MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 chromosome

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017641	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017641	ACGCGT	2	12	77572	77583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017641	AAGGGA	2	12	86323	86334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017641	TCTCCC	2	12	167376	167387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017641	TCACCC	2	12	167427	167438	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017641	GTAGTG	2	12	203207	203218	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017641	TACACG	2	12	267021	267032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017641	GATATC	2	12	268785	268796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017641	TGTCGC	2	12	269146	269157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017641	GCAGGG	2	12	270937	270948	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017641	TCTGGT	2	12	339863	339874	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017641	TAAGGG	2	12	348066	348077	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017641	TGTGGA	2	12	349213	349224	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017641	TTTTCT	2	12	358927	358938	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017641	CTATTT	2	12	359963	359974	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017641	TTTATT	2	12	382895	382906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017641	TATTGA	2	12	422196	422207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017641	AACAAT	2	12	443369	443380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017641	TATTGA	2	12	446215	446226	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017641	CAGGCG	2	12	527322	527333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017641	TTGGAA	2	12	610081	610092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017641	TGCAAA	2	12	637818	637829	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017641	ATTTTT	2	12	734130	734141	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017641	AATATT	2	12	846376	846387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017641	CAGAAA	2	12	858607	858618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017641	TAACCG	2	12	985285	985296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017641	AAATAA	2	12	1054627	1054638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017641	CTGGAA	2	12	1064191	1064202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017641	TGGCAA	2	12	1066120	1066131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017641	GCATCG	2	12	1066387	1066398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017641	AAAGAT	2	12	1087158	1087169	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017641	TGTCCA	2	12	1107791	1107802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017641	TAAGGA	2	12	1130070	1130081	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017641	ATAATG	2	12	1131484	1131495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017641	AATGAT	2	12	1163515	1163526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017641	GATATT	2	12	1163620	1163631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017641	GATAAA	2	12	1189576	1189587	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017641	CAAAAA	2	12	1192928	1192939	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017641	TGTTAA	2	12	1204208	1204219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017641	ACTTCA	2	12	1206439	1206450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017641	ATTCAA	2	12	1234047	1234058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017641	ATGGAA	2	12	1245051	1245062	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017641	ATTTTT	2	12	1245182	1245193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017641	CGCCAC	2	12	1270490	1270501	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017641	CGTCAC	2	12	1274710	1274721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017641	CAAAAA	2	12	1301976	1301987	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017641	GGATGC	2	12	1376094	1376105	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017641	TTTTGC	2	12	1394351	1394362	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017641	GACAGA	2	12	1395675	1395686	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017641	ATGGAA	2	12	1405044	1405055	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017641	TCTTTA	2	12	1418991	1419002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017641	TTTTGT	2	12	1426655	1426666	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017641	CACAGG	2	12	1429007	1429018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017641	ATCGTA	2	12	1434472	1434483	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017641	CAGGCT	2	12	1447417	1447428	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017641	CTTATT	2	12	1499564	1499575	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017641	CAAAAG	2	12	1506460	1506471	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017641	GGGGGT	2	12	1514680	1514691	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017641	CTGATC	2	12	1516938	1516949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017641	CATCTA	2	12	1522736	1522747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017641	TTGAAG	2	12	1523337	1523348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017641	TGAATA	2	12	1524146	1524157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017641	CTATAA	2	12	1574993	1575004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017641	CATTAG	2	12	1625767	1625778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017641	CAAAAA	2	12	1672599	1672610	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017641	AAAAAC	2	12	1799035	1799046	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017641	TTCATA	2	12	1810626	1810637	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017641	ACCGTT	2	12	1813899	1813910	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017641	TGGTTA	2	12	1822729	1822740	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017641	CAATAC	2	12	1838198	1838209	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017641	CAAAAA	2	12	1899317	1899328	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017641	TTAAAT	2	12	1901116	1901127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017641	TCTGTC	2	12	1913753	1913764	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017641	GAACCA	2	12	1947735	1947746	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017641	TTCAGC	2	12	1957622	1957633	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017641	ATACTT	2	12	2045309	2045320	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017641	AAAATA	2	12	2058966	2058977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017641	TGTTTT	2	12	2059599	2059610	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017641	AAGACT	2	12	2059859	2059870	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017641	TATTAC	2	12	2176085	2176096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017641	TGTTTA	2	12	2189043	2189054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017641	TTTCTT	2	12	2195678	2195689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017641	ATAACC	2	12	2199622	2199633	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017641	ACTGTC	2	12	2243278	2243289	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017641	AATTCA	2	12	2291617	2291628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017641	TCTTAT	2	12	2305434	2305445	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017641	GTGTAT	2	12	2319767	2319778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017641	ACAGCG	2	12	2385754	2385765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017641	ACAGCG	2	12	2386363	2386374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017641	ATTTTT	2	12	2396227	2396238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017641	TTTACG	2	12	2409295	2409306	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017641	AATAAA	2	12	2460710	2460721	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017641	TTTTGT	2	12	2474105	2474116	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017641	TCCCCC	2	12	2504498	2504509	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_017641	GAAAAA	2	12	2551765	2551776	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017641	ATACCG	2	12	2552142	2552153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017641	CCTGTT	2	12	2569432	2569443	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017641	TCTTCC	2	12	2617584	2617595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017641	CCACTA	2	12	2701978	2701989	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017641	TTACCC	2	12	2736969	2736980	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017641	TAAATG	2	12	2754844	2754855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017641	TGTCAC	2	12	2768473	2768484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017641	AGAAAA	2	12	2778753	2778764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017641	TTGTGA	2	12	2798323	2798334	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017641	ATAGGC	2	12	2863221	2863232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017641	CTGATG	2	12	2874988	2874999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017641	GTTATG	2	12	2892829	2892840	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017641	CAAGTG	2	12	2911291	2911302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017641	GTCGCG	2	12	2939973	2939984	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017641	TAAAGG	2	12	3010564	3010575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017641	AAAAAC	2	12	3042846	3042857	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017641	TCCTTC	2	12	3051255	3051266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017641	TGGACA	2	12	3101524	3101535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017641	CAGTTT	2	12	3116111	3116122	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017641	TTTTCA	2	12	3176030	3176041	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017641	TTGAGA	2	12	3192187	3192198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017641	GTTAGT	2	12	3208362	3208373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017641	TTTTAC	2	12	3209608	3209619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017641	GGTTTT	2	12	3344704	3344715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017641	TTTGTT	2	12	3373971	3373982	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017641	GTAAGG	2	12	3490363	3490374	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017641	ACTGAG	2	12	3515352	3515363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017641	TTGAAG	2	12	3546405	3546416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017641	GCAGAA	2	12	3552904	3552915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017641	ACGCAG	2	12	3601825	3601836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017641	TTTTCG	2	12	3608471	3608482	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017641	AGTTGT	2	12	3697262	3697273	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_017641	AATGAT	2	12	3702774	3702785	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017641	GTAACC	2	12	3752512	3752523	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017641	AGACAA	2	12	3754132	3754143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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134	NC_017641	ATATAA	2	12	3775936	3775947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.