MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 chromosome

Total Repeats: 3395

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017641	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	386612164
2	NC_017641	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	386612165
3	NC_017641	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	386612170
4	NC_017641	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	386612171
5	NC_017641	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	386612173
6	NC_017641	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017641	CCGAT	2	10	17840	17849	20 %	20 %	20 %	40 %	386612178
8	NC_017641	AGCGA	2	10	18228	18237	40 %	0 %	40 %	20 %	386612178
9	NC_017641	GTTTT	2	10	20645	20654	0 %	80 %	20 %	0 %	386612181
10	NC_017641	TTAAT	2	10	23656	23665	40 %	60 %	0 %	0 %	386612184
11	NC_017641	CAGTA	2	10	29930	29939	40 %	20 %	20 %	20 %	386612190
12	NC_017641	GCGCT	2	10	31731	31740	0 %	20 %	40 %	40 %	386612192
13	NC_017641	ATTTA	2	10	32487	32496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017641	GCGAA	2	10	35725	35734	40 %	0 %	40 %	20 %	386612195
15	NC_017641	CCGTT	2	10	36619	36628	0 %	40 %	20 %	40 %	386612195
16	NC_017641	CACGG	2	10	36996	37005	20 %	0 %	40 %	40 %	386612195
17	NC_017641	GATGC	2	10	37988	37997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017641	GATGC	2	10	38078	38087	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017641	CGAAT	2	10	39829	39838	40 %	20 %	20 %	20 %	386612200
20	NC_017641	CCATG	2	10	41367	41376	20 %	20 %	20 %	40 %	386612201
21	NC_017641	TTCAG	2	10	41549	41558	20 %	40 %	20 %	20 %	386612201
22	NC_017641	CCGTA	2	10	43013	43022	20 %	20 %	20 %	40 %	386612202
23	NC_017641	GTACA	2	10	43503	43512	40 %	20 %	20 %	20 %	386612202
24	NC_017641	TTAAA	2	10	43751	43760	60 %	40 %	0 %	0 %	386612202
25	NC_017641	ACCCA	2	10	44494	44503	40 %	0 %	0 %	60 %	386612203
26	NC_017641	TTTGA	2	10	46120	46129	20 %	60 %	20 %	0 %	386612204
27	NC_017641	CGGCG	2	10	46371	46380	0 %	0 %	60 %	40 %	386612204
28	NC_017641	AATCA	2	10	46653	46662	60 %	20 %	0 %	20 %	386612205
29	NC_017641	CGGTT	2	10	47608	47617	0 %	40 %	40 %	20 %	386612206
30	NC_017641	TGGCG	2	10	49300	49309	0 %	20 %	60 %	20 %	386612208
31	NC_017641	TGCAC	2	10	51062	51071	20 %	20 %	20 %	40 %	386612209
32	NC_017641	GCGTT	2	10	51767	51776	0 %	40 %	40 %	20 %	386612210
33	NC_017641	AGGGC	2	10	52147	52156	20 %	0 %	60 %	20 %	386612210
34	NC_017641	GGCGC	2	10	52181	52190	0 %	0 %	60 %	40 %	386612210
35	NC_017641	GAAAC	2	10	52994	53003	60 %	0 %	20 %	20 %	386612210
36	NC_017641	AACGT	2	10	54906	54915	40 %	20 %	20 %	20 %	386612213
37	NC_017641	GCGTC	2	10	57890	57899	0 %	20 %	40 %	40 %	386612216
38	NC_017641	ATGTT	2	10	58704	58713	20 %	60 %	20 %	0 %	386612217
39	NC_017641	CTTCG	2	10	59137	59146	0 %	40 %	20 %	40 %	386612217
40	NC_017641	TGCGT	2	10	59423	59432	0 %	40 %	40 %	20 %	386612217
41	NC_017641	AAAGT	2	10	65157	65166	60 %	20 %	20 %	0 %	386612220
42	NC_017641	GTGCT	2	10	66421	66430	0 %	40 %	40 %	20 %	386612221
