MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	TGGG	2	8	252	259	0 %	25 %	75 %	0 %	386612082
2	NC_017640	TCAT	2	8	262	269	25 %	50 %	0 %	25 %	386612082
3	NC_017640	AGTC	2	8	890	897	25 %	25 %	25 %	25 %	386612082
4	NC_017640	AGTG	2	8	1042	1049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017640	CTGT	2	8	1088	1095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017640	CCCG	2	8	1306	1313	0 %	0 %	25 %	75 %	386612083
7	NC_017640	CCAG	2	8	1401	1408	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
8	NC_017640	CGCA	2	8	1691	1698	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
9	NC_017640	CACT	2	8	1852	1859	25 %	25 %	0 %	50 %	386612083
10	NC_017640	TTTG	2	8	2107	2114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017640	AGCC	2	8	2184	2191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017640	TAAT	2	8	2556	2563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017640	CTGA	2	8	3591	3598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017640	TTTA	2	8	3942	3949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017640	TATT	2	8	4244	4251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017640	ACTT	2	8	5144	5151	25 %	50 %	0 %	25 %	386612084
17	NC_017640	CAGC	2	8	5933	5940	25 %	0 %	25 %	50 %	386612085
18	NC_017640	CAGG	2	8	6031	6038	25 %	0 %	50 %	25 %	386612085
19	NC_017640	GCTT	2	8	6247	6254	0 %	50 %	25 %	25 %	386612085
20	NC_017640	CTGA	2	8	6678	6685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017640	GCTC	2	8	7262	7269	0 %	25 %	25 %	50 %	386612087
22	NC_017640	GCTT	2	8	7648	7655	0 %	50 %	25 %	25 %	386612088
23	NC_017640	GCGA	2	8	7714	7721	25 %	0 %	50 %	25 %	386612088
24	NC_017640	TTGC	2	8	8290	8297	0 %	50 %	25 %	25 %	386612089
25	NC_017640	CTGG	2	8	8311	8318	0 %	25 %	50 %	25 %	386612089
26	NC_017640	TCGT	2	8	8921	8928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017640	TACA	2	8	8949	8956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017640	ATTC	2	8	9599	9606	25 %	50 %	0 %	25 %	386612090
29	NC_017640	CTTA	2	8	9779	9786	25 %	50 %	0 %	25 %	386612090
30	NC_017640	GGCA	2	8	10354	10361	25 %	0 %	50 %	25 %	386612090
31	NC_017640	TTAT	2	8	10955	10962	25 %	75 %	0 %	0 %	386612091
32	NC_017640	TTTC	2	8	11147	11154	0 %	75 %	0 %	25 %	386612091
33	NC_017640	CGGG	2	8	11990	11997	0 %	0 %	75 %	25 %	386612091
34	NC_017640	TTCT	2	8	13108	13115	0 %	75 %	0 %	25 %	386612093
35	NC_017640	ATTC	2	8	13320	13327	25 %	50 %	0 %	25 %	386612093
36	NC_017640	CAGC	2	8	13462	13469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017640	AATA	2	8	13780	13787	75 %	25 %	0 %	0 %	386612094
38	NC_017640	GATT	2	8	14321	14328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017640	TATT	2	8	14614	14621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017640	ATTG	2	8	15072	15079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017640	GCCT	2	8	15401	15408	0 %	25 %	25 %	50 %	386612097
42	NC_017640	TTCT	2	8	15680	15687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017640	TGTC	2	8	16980	16987	0 %	50 %	25 %	25 %	386612099
44	NC_017640	GTCT	2	8	17107	17114	0 %	50 %	25 %	25 %	386612099
45	NC_017640	TCAC	2	8	18609	18616	25 %	25 %	0 %	50 %	386612100
46	NC_017640	CTTA	2	8	19029	19036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017640	TGAT	2	8	19937	19944	25 %	50 %	25 %	0 %	386612101
