MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017642	GA	3	6	236	241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017642	GC	3	6	656	661	0 %	0 %	50 %	50 %	386611904
3	NC_017642	CA	3	6	877	882	50 %	0 %	0 %	50 %	386611904
4	NC_017642	GC	3	6	1306	1311	0 %	0 %	50 %	50 %	386611904
5	NC_017642	CG	3	6	1871	1876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017642	CA	3	6	1934	1939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017642	TA	3	6	2356	2361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017642	AT	3	6	2371	2376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017642	TA	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	386611906
10	NC_017642	TA	3	6	2983	2988	50 %	50 %	0 %	0 %	386611906
11	NC_017642	AT	3	6	3907	3912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017642	TC	3	6	3913	3918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017642	GC	3	6	5954	5959	0 %	0 %	50 %	50 %	386611909
14	NC_017642	CT	3	6	6004	6009	0 %	50 %	0 %	50 %	386611909
15	NC_017642	AC	3	6	6041	6046	50 %	0 %	0 %	50 %	386611909
16	NC_017642	GA	3	6	6123	6128	50 %	0 %	50 %	0 %	386611909
17	NC_017642	AG	3	6	6180	6185	50 %	0 %	50 %	0 %	386611909
18	NC_017642	AG	3	6	7126	7131	50 %	0 %	50 %	0 %	386611909
19	NC_017642	AT	3	6	7279	7284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017642	TA	3	6	7640	7645	50 %	50 %	0 %	0 %	386611910
21	NC_017642	AG	3	6	7817	7822	50 %	0 %	50 %	0 %	386611910
22	NC_017642	AT	3	6	7879	7884	50 %	50 %	0 %	0 %	386611910
23	NC_017642	GC	3	6	8818	8823	0 %	0 %	50 %	50 %	386611912
24	NC_017642	TG	3	6	9337	9342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017642	GA	3	6	10133	10138	50 %	0 %	50 %	0 %	386611913
26	NC_017642	TG	3	6	10324	10329	0 %	50 %	50 %	0 %	386611914
27	NC_017642	CT	3	6	10592	10597	0 %	50 %	0 %	50 %	386611914
28	NC_017642	GT	4	8	10619	10626	0 %	50 %	50 %	0 %	386611914
29	NC_017642	GC	3	6	11122	11127	0 %	0 %	50 %	50 %	386611915
30	NC_017642	AT	3	6	11727	11732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017642	AT	3	6	12850	12855	50 %	50 %	0 %	0 %	386611917
32	NC_017642	AG	3	6	12869	12874	50 %	0 %	50 %	0 %	386611917
33	NC_017642	TG	3	6	12935	12940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017642	TG	3	6	13173	13178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017642	TG	3	6	14153	14158	0 %	50 %	50 %	0 %	386611918
36	NC_017642	GC	3	6	14416	14421	0 %	0 %	50 %	50 %	386611919
37	NC_017642	TG	3	6	15034	15039	0 %	50 %	50 %	0 %	386611920
38	NC_017642	GA	3	6	15641	15646	50 %	0 %	50 %	0 %	386611920
39	NC_017642	GC	3	6	15867	15872	0 %	0 %	50 %	50 %	386611920
40	NC_017642	CA	3	6	15876	15881	50 %	0 %	0 %	50 %	386611920
41	NC_017642	GC	3	6	16245	16250	0 %	0 %	50 %	50 %	386611921
42	NC_017642	TA	3	6	16699	16704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017642	CA	4	8	16726	16733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017642	GT	3	6	16908	16913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017642	AC	3	6	17317	17322	50 %	0 %	0 %	50 %	386611923
46	NC_017642	TG	3	6	17522	17527	0 %	50 %	50 %	0 %	386611923
