MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017642	AACG	2	8	780	787	50 %	0 %	25 %	25 %	386611904
2	NC_017642	TCCG	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	386611904
3	NC_017642	CTGC	2	8	1328	1335	0 %	25 %	25 %	50 %	386611904
4	NC_017642	GCTG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	50 %	25 %	386611904
5	NC_017642	CCCG	2	8	2719	2726	0 %	0 %	25 %	75 %	386611906
6	NC_017642	GGGA	2	8	3491	3498	25 %	0 %	75 %	0 %	386611907
7	NC_017642	CTGG	2	8	3532	3539	0 %	25 %	50 %	25 %	386611907
8	NC_017642	AAAG	2	8	5109	5116	75 %	0 %	25 %	0 %	386611908
9	NC_017642	GCAG	2	8	6111	6118	25 %	0 %	50 %	25 %	386611909
10	NC_017642	TGCT	2	8	6308	6315	0 %	50 %	25 %	25 %	386611909
11	NC_017642	ATCA	2	8	6994	7001	50 %	25 %	0 %	25 %	386611909
12	NC_017642	AATT	2	8	7056	7063	50 %	50 %	0 %	0 %	386611909
13	NC_017642	ACAG	2	8	7609	7616	50 %	0 %	25 %	25 %	386611910
14	NC_017642	AGAA	2	8	7632	7639	75 %	0 %	25 %	0 %	386611910
15	NC_017642	GCAA	2	8	7693	7700	50 %	0 %	25 %	25 %	386611910
16	NC_017642	CGGC	2	8	8776	8783	0 %	0 %	50 %	50 %	386611912
17	NC_017642	CAGC	2	8	8832	8839	25 %	0 %	25 %	50 %	386611912
18	NC_017642	CAGC	2	8	8966	8973	25 %	0 %	25 %	50 %	386611912
19	NC_017642	CATT	2	8	9100	9107	25 %	50 %	0 %	25 %	386611912
20	NC_017642	ATTA	2	8	10095	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	386611913
21	NC_017642	GCAG	2	8	10184	10191	25 %	0 %	50 %	25 %	386611913
22	NC_017642	CTTC	2	8	10559	10566	0 %	50 %	0 %	50 %	386611914
23	NC_017642	TGTT	2	8	10635	10642	0 %	75 %	25 %	0 %	386611914
24	NC_017642	CCTC	2	8	10750	10757	0 %	25 %	0 %	75 %	386611914
25	NC_017642	CCTG	2	8	10923	10930	0 %	25 %	25 %	50 %	386611915
26	NC_017642	AGGA	2	8	11238	11245	50 %	0 %	50 %	0 %	386611915
27	NC_017642	CAGC	2	8	11301	11308	25 %	0 %	25 %	50 %	386611915
28	NC_017642	CAGG	2	8	11363	11370	25 %	0 %	50 %	25 %	386611915
29	NC_017642	CTGA	2	8	12186	12193	25 %	25 %	25 %	25 %	386611916
30	NC_017642	AACA	2	8	12501	12508	75 %	0 %	0 %	25 %	386611916
31	NC_017642	TGTT	2	8	13279	13286	0 %	75 %	25 %	0 %	386611918
32	NC_017642	GAAA	3	12	13678	13689	75 %	0 %	25 %	0 %	386611918
33	NC_017642	AAAT	2	8	14305	14312	75 %	25 %	0 %	0 %	386611919
34	NC_017642	GTTA	2	8	14425	14432	25 %	50 %	25 %	0 %	386611919
35	NC_017642	CAGC	2	8	14939	14946	25 %	0 %	25 %	50 %	386611920
36	NC_017642	GTGA	2	8	16016	16023	25 %	25 %	50 %	0 %	386611921
37	NC_017642	AGAA	2	8	16251	16258	75 %	0 %	25 %	0 %	386611921
38	NC_017642	CAGC	2	8	16432	16439	25 %	0 %	25 %	50 %	386611922
39	NC_017642	GCTG	2	8	17309	17316	0 %	25 %	50 %	25 %	386611923
40	NC_017642	TTCA	2	8	17617	17624	25 %	50 %	0 %	25 %	386611923
41	NC_017642	TGGC	2	8	17739	17746	0 %	25 %	50 %	25 %	386611923
42	NC_017642	CGGG	2	8	17897	17904	0 %	0 %	75 %	25 %	386611924
43	NC_017642	GCAG	2	8	18780	18787	25 %	0 %	50 %	25 %	386611925
44	NC_017642	CAGT	2	8	19923	19930	25 %	25 %	25 %	25 %	386611927
45	NC_017642	TGGC	2	8	19993	20000	0 %	25 %	50 %	25 %	386611927
46	NC_017642	GGCA	2	8	21714	21721	25 %	0 %	50 %	25 %	386611930
