MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017642	TCTT	2	8	311	318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017642	CAAA	2	8	1670	1677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017642	GGCT	2	8	3732	3739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017642	ATAA	2	8	3938	3945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017642	TACT	2	8	4036	4043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017642	TGAT	2	8	7531	7538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017642	TAAA	2	8	7578	7585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017642	CTTT	2	8	7950	7957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017642	CATC	2	8	9274	9281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017642	TTTA	2	8	9746	9753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017642	TGAG	2	8	9833	9840	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017642	AACA	2	8	12577	12584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017642	TGTA	2	8	16693	16700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017642	ATGA	2	8	19029	19036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017642	ACGG	2	8	21289	21296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017642	ACGG	2	8	21381	21388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017642	TCAG	2	8	22787	22794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017642	GCCT	2	8	29162	29169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017642	CTAT	2	8	30337	30344	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017642	ATAA	2	8	32246	32253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017642	AGTG	2	8	34261	34268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017642	AAGA	2	8	34279	34286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017642	TGTT	2	8	34491	34498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017642	TTCG	2	8	34646	34653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017642	ATTT	2	8	41970	41977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017642	ATCA	2	8	43098	43105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017642	GTTG	2	8	46224	46231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017642	TGTC	2	8	46685	46692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017642	AGTG	2	8	46856	46863	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017642	GATT	2	8	46886	46893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017642	GGAG	2	8	47161	47168	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017642	CTAT	2	8	47856	47863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017642	GTTC	2	8	68632	68639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017642	CAGC	2	8	70154	70161	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017642	ACAG	2	8	70256	70263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017642	GTTT	2	8	70270	70277	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017642	AAAT	2	8	70300	70307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017642	CTGG	2	8	70364	70371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017642	CTTG	2	8	74959	74966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017642	GTTA	2	8	85772	85779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017642	TAAG	2	8	85790	85797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017642	AGGC	2	8	86670	86677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017642	AGAA	2	8	87177	87184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017642	AAAG	2	8	87823	87830	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017642	AGAA	2	8	87891	87898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017642	GGCC	2	8	88722	88729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017642	TTTC	2	8	88770	88777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017642	TCTT	2	8	89305	89312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017642	TGCC	2	8	90282	90289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.