47	NC_017642	CA	3	6	18746	18751	50 %	0 %	0 %	50 %	386611925
48	NC_017642	GC	3	6	18977	18982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017642	GC	3	6	19342	19347	0 %	0 %	50 %	50 %	386611926
50	NC_017642	TC	3	6	20907	20912	0 %	50 %	0 %	50 %	386611929
51	NC_017642	CG	3	6	22068	22073	0 %	0 %	50 %	50 %	386611931
52	NC_017642	GT	3	6	22445	22450	0 %	50 %	50 %	0 %	386611931
53	NC_017642	GC	3	6	23027	23032	0 %	0 %	50 %	50 %	386611932
54	NC_017642	AG	3	6	23622	23627	50 %	0 %	50 %	0 %	386611933
55	NC_017642	CG	3	6	23636	23641	0 %	0 %	50 %	50 %	386611933
56	NC_017642	CG	3	6	24298	24303	0 %	0 %	50 %	50 %	386611933
57	NC_017642	TG	4	8	24853	24860	0 %	50 %	50 %	0 %	386611933
58	NC_017642	TG	3	6	25575	25580	0 %	50 %	50 %	0 %	386611933
59	NC_017642	TC	3	6	25941	25946	0 %	50 %	0 %	50 %	386611934
60	NC_017642	CT	3	6	27742	27747	0 %	50 %	0 %	50 %	386611936
61	NC_017642	CG	3	6	27748	27753	0 %	0 %	50 %	50 %	386611936
62	NC_017642	GT	3	6	29487	29492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017642	CT	3	6	30290	30295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017642	CG	3	6	30591	30596	0 %	0 %	50 %	50 %	386611939
65	NC_017642	CA	3	6	31929	31934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017642	GT	3	6	32419	32424	0 %	50 %	50 %	0 %	386611941
67	NC_017642	GA	3	6	32548	32553	50 %	0 %	50 %	0 %	386611941
68	NC_017642	GC	3	6	32900	32905	0 %	0 %	50 %	50 %	386611942
69	NC_017642	TC	3	6	33818	33823	0 %	50 %	0 %	50 %	386611943
70	NC_017642	TC	3	6	34037	34042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017642	TC	3	6	34329	34334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017642	TC	3	6	35037	35042	0 %	50 %	0 %	50 %	386611944
73	NC_017642	CA	3	6	36113	36118	50 %	0 %	0 %	50 %	386611944
74	NC_017642	CA	3	6	36556	36561	50 %	0 %	0 %	50 %	386611944
75	NC_017642	GA	3	6	38599	38604	50 %	0 %	50 %	0 %	386611945
76	NC_017642	CA	3	6	38817	38822	50 %	0 %	0 %	50 %	386611945
77	NC_017642	CA	3	6	39909	39914	50 %	0 %	0 %	50 %	386611946
78	NC_017642	AG	3	6	40346	40351	50 %	0 %	50 %	0 %	386611946
79	NC_017642	CT	3	6	41133	41138	0 %	50 %	0 %	50 %	386611947
80	NC_017642	TG	3	6	41532	41537	0 %	50 %	50 %	0 %	386611947
81	NC_017642	TG	3	6	42253	42258	0 %	50 %	50 %	0 %	386611948
82	NC_017642	TC	3	6	42697	42702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017642	GA	3	6	43783	43788	50 %	0 %	50 %	0 %	386611949
84	NC_017642	TC	3	6	44078	44083	0 %	50 %	0 %	50 %	386611950
85	NC_017642	GA	3	6	46806	46811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017642	TA	4	8	48323	48330	50 %	50 %	0 %	0 %	386611954
87	NC_017642	TA	4	8	48645	48652	50 %	50 %	0 %	0 %	386611954
88	NC_017642	CA	3	6	50113	50118	50 %	0 %	0 %	50 %	386611954
89	NC_017642	AT	3	6	51057	51062	50 %	50 %	0 %	0 %	386611956
90	NC_017642	GT	3	6	51370	51375	0 %	50 %	50 %	0 %	386611956
91	NC_017642	AG	3	6	52982	52987	50 %	0 %	50 %	0 %	386611958
92	NC_017642	GC	3	6	53426	53431	0 %	0 %	50 %	50 %	386611958
93	NC_017642	AG	3	6	53819	53824	50 %	0 %	50 %	0 %	386611958
94	NC_017642	CA	3	6	53825	53830	50 %	0 %	0 %	50 %	386611958