43	NC_017641	GGTGA	2	10	67405	67414	20 %	20 %	60 %	0 %	386612221
44	NC_017641	GTGGC	2	10	68238	68247	0 %	20 %	60 %	20 %	386612222
45	NC_017641	CAGCG	2	10	68858	68867	20 %	0 %	40 %	40 %	386612223
46	NC_017641	TCGCG	2	10	70128	70137	0 %	20 %	40 %	40 %	386612223
47	NC_017641	GCTGA	2	10	70507	70516	20 %	20 %	40 %	20 %	386612224
48	NC_017641	TAGTG	2	10	77606	77615	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017641	GATGG	2	10	78494	78503	20 %	20 %	60 %	0 %	386612230
50	NC_017641	ATTTT	2	10	79322	79331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017641	CTGGT	2	10	83687	83696	0 %	40 %	40 %	20 %	386612235
52	NC_017641	GACCG	2	10	84235	84244	20 %	0 %	40 %	40 %	386612236
53	NC_017641	ATGTT	2	10	86784	86793	20 %	60 %	20 %	0 %	386612237
54	NC_017641	AAAAC	2	10	87199	87208	80 %	0 %	0 %	20 %	386612237
55	NC_017641	ATTCC	2	10	87896	87905	20 %	40 %	0 %	40 %	386612239
56	NC_017641	AGTTC	2	10	92989	92998	20 %	40 %	20 %	20 %	386612245
57	NC_017641	CGTGG	2	10	94362	94371	0 %	20 %	60 %	20 %	386612247
58	NC_017641	TATCG	2	10	94869	94878	20 %	40 %	20 %	20 %	386612247
59	NC_017641	GCCTG	2	10	99201	99210	0 %	20 %	40 %	40 %	386612251
60	NC_017641	ACCGT	2	10	101114	101123	20 %	20 %	20 %	40 %	386612252
61	NC_017641	ATCAG	2	10	102887	102896	40 %	20 %	20 %	20 %	386612254
62	NC_017641	AGCCG	2	10	104655	104664	20 %	0 %	40 %	40 %	386612255
63	NC_017641	GCGCA	2	10	106983	106992	20 %	0 %	40 %	40 %	386612257
64	NC_017641	TGGCG	2	10	107977	107986	0 %	20 %	60 %	20 %	386612258
65	NC_017641	CCGGC	2	10	110947	110956	0 %	0 %	40 %	60 %	386612261
66	NC_017641	GGGAA	2	10	113304	113313	40 %	0 %	60 %	0 %	386612262
67	NC_017641	CGCGG	2	10	114272	114281	0 %	0 %	60 %	40 %	386612264
68	NC_017641	ATCCC	2	10	116516	116525	20 %	20 %	0 %	60 %	386612267
69	NC_017641	CATCG	2	10	116529	116538	20 %	20 %	20 %	40 %	386612267
70	NC_017641	TAACG	2	10	117223	117232	40 %	20 %	20 %	20 %	386612267
71	NC_017641	ATGCC	2	10	117682	117691	20 %	20 %	20 %	40 %	386612267
72	NC_017641	AATGC	2	10	118965	118974	40 %	20 %	20 %	20 %	386612268
73	NC_017641	TCTGT	2	10	119911	119920	0 %	60 %	20 %	20 %	386612270
74	NC_017641	GCATG	2	10	121004	121013	20 %	20 %	40 %	20 %	386612271
75	NC_017641	AGCAG	2	10	122342	122351	40 %	0 %	40 %	20 %	386612273
76	NC_017641	TCAGC	2	10	123210	123219	20 %	20 %	20 %	40 %	386612273
77	NC_017641	CGAAG	2	10	124257	124266	40 %	0 %	40 %	20 %	386612274
78	NC_017641	ACACG	2	10	124390	124399	40 %	0 %	20 %	40 %	386612274
79	NC_017641	TCGCG	2	10	124651	124660	0 %	20 %	40 %	40 %	386612274
80	NC_017641	GCATC	2	10	124741	124750	20 %	20 %	20 %	40 %	386612274
81	NC_017641	GACTG	2	10	126059	126068	20 %	20 %	40 %	20 %	386612275
82	NC_017641	AGAGC	2	10	126469	126478	40 %	0 %	40 %	20 %	386612275
83	NC_017641	AGGCG	2	10	131741	131750	20 %	0 %	60 %	20 %	386612278
84	NC_017641	AGGCG	2	10	131837	131846	20 %	0 %	60 %	20 %	386612278
85	NC_017641	GGTTG	2	10	132494	132503	0 %	40 %	60 %	0 %	386612278