47	NC_017642	TAAG	2	8	23616	23623	50 %	25 %	25 %	0 %	386611933
48	NC_017642	AAGC	2	8	23718	23725	50 %	0 %	25 %	25 %	386611933
49	NC_017642	GAAC	2	8	24691	24698	50 %	0 %	25 %	25 %	386611933
50	NC_017642	ACGC	2	8	24988	24995	25 %	0 %	25 %	50 %	386611933
51	NC_017642	GAAG	2	8	25156	25163	50 %	0 %	50 %	0 %	386611933
52	NC_017642	TCAC	2	8	25788	25795	25 %	25 %	0 %	50 %	386611934
53	NC_017642	CTTT	2	8	26252	26259	0 %	75 %	0 %	25 %	386611935
54	NC_017642	TGGC	2	8	26356	26363	0 %	25 %	50 %	25 %	386611935
55	NC_017642	CCGT	2	8	26443	26450	0 %	25 %	25 %	50 %	386611935
56	NC_017642	GAAG	2	8	27507	27514	50 %	0 %	50 %	0 %	386611936
57	NC_017642	CAAA	2	8	27624	27631	75 %	0 %	0 %	25 %	386611936
58	NC_017642	GCTG	2	8	27844	27851	0 %	25 %	50 %	25 %	386611936
59	NC_017642	CTGG	2	8	31101	31108	0 %	25 %	50 %	25 %	386611940
60	NC_017642	TCAC	2	8	31619	31626	25 %	25 %	0 %	50 %	386611940
61	NC_017642	TACA	2	8	32511	32518	50 %	25 %	0 %	25 %	386611941
62	NC_017642	TGAT	2	8	33210	33217	25 %	50 %	25 %	0 %	386611942
63	NC_017642	CCTG	2	8	33723	33730	0 %	25 %	25 %	50 %	386611943
64	NC_017642	TGCC	2	8	35180	35187	0 %	25 %	25 %	50 %	386611944
65	NC_017642	GATG	2	8	35453	35460	25 %	25 %	50 %	0 %	386611944
66	NC_017642	AAAG	2	8	36054	36061	75 %	0 %	25 %	0 %	386611944
67	NC_017642	TTTG	2	8	36317	36324	0 %	75 %	25 %	0 %	386611944
68	NC_017642	GCTG	2	8	36359	36366	0 %	25 %	50 %	25 %	386611944
69	NC_017642	ACAA	2	8	37084	37091	75 %	0 %	0 %	25 %	386611944
70	NC_017642	GAAG	2	8	37194	37201	50 %	0 %	50 %	0 %	386611944
71	NC_017642	GGTT	2	8	37367	37374	0 %	50 %	50 %	0 %	386611945
72	NC_017642	TCAA	2	8	37960	37967	50 %	25 %	0 %	25 %	386611945
73	NC_017642	ATCT	2	8	37977	37984	25 %	50 %	0 %	25 %	386611945
74	NC_017642	CGGT	2	8	39929	39936	0 %	25 %	50 %	25 %	386611946
75	NC_017642	CAGG	2	8	40034	40041	25 %	0 %	50 %	25 %	386611946
76	NC_017642	GTTC	2	8	40061	40068	0 %	50 %	25 %	25 %	386611946
77	NC_017642	GCAG	2	8	40449	40456	25 %	0 %	50 %	25 %	386611946
78	NC_017642	ATCA	2	8	40501	40508	50 %	25 %	0 %	25 %	386611946
79	NC_017642	ATCA	2	8	42130	42137	50 %	25 %	0 %	25 %	386611948
80	NC_017642	ACTG	2	8	43584	43591	25 %	25 %	25 %	25 %	386611949
81	NC_017642	GCCG	2	8	43985	43992	0 %	0 %	50 %	50 %	386611949
82	NC_017642	CTGG	2	8	44101	44108	0 %	25 %	50 %	25 %	386611950
83	NC_017642	CCGG	2	8	44810	44817	0 %	0 %	50 %	50 %	386611951
84	NC_017642	ATCC	2	8	45354	45361	25 %	25 %	0 %	50 %	386611951
85	NC_017642	TGCA	2	8	45493	45500	25 %	25 %	25 %	25 %	386611951
86	NC_017642	TAAT	2	8	46528	46535	50 %	50 %	0 %	0 %	386611952
87	NC_017642	AATG	2	8	46555	46562	50 %	25 %	25 %	0 %	386611952
88	NC_017642	GCTG	2	8	46564	46571	0 %	25 %	50 %	25 %	386611952
89	NC_017642	GATA	2	8	47447	47454	50 %	25 %	25 %	0 %	386611953
90	NC_017642	TTGT	2	8	47564	47571	0 %	75 %	25 %	0 %	386611953
91	NC_017642	AAGA	2	8	47754	47761	75 %	0 %	25 %	0 %	386611953
92	NC_017642	TCTG	2	8	47808	47815	0 %	50 %	25 %	25 %	386611953
93	NC_017642	AATA	2	8	48007	48014	75 %	25 %	0 %	0 %	386611954