95	NC_017642	TG	3	6	54724	54729	0 %	50 %	50 %	0 %	386611958
96	NC_017642	AG	3	6	55422	55427	50 %	0 %	50 %	0 %	386611958
97	NC_017642	AG	3	6	55883	55888	50 %	0 %	50 %	0 %	386611959
98	NC_017642	GT	3	6	56305	56310	0 %	50 %	50 %	0 %	386611959
99	NC_017642	AT	3	6	57161	57166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017642	TG	3	6	58196	58201	0 %	50 %	50 %	0 %	386611962
101	NC_017642	AT	3	6	59095	59100	50 %	50 %	0 %	0 %	386611963
102	NC_017642	AG	3	6	60363	60368	50 %	0 %	50 %	0 %	386611964
103	NC_017642	GA	3	6	61784	61789	50 %	0 %	50 %	0 %	386611967
104	NC_017642	CT	3	6	62636	62641	0 %	50 %	0 %	50 %	386611967
105	NC_017642	CT	3	6	62696	62701	0 %	50 %	0 %	50 %	386611967
106	NC_017642	TG	3	6	62831	62836	0 %	50 %	50 %	0 %	386611967
107	NC_017642	GA	3	6	65744	65749	50 %	0 %	50 %	0 %	386611968
108	NC_017642	AT	3	6	65854	65859	50 %	50 %	0 %	0 %	386611968
109	NC_017642	AT	3	6	66665	66670	50 %	50 %	0 %	0 %	386611969
110	NC_017642	AT	3	6	67025	67030	50 %	50 %	0 %	0 %	386611969
111	NC_017642	GA	3	6	68418	68423	50 %	0 %	50 %	0 %	386611970
112	NC_017642	AC	3	6	68737	68742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017642	TC	4	8	69565	69572	0 %	50 %	0 %	50 %	386611971
114	NC_017642	GA	3	6	71334	71339	50 %	0 %	50 %	0 %	386611974
115	NC_017642	AT	3	6	72722	72727	50 %	50 %	0 %	0 %	386611975
116	NC_017642	TG	3	6	73989	73994	0 %	50 %	50 %	0 %	386611976
117	NC_017642	AC	3	6	74791	74796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017642	AC	3	6	74926	74931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017642	AT	3	6	75866	75871	50 %	50 %	0 %	0 %	386611977
120	NC_017642	TA	3	6	76135	76140	50 %	50 %	0 %	0 %	386611977
121	NC_017642	AC	3	6	76451	76456	50 %	0 %	0 %	50 %	386611978
122	NC_017642	TA	3	6	76469	76474	50 %	50 %	0 %	0 %	386611978
123	NC_017642	GT	4	8	76822	76829	0 %	50 %	50 %	0 %	386611978
124	NC_017642	GA	3	6	76936	76941	50 %	0 %	50 %	0 %	386611978
125	NC_017642	CT	3	6	77039	77044	0 %	50 %	0 %	50 %	386611979
126	NC_017642	TG	3	6	77670	77675	0 %	50 %	50 %	0 %	386611980
127	NC_017642	AG	3	6	78991	78996	50 %	0 %	50 %	0 %	386611981
128	NC_017642	GC	3	6	80316	80321	0 %	0 %	50 %	50 %	386611982
129	NC_017642	GA	3	6	80530	80535	50 %	0 %	50 %	0 %	386611982
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131	NC_017642	CT	3	6	83982	83987	0 %	50 %	0 %	50 %	386611985
132	NC_017642	AT	3	6	84224	84229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017642	TA	3	6	85759	85764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017642	GA	3	6	85845	85850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017642	AT	3	6	86155	86160	50 %	50 %	0 %	0 %	386611988
136	NC_017642	GT	3	6	86376	86381	0 %	50 %	50 %	0 %	386611988
137	NC_017642	AC	3	6	86750	86755	50 %	0 %	0 %	50 %	386611989
138	NC_017642	GA	3	6	87337	87342	50 %	0 %	50 %	0 %	386611990
139	NC_017642	GA	3	6	87453	87458	50 %	0 %	50 %	0 %	386611990
140	NC_017642	CT	3	6	88696	88701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017642	AT	3	6	89718	89723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.