48	NC_017640	ATCA	2	8	20177	20184	50 %	25 %	0 %	25 %	386612101
49	NC_017640	TCAG	2	8	20214	20221	25 %	25 %	25 %	25 %	386612101
50	NC_017640	GGCA	2	8	20411	20418	25 %	0 %	50 %	25 %	386612102
51	NC_017640	CAGT	2	8	20945	20952	25 %	25 %	25 %	25 %	386612103
52	NC_017640	GCAG	2	8	22367	22374	25 %	0 %	50 %	25 %	386612105
53	NC_017640	ATAA	2	8	23637	23644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017640	AAAT	2	8	23684	23691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017640	AAAT	2	8	23754	23761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017640	GCAG	2	8	23996	24003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017640	TCCA	2	8	24027	24034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017640	GCCC	2	8	24060	24067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017640	CATT	2	8	24121	24128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017640	GACT	2	8	24181	24188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017640	GGCA	2	8	24397	24404	25 %	0 %	50 %	25 %	386612107
62	NC_017640	GGCC	2	8	25009	25016	0 %	0 %	50 %	50 %	386612108
63	NC_017640	TGAC	2	8	25122	25129	25 %	25 %	25 %	25 %	386612108
64	NC_017640	ACGG	2	8	26072	26079	25 %	0 %	50 %	25 %	386612109
65	NC_017640	CAGC	2	8	26156	26163	25 %	0 %	25 %	50 %	386612109
66	NC_017640	CTGC	2	8	26741	26748	0 %	25 %	25 %	50 %	386612109
67	NC_017640	TTCA	2	8	27207	27214	25 %	50 %	0 %	25 %	386612109
68	NC_017640	CAGG	2	8	28634	28641	25 %	0 %	50 %	25 %	386612109
69	NC_017640	CCAG	2	8	28994	29001	25 %	0 %	25 %	50 %	386612109
70	NC_017640	GCGA	2	8	29495	29502	25 %	0 %	50 %	25 %	386612109
71	NC_017640	TGCG	2	8	30001	30008	0 %	25 %	50 %	25 %	386612109
72	NC_017640	GTCC	2	8	30524	30531	0 %	25 %	25 %	50 %	386612109
73	NC_017640	GGCC	2	8	30806	30813	0 %	0 %	50 %	50 %	386612109
74	NC_017640	CAGC	2	8	31962	31969	25 %	0 %	25 %	50 %	386612110
75	NC_017640	CAGA	2	8	32537	32544	50 %	0 %	25 %	25 %	386612110
76	NC_017640	TGTC	2	8	32644	32651	0 %	50 %	25 %	25 %	386612110
77	NC_017640	AGTC	2	8	33128	33135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017640	ATTT	2	8	33242	33249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017640	ATTT	2	8	33273	33280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017640	TTTC	2	8	33283	33290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017640	ATCA	2	8	33331	33338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017640	TAAT	2	8	33770	33777	50 %	50 %	0 %	0 %	386612111
83	NC_017640	CCCT	2	8	33814	33821	0 %	25 %	0 %	75 %	386612111
84	NC_017640	ACTG	2	8	35787	35794	25 %	25 %	25 %	25 %	386612113
85	NC_017640	ACCG	2	8	35914	35921	25 %	0 %	25 %	50 %	386612113
86	NC_017640	CATC	2	8	35946	35953	25 %	25 %	0 %	50 %	386612113
87	NC_017640	CTGC	2	8	36107	36114	0 %	25 %	25 %	50 %	386612113
88	NC_017640	GGAC	2	8	36399	36406	25 %	0 %	50 %	25 %	386612113
89	NC_017640	GGCT	2	8	36576	36583	0 %	25 %	50 %	25 %	386612113
90	NC_017640	CTGG	2	8	36658	36665	0 %	25 %	50 %	25 %	386612113
91	NC_017640	TTCA	2	8	37459	37466	25 %	50 %	0 %	25 %	386612113
92	NC_017640	CTCC	2	8	37474	37481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_017640	GCGG	2	8	37515	37522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017640	CCCT	2	8	38847	38854	0 %	25 %	0 %	75 %	386612115