86	NC_017641	TCTGG	2	10	135140	135149	0 %	40 %	40 %	20 %	386612279
87	NC_017641	GGGCA	2	10	136552	136561	20 %	0 %	60 %	20 %	386612280
88	NC_017641	CAGCG	2	10	136831	136840	20 %	0 %	40 %	40 %	386612281
89	NC_017641	TTTCG	2	10	139040	139049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017641	GGCTG	2	10	139542	139551	0 %	20 %	60 %	20 %	386612284
91	NC_017641	GCGCG	2	10	143025	143034	0 %	0 %	60 %	40 %	386612286
92	NC_017641	CCGTC	2	10	143816	143825	0 %	20 %	20 %	60 %	386612287
93	NC_017641	GTGAA	2	10	143826	143835	40 %	20 %	40 %	0 %	386612287
94	NC_017641	GGCAT	2	10	143988	143997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017641	GTTCA	2	10	144213	144222	20 %	40 %	20 %	20 %	386612288
96	NC_017641	ATCCA	2	10	144539	144548	40 %	20 %	0 %	40 %	386612288
97	NC_017641	GTAAG	2	10	144752	144761	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017641	CTTTA	2	10	145802	145811	20 %	60 %	0 %	20 %	386612290
99	NC_017641	TGGCG	2	10	146029	146038	0 %	20 %	60 %	20 %	386612290
100	NC_017641	TCCTC	2	10	146472	146481	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_017641	TTTCA	2	10	148342	148351	20 %	60 %	0 %	20 %	386612293
102	NC_017641	GGGAG	2	10	149667	149676	20 %	0 %	80 %	0 %	386612295
103	NC_017641	GAAAA	2	10	152461	152470	80 %	0 %	20 %	0 %	386612298
104	NC_017641	CAGAC	2	10	152537	152546	40 %	0 %	20 %	40 %	386612298
105	NC_017641	TTTGC	2	10	159447	159456	0 %	60 %	20 %	20 %	386612304
106	NC_017641	AAATT	2	10	159888	159897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017641	GCGAG	2	10	161255	161264	20 %	0 %	60 %	20 %	386612307
108	NC_017641	GGCGT	2	10	161693	161702	0 %	20 %	60 %	20 %	386612307
109	NC_017641	ACCAC	2	10	164596	164605	40 %	0 %	0 %	60 %	386612311
110	NC_017641	GGCGT	2	10	166299	166308	0 %	20 %	60 %	20 %	386612312
111	NC_017641	CGACG	2	10	167338	167347	20 %	0 %	40 %	40 %	386612312
112	NC_017641	CTGCG	2	10	169474	169483	0 %	20 %	40 %	40 %	386612313
113	NC_017641	AAAAC	2	10	171320	171329	80 %	0 %	0 %	20 %	386612314
114	NC_017641	TGGTT	2	10	171577	171586	0 %	60 %	40 %	0 %	386612314
115	NC_017641	AACCT	2	10	173658	173667	40 %	20 %	0 %	40 %	386612316
116	NC_017641	TGGTC	2	10	173700	173709	0 %	40 %	40 %	20 %	386612316
117	NC_017641	TGGCG	2	10	174945	174954	0 %	20 %	60 %	20 %	386612317
118	NC_017641	CGGCG	2	10	175575	175584	0 %	0 %	60 %	40 %	386612317
119	NC_017641	CGGCG	2	10	175656	175665	0 %	0 %	60 %	40 %	386612317
120	NC_017641	TTCCA	2	10	176186	176195	20 %	40 %	0 %	40 %	386612317
121	NC_017641	GGTCC	2	10	180632	180641	0 %	20 %	40 %	40 %	386612322
122	NC_017641	ACGGG	2	10	182549	182558	20 %	0 %	60 %	20 %	386612324
123	NC_017641	GTGAT	2	10	184708	184717	20 %	40 %	40 %	0 %	386612325
124	NC_017641	GTGAT	2	10	184999	185008	20 %	40 %	40 %	0 %	386612325
125	NC_017641	TACGT	2	10	185244	185253	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017641	TGGCC	2	10	186969	186978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017641	CCACG	2	10	187146	187155	20 %	0 %	20 %	60 %	386612328
