	2	8	50516	50523	0 %	25 %	50 %	25 %	386611955
134	NC_017642	TGAT	2	8	50802	50809	25 %	50 %	25 %	0 %	386611956
135	NC_017642	TGAT	2	8	51795	51802	25 %	50 %	25 %	0 %	386611956
136	NC_017642	GCCC	2	8	52641	52648	0 %	0 %	25 %	75 %	386611958
137	NC_017642	GCCT	2	8	53300	53307	0 %	25 %	25 %	50 %	386611958
138	NC_017642	CAGA	2	8	54211	54218	50 %	0 %	25 %	25 %	386611958
139	NC_017642	CCGC	2	8	54700	54707	0 %	0 %	25 %	75 %	386611958
140	NC_017642	GCTG	2	8	54808	54815	0 %	25 %	50 %	25 %	386611958
141	NC_017642	CAGG	2	8	54824	54831	25 %	0 %	50 %	25 %	386611958
142	NC_017642	TCTG	2	8	54865	54872	0 %	50 %	25 %	25 %	386611958
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144	NC_017642	CTGT	2	8	55491	55498	0 %	50 %	25 %	25 %	386611958
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.