94	NC_017642	AGGT	2	8	48091	48098	25 %	25 %	50 %	0 %	386611954
95	NC_017642	GAAT	2	8	48462	48469	50 %	25 %	25 %	0 %	386611954
96	NC_017642	CAGC	2	8	48987	48994	25 %	0 %	25 %	50 %	386611954
97	NC_017642	ACCC	2	8	49049	49056	25 %	0 %	0 %	75 %	386611954
98	NC_017642	GGCT	2	8	49380	49387	0 %	25 %	50 %	25 %	386611954
99	NC_017642	TTAA	2	8	50123	50130	50 %	50 %	0 %	0 %	386611954
100	NC_017642	GCCA	2	8	50214	50221	25 %	0 %	25 %	50 %	386611955
101	NC_017642	TGGC	2	8	50516	50523	0 %	25 %	50 %	25 %	386611955
102	NC_017642	TGAT	2	8	50802	50809	25 %	50 %	25 %	0 %	386611956
103	NC_017642	TGAT	2	8	51795	51802	25 %	50 %	25 %	0 %	386611956
104	NC_017642	GCCC	2	8	52641	52648	0 %	0 %	25 %	75 %	386611958
105	NC_017642	GCCT	2	8	53300	53307	0 %	25 %	25 %	50 %	386611958
106	NC_017642	CAGA	2	8	54211	54218	50 %	0 %	25 %	25 %	386611958
107	NC_017642	CCGC	2	8	54700	54707	0 %	0 %	25 %	75 %	386611958
108	NC_017642	GCTG	2	8	54808	54815	0 %	25 %	50 %	25 %	386611958
109	NC_017642	CAGG	2	8	54824	54831	25 %	0 %	50 %	25 %	386611958
110	NC_017642	TCTG	2	8	54865	54872	0 %	50 %	25 %	25 %	386611958
111	NC_017642	GCCA	2	8	55120	55127	25 %	0 %	25 %	50 %	386611958
112	NC_017642	CTGT	2	8	55491	55498	0 %	50 %	25 %	25 %	386611958
113	NC_017642	ATCA	2	8	55702	55709	50 %	25 %	0 %	25 %	386611959
114	NC_017642	ATGA	2	8	55725	55732	50 %	25 %	25 %	0 %	386611959
115	NC_017642	TGGA	2	8	55969	55976	25 %	25 %	50 %	0 %	386611959
116	NC_017642	CAGA	2	8	56167	56174	50 %	0 %	25 %	25 %	386611959
117	NC_017642	GATA	2	8	56826	56833	50 %	25 %	25 %	0 %	386611960
118	NC_017642	CGAT	2	8	57237	57244	25 %	25 %	25 %	25 %	386611961
119	NC_017642	TGGT	2	8	59246	59253	0 %	50 %	50 %	0 %	386611963
120	NC_017642	TTTC	2	8	59676	59683	0 %	75 %	0 %	25 %	386611963
121	NC_017642	GAAC	2	8	59856	59863	50 %	0 %	25 %	25 %	386611964
122	NC_017642	TGGT	2	8	60025	60032	0 %	50 %	50 %	0 %	386611964
123	NC_017642	GCAG	2	8	60516	60523	25 %	0 %	50 %	25 %	386611964
124	NC_017642	GTGC	2	8	60612	60619	0 %	25 %	50 %	25 %	386611964
125	NC_017642	GCTG	2	8	61135	61142	0 %	25 %	50 %	25 %	386611965
126	NC_017642	TTCA	2	8	61445	61452	25 %	50 %	0 %	25 %	386611966
127	NC_017642	GACA	2	8	61554	61561	50 %	0 %	25 %	25 %	386611966
128	NC_017642	GCTC	2	8	61623	61630	0 %	25 %	25 %	50 %	386611966
129	NC_017642	CCTG	2	8	61809	61816	0 %	25 %	25 %	50 %	386611967
130	NC_017642	CGCT	2	8	62968	62975	0 %	25 %	25 %	50 %	386611967
131	NC_017642	TCTG	2	8	63205	63212	0 %	50 %	25 %	25 %	386611967
132	NC_017642	AGGA	2	8	63655	63662	50 %	0 %	50 %	0 %	386611967
133	NC_017642	TTTG	2	8	63744	63751	0 %	75 %	25 %	0 %	386611967
134	NC_017642	ATTC	2	8	63819	63826	25 %	50 %	0 %	25 %	386611967
135	NC_017642	TCCA	2	8	64663	64670	25 %	25 %	0 %	50 %	386611967
136	NC_017642	TCTG	2	8	65093	65100	0 %	50 %	25 %	25 %	386611967
137	NC_017642	CAGC	2	8	65359	65366	25 %	0 %	25 %	50 %	386611967
138	NC_017642	CGGG	2	8	65392	65399	0 %	0 %	75 %	25 %	386611967
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.