128	NC_017641	GCCAG	2	10	189431	189440	20 %	0 %	40 %	40 %	386612330
129	NC_017641	GTTCT	2	10	190872	190881	0 %	60 %	20 %	20 %	386612330
130	NC_017641	CTGAA	2	10	192864	192873	40 %	20 %	20 %	20 %	386612332
131	NC_017641	AAGCG	2	10	192928	192937	40 %	0 %	40 %	20 %	386612332
132	NC_017641	TGGTG	2	10	194834	194843	0 %	40 %	60 %	0 %	386612335
133	NC_017641	TGCAC	2	10	194960	194969	20 %	20 %	20 %	40 %	386612335
134	NC_017641	TGCGC	2	10	195353	195362	0 %	20 %	40 %	40 %	386612335
135	NC_017641	AAATA	2	10	195575	195584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017641	GTCTG	2	10	195660	195669	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017641	CATGG	2	10	197196	197205	20 %	20 %	40 %	20 %	386612337
138	NC_017641	CAGAT	2	10	198235	198244	40 %	20 %	20 %	20 %	386612338
139	NC_017641	ACTTT	2	10	198368	198377	20 %	60 %	0 %	20 %	386612338
140	NC_017641	GACGT	2	10	202288	202297	20 %	20 %	40 %	20 %	386612341
141	NC_017641	CGACG	2	10	204115	204124	20 %	0 %	40 %	40 %	386612343
142	NC_017641	ATGCC	2	10	206683	206692	20 %	20 %	20 %	40 %	386612346
143	NC_017641	GGATG	2	10	206945	206954	20 %	20 %	60 %	0 %	386612346
144	NC_017641	TGGCC	2	10	208009	208018	0 %	20 %	40 %	40 %	386612348
145	NC_017641	GTAAC	2	10	208752	208761	40 %	20 %	20 %	20 %	386612348
146	NC_017641	AGCCG	2	10	209380	209389	20 %	0 %	40 %	40 %	386612348
147	NC_017641	GGTGG	2	10	209489	209498	0 %	20 %	80 %	0 %	386612348
148	NC_017641	ACGGT	2	10	220544	220553	20 %	20 %	40 %	20 %	386612359
149	NC_017641	TGATT	2	10	223385	223394	20 %	60 %	20 %	0 %	386612362
150	NC_017641	CGGTT	2	10	226348	226357	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017641	TAATT	2	10	235182	235191	40 %	60 %	0 %	0 %	386612369
152	NC_017641	CGCGG	2	10	239165	239174	0 %	0 %	60 %	40 %	386612374
153	NC_017641	TTTAA	2	10	241542	241551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017641	TGATC	2	10	242897	242906	20 %	40 %	20 %	20 %	386612377
155	NC_017641	GCGCG	2	10	244602	244611	0 %	0 %	60 %	40 %	386612379
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157	NC_017641	ATCGC	2	10	247039	247048	20 %	20 %	20 %	40 %	386612379
158	NC_017641	GGGCA	2	10	254115	254124	20 %	0 %	60 %	20 %	386612385
159	NC_017641	ATTTC	2	10	254625	254634	20 %	60 %	0 %	20 %	386612385
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161	NC_017641	CCAGG	2	10	257514	257523	20 %	0 %	40 %	40 %	386612388
162	NC_017641	AAGGC	2	10	257641	257650	40 %	0 %	40 %	20 %	386612388
163	NC_017641	GCCGT	2	10	258121	258130	0 %	20 %	40 %	40 %	386612389
164	NC_017641	ACCGG	2	10	259964	259973	20 %	0 %	40 %	40 %	386612390
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166	NC_017641	AAAAT	2	10	262494	262503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017641	CTAAT	2	10	262708	262717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_017641	TTTGT	2	10	262735	262744	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017641	ACTGT	2	10	263762	263771	20 %	40 %	20 %	20 %	386612396
