MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	GAAAT	2	10	4694	4703	60 %	20 %	20 %	0 %	386612084
2	NC_017640	GGCTA	2	10	6802	6811	20 %	20 %	40 %	20 %	386612087
3	NC_017640	CAGTG	2	10	8076	8085	20 %	20 %	40 %	20 %	386612089
4	NC_017640	GACAA	2	10	9286	9295	60 %	0 %	20 %	20 %	386612090
5	NC_017640	TGCGA	2	10	12539	12548	20 %	20 %	40 %	20 %	386612091
6	NC_017640	GATAT	2	10	15359	15368	40 %	40 %	20 %	0 %	386612097
7	NC_017640	TCAGT	2	10	15613	15622	20 %	40 %	20 %	20 %	386612097
8	NC_017640	TGAGG	2	10	17018	17027	20 %	20 %	60 %	0 %	386612099
9	NC_017640	ATGTT	2	10	20270	20279	20 %	60 %	20 %	0 %	386612102
10	NC_017640	CAATT	2	10	20597	20606	40 %	40 %	0 %	20 %	386612102
11	NC_017640	CAGGT	2	10	20904	20913	20 %	20 %	40 %	20 %	386612103
12	NC_017640	TGGGC	2	10	22241	22250	0 %	20 %	60 %	20 %	386612105
13	NC_017640	CGTTC	2	10	25089	25098	0 %	40 %	20 %	40 %	386612108
14	NC_017640	CTGTT	2	10	25854	25863	0 %	60 %	20 %	20 %	386612109
15	NC_017640	CAGGT	2	10	25875	25884	20 %	20 %	40 %	20 %	386612109
16	NC_017640	CGCTG	2	10	27743	27752	0 %	20 %	40 %	40 %	386612109
17	NC_017640	AGGTC	2	10	30662	30671	20 %	20 %	40 %	20 %	386612109
18	NC_017640	CAGCA	2	10	32075	32084	40 %	0 %	20 %	40 %	386612110
19	NC_017640	CCGTG	2	10	32527	32536	0 %	20 %	40 %	40 %	386612110
20	NC_017640	CAAAT	2	10	33527	33536	60 %	20 %	0 %	20 %	386612111
21	NC_017640	CTGCG	2	10	35688	35697	0 %	20 %	40 %	40 %	386612113
22	NC_017640	CCCAG	2	10	37287	37296	20 %	0 %	20 %	60 %	386612113
23	NC_017640	AGAAA	2	10	40679	40688	80 %	0 %	20 %	0 %	386612118
24	NC_017640	CAGAC	2	10	42715	42724	40 %	0 %	20 %	40 %	386612120
25	NC_017640	TTCAC	2	10	43035	43044	20 %	40 %	0 %	40 %	386612120
26	NC_017640	GCACT	2	10	43200	43209	20 %	20 %	20 %	40 %	386612120
27	NC_017640	TTTTC	2	10	44951	44960	0 %	80 %	0 %	20 %	386612123
28	NC_017640	GGACT	2	10	45521	45530	20 %	20 %	40 %	20 %	386612124
29	NC_017640	CAGAA	2	10	45584	45593	60 %	0 %	20 %	20 %	386612124
30	NC_017640	GCTTC	2	10	46213	46222	0 %	40 %	20 %	40 %	386612124
31	NC_017640	CGGTA	2	10	47703	47712	20 %	20 %	40 %	20 %	386612126
32	NC_017640	TCAGA	2	10	49161	49170	40 %	20 %	20 %	20 %	386612126
33	NC_017640	AACTG	2	10	50533	50542	40 %	20 %	20 %	20 %	386612127
34	NC_017640	CATTT	2	10	51482	51491	20 %	60 %	0 %	20 %	386612128
35	NC_017640	CCGGG	2	10	52909	52918	0 %	0 %	60 %	40 %	386612130
36	NC_017640	TGTCC	2	10	53008	53017	0 %	40 %	20 %	40 %	386612130
37	NC_017640	CACGG	2	10	53425	53434	20 %	0 %	40 %	40 %	386612131
38	NC_017640	CGCTT	2	10	54273	54282	0 %	40 %	20 %	40 %	386612132
39	NC_017640	GAATG	2	10	61001	61010	40 %	20 %	40 %	0 %	386612140
40	NC_017640	TCTGC	2	10	61059	61068	0 %	40 %	20 %	40 %	386612140
41	NC_017640	CGGGG	2	10	64245	64254	0 %	0 %	80 %	20 %	386612142
42	NC_017640	ACCAC	2	10	66674	66683	40 %	0 %	0 %	60 %	386612145
43	NC_017640	CCCGG	2	10	67389	67398	0 %	0 %	40 %	60 %	386612145
44	NC_017640	CTTCC	2	10	68791	68800	0 %	40 %	0 %	60 %	386612146
45	NC_017640	ACAGT	2	10	69465	69474	40 %	20 %	20 %	20 %	386612147
46	NC_017640	ACGGT	2	10	69703	69712	20 %	20 %	40 %	20 %	386612148
47	NC_017640	GTGCC	2	10	69993	70002	0 %	20 %	40 %	40 %	386612149
48	NC_017640	GGCAC	2	10	70210	70219	20 %	0 %	40 %	40 %	386612149
49	NC_017640	TTCTC	2	10	71632	71641	0 %	60 %	0 %	40 %	386612151
50	NC_017640	CCAGC	2	10	72144	72153	20 %	0 %	20 %	60 %	386612152
51	NC_017640	GCCGC	2	10	75243	75252	0 %	0 %	40 %	60 %	386612154
52	NC_017640	TTCTT	2	10	79162	79171	0 %	80 %	0 %	20 %	386612158
53	NC_017640	ATGCC	2	10	79521	79530	20 %	20 %	20 %	40 %	386612159
54	NC_017640	AAAAT	2	10	80417	80426	80 %	20 %	0 %	0 %	386612161

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.