MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	AGCTG	2	10	1096	1105	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017640	TTATG	2	10	1211	1220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017640	GAATG	2	10	3530	3539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017640	AAATG	2	10	4651	4660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017640	GAAAT	2	10	4694	4703	60 %	20 %	20 %	0 %	386612084
6	NC_017640	GGCTA	2	10	6802	6811	20 %	20 %	40 %	20 %	386612087
7	NC_017640	CAGTG	2	10	8076	8085	20 %	20 %	40 %	20 %	386612089
8	NC_017640	GACAA	2	10	9286	9295	60 %	0 %	20 %	20 %	386612090
9	NC_017640	TGCGA	2	10	12539	12548	20 %	20 %	40 %	20 %	386612091
10	NC_017640	AACCA	2	10	14402	14411	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017640	AGTCA	2	10	14964	14973	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017640	AGTGT	2	10	15036	15045	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017640	TTTTC	2	10	15105	15114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017640	GATAT	2	10	15359	15368	40 %	40 %	20 %	0 %	386612097
15	NC_017640	TCAGT	2	10	15613	15622	20 %	40 %	20 %	20 %	386612097
16	NC_017640	TGAGG	2	10	17018	17027	20 %	20 %	60 %	0 %	386612099
17	NC_017640	ATGTT	2	10	20270	20279	20 %	60 %	20 %	0 %	386612102
18	NC_017640	CAATT	2	10	20597	20606	40 %	40 %	0 %	20 %	386612102
19	NC_017640	CAGGT	2	10	20904	20913	20 %	20 %	40 %	20 %	386612103
20	NC_017640	TGGGC	2	10	22241	22250	0 %	20 %	60 %	20 %	386612105
21	NC_017640	CGTTC	2	10	25089	25098	0 %	40 %	20 %	40 %	386612108
22	NC_017640	GACCA	2	10	25539	25548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017640	CTGTT	2	10	25854	25863	0 %	60 %	20 %	20 %	386612109
24	NC_017640	CAGGT	2	10	25875	25884	20 %	20 %	40 %	20 %	386612109
25	NC_017640	CGCTG	2	10	27743	27752	0 %	20 %	40 %	40 %	386612109
26	NC_017640	AGGTC	2	10	30662	30671	20 %	20 %	40 %	20 %	386612109
27	NC_017640	CAGCA	2	10	32075	32084	40 %	0 %	20 %	40 %	386612110
28	NC_017640	CCGTG	2	10	32527	32536	0 %	20 %	40 %	40 %	386612110
29	NC_017640	CAAAT	2	10	33527	33536	60 %	20 %	0 %	20 %	386612111
30	NC_017640	CTGCG	2	10	35688	35697	0 %	20 %	40 %	40 %	386612113
31	NC_017640	CCCAG	2	10	37287	37296	20 %	0 %	20 %	60 %	386612113
32	NC_017640	AGAAA	2	10	40679	40688	80 %	0 %	20 %	0 %	386612118
33	NC_017640	AAATC	2	10	40757	40766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017640	CAGAC	2	10	42715	42724	40 %	0 %	20 %	40 %	386612120
35	NC_017640	TTCAC	2	10	43035	43044	20 %	40 %	0 %	40 %	386612120
36	NC_017640	GCACT	2	10	43200	43209	20 %	20 %	20 %	40 %	386612120
37	NC_017640	TTTTC	2	10	44951	44960	0 %	80 %	0 %	20 %	386612123
38	NC_017640	GGACT	2	10	45521	45530	20 %	20 %	40 %	20 %	386612124
39	NC_017640	CAGAA	2	10	45584	45593	60 %	0 %	20 %	20 %	386612124
40	NC_017640	GCTTC	2	10	46213	46222	0 %	40 %	20 %	40 %	386612124
41	NC_017640	CGGTA	2	10	47703	47712	20 %	20 %	40 %	20 %	386612126
42	NC_017640	TCAGA	2	10	49161	49170	40 %	20 %	20 %	20 %	386612126
43	NC_017640	AACTG	2	10	50533	50542	40 %	20 %	20 %	20 %	386612127
44	NC_017640	CATTT	2	10	51482	51491	20 %	60 %	0 %	20 %	386612128
45	NC_017640	CCGGG	2	10	52909	52918	0 %	0 %	60 %	40 %	386612130
46	NC_017640	TGTCC	2	10	53008	53017	0 %	40 %	20 %	40 %	386612130
47	NC_017640	CACGG	2	10	53425	53434	20 %	0 %	40 %	40 %	386612131
48	NC_017640	CGCTT	2	10	54273	54282	0 %	40 %	20 %	40 %	386612132
49	NC_017640	GTGAT	2	10	60073	60082	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017640	GAATG	2	10	61001	61010	40 %	20 %	40 %	0 %	386612140
51	NC_017640	TCTGC	2	10	61059	61068	0 %	40 %	20 %	40 %	386612140
52	NC_017640	TCAGT	2	10	61888	61897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017640	CGGGG	2	10	64245	64254	0 %	0 %	80 %	20 %	386612142
54	NC_017640	ACCAC	2	10	66674	66683	40 %	0 %	0 %	60 %	386612145
55	NC_017640	CCCGG	2	10	67389	67398	0 %	0 %	40 %	60 %	386612145
56	NC_017640	CTTCC	2	10	68791	68800	0 %	40 %	0 %	60 %	386612146
57	NC_017640	ACAGT	2	10	69465	69474	40 %	20 %	20 %	20 %	386612147
58	NC_017640	ACGGT	2	10	69703	69712	20 %	20 %	40 %	20 %	386612148
59	NC_017640	GTGCC	2	10	69993	70002	0 %	20 %	40 %	40 %	386612149
60	NC_017640	GGCAC	2	10	70210	70219	20 %	0 %	40 %	40 %	386612149
61	NC_017640	GCAGG	2	10	71177	71186	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017640	TTCTC	2	10	71632	71641	0 %	60 %	0 %	40 %	386612151
63	NC_017640	CCAGC	2	10	72144	72153	20 %	0 %	20 %	60 %	386612152
64	NC_017640	GCCGC	2	10	75243	75252	0 %	0 %	40 %	60 %	386612154
65	NC_017640	TTCTT	2	10	79162	79171	0 %	80 %	0 %	20 %	386612158
66	NC_017640	ATGCC	2	10	79521	79530	20 %	20 %	20 %	40 %	386612159
67	NC_017640	AAAAT	2	10	80417	80426	80 %	20 %	0 %	0 %	386612161

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.