170	NC_017641	AAGGC	2	10	265775	265784	40 %	0 %	40 %	20 %	386612398
171	NC_017641	GCCCG	2	10	266251	266260	0 %	0 %	40 %	60 %	386612399
172	NC_017641	TGACC	2	10	268118	268127	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_017641	CGGAG	2	10	269500	269509	20 %	0 %	60 %	20 %	386612400
174	NC_017641	TAAAA	2	10	270459	270468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017641	GGTAT	2	10	270579	270588	20 %	40 %	40 %	0 %	386612401
176	NC_017641	AAACG	2	10	278598	278607	60 %	0 %	20 %	20 %	386612408
177	NC_017641	TTGCT	2	10	279603	279612	0 %	60 %	20 %	20 %	386612411
178	NC_017641	CCTTT	2	10	280443	280452	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_017641	AGGGC	2	10	281977	281986	20 %	0 %	60 %	20 %	386612413
180	NC_017641	AGGGA	2	10	282540	282549	40 %	0 %	60 %	0 %	386612413
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184	NC_017641	GATGC	2	10	289910	289919	20 %	20 %	40 %	20 %	386612423
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192	NC_017641	CAGGG	2	10	299329	299338	20 %	0 %	60 %	20 %	386612433
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195	NC_017641	GAAGT	2	10	306681	306690	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017641	TGATT	2	10	308742	308751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017641	CTCAA	2	10	309210	309219	40 %	20 %	0 %	40 %	386612447
198	NC_017641	GGAGT	2	10	309396	309405	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017641	CGATT	2	10	309407	309416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_017641	GCCAG	2	10	309577	309586	20 %	0 %	40 %	40 %	386612448
201	NC_017641	TGGTG	2	10	309682	309691	0 %	40 %	60 %	0 %	386612448
202	NC_017641	AGGGG	2	10	309838	309847	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
203	NC_017641	TCGTT	2	10	310575	310584	0 %	60 %	20 %	20 %	386612450
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231	NC_017641	ATGTT	2	10	362744	362753	20 %	60 %	20 %	0 %	386612501
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248	NC_017641	GTGGC	2	10	392033	392042	0 %	20 %	60 %	20 %	386612527
249	NC_017641	GGCAA	2	10	394028	394037	40 %	0 %	40 %	20 %	386612529
250	NC_017641	TGATG	2	10	394435	394444	20 %	40 %	40 %	0 %	386612529
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253	NC_017641	AAGCG	2	10	399965	399974	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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258	NC_017641	TGACC	2	10	403949	403958	20 %	20 %	20 %	40 %	386612538
259	NC_017641	TTGCG	2	10	405162	405171	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_017641	TTTTC	2	10	405275	405284	0 %	80 %	0 %	20 %	386612539
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264	NC_017641	GCGCA	2	10	412498	412507	20 %	0 %	40 %	40 %	386612545
265	NC_017641	TGGCG	2	10	413224	413233	0 %	20 %	60 %	20 %	386612546
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268	NC_017641	CTTAC	2	10	415324	415333	20 %	40 %	0 %	40 %	386612548
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