95	NC_017640	ACAT	2	8	38988	38995	50 %	25 %	0 %	25 %	386612115
96	NC_017640	CAAT	2	8	39091	39098	50 %	25 %	0 %	25 %	386612115
97	NC_017640	TTTG	2	8	39203	39210	0 %	75 %	25 %	0 %	386612115
98	NC_017640	TTCA	2	8	39246	39253	25 %	50 %	0 %	25 %	386612116
99	NC_017640	ATCC	2	8	39292	39299	25 %	25 %	0 %	50 %	386612116
100	NC_017640	ATCC	2	8	39516	39523	25 %	25 %	0 %	50 %	386612116
101	NC_017640	CCTG	2	8	39824	39831	0 %	25 %	25 %	50 %	386612116
102	NC_017640	ATTT	2	8	41420	41427	25 %	75 %	0 %	0 %	386612119
103	NC_017640	GTCA	2	8	41559	41566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017640	CCTG	2	8	41799	41806	0 %	25 %	25 %	50 %	386612120
105	NC_017640	GTTT	2	8	42124	42131	0 %	75 %	25 %	0 %	386612120
106	NC_017640	CAGG	2	8	42522	42529	25 %	0 %	50 %	25 %	386612120
107	NC_017640	TGAC	2	8	42620	42627	25 %	25 %	25 %	25 %	386612120
108	NC_017640	CAGT	2	8	42847	42854	25 %	25 %	25 %	25 %	386612120
109	NC_017640	ATGA	2	8	43311	43318	50 %	25 %	25 %	0 %	386612120
110	NC_017640	TTAA	2	8	44923	44930	50 %	50 %	0 %	0 %	386612123
111	NC_017640	TCAG	2	8	45112	45119	25 %	25 %	25 %	25 %	386612123
112	NC_017640	GTCC	2	8	45706	45713	0 %	25 %	25 %	50 %	386612124
113	NC_017640	CGTC	2	8	45942	45949	0 %	25 %	25 %	50 %	386612124
114	NC_017640	CTGA	2	8	46063	46070	25 %	25 %	25 %	25 %	386612124
115	NC_017640	GACG	2	8	46581	46588	25 %	0 %	50 %	25 %	386612125
116	NC_017640	GGCT	2	8	46975	46982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017640	GGAA	2	8	47463	47470	50 %	0 %	50 %	0 %	386612126
118	NC_017640	GGAC	2	8	47866	47873	25 %	0 %	50 %	25 %	386612126
119	NC_017640	AGCC	2	8	48103	48110	25 %	0 %	25 %	50 %	386612126
120	NC_017640	GGTG	2	8	48481	48488	0 %	25 %	75 %	0 %	386612126
121	NC_017640	ACGG	2	8	48839	48846	25 %	0 %	50 %	25 %	386612126
122	NC_017640	ATTC	2	8	49411	49418	25 %	50 %	0 %	25 %	386612126
123	NC_017640	GATG	2	8	49563	49570	25 %	25 %	50 %	0 %	386612126
124	NC_017640	TCAT	2	8	49685	49692	25 %	50 %	0 %	25 %	386612126
125	NC_017640	GACT	2	8	50014	50021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017640	ATTT	2	8	50159	50166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017640	TTAA	2	8	50377	50384	50 %	50 %	0 %	0 %	386612127
128	NC_017640	CGGA	2	8	50640	50647	25 %	0 %	50 %	25 %	386612127
129	NC_017640	AAAG	2	8	50872	50879	75 %	0 %	25 %	0 %	386612127
130	NC_017640	ATTT	2	8	51100	51107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017640	GCAT	2	8	51274	51281	25 %	25 %	25 %	25 %	386612128
132	NC_017640	ACAT	2	8	51536	51543	50 %	25 %	0 %	25 %	386612128
133	NC_017640	AAAC	2	8	51786	51793	75 %	0 %	0 %	25 %	386612129
134	NC_017640	CCCT	2	8	51935	51942	0 %	25 %	0 %	75 %	386612130
135	NC_017640	TGCG	2	8	52083	52090	0 %	25 %	50 %	25 %	386612130
136	NC_017640	TGTT	2	8	53052	53059	0 %	75 %	25 %	0 %	386612130
137	NC_017640	CAGA	2	8	53242	53249	50 %	0 %	25 %	25 %	386612130
138	NC_017640	CTGA	2	8	53413	53420	25 %	25 %	25 %	25 %	386612131
139	NC_017640	GACA	2	8	53473	53480	50 %	0 %	25 %	25 %	386612131
140	NC_017640	CCAG	2	8	54094	54101	25 %	0 %	25 %	50 %	386612132
141	NC_017640	TGGT	2	8	54900	54907	0 %	50 %	50 %	0 %	386612133
142	NC_017640	AATA	2	8	55003	55010	75 %	25 %	0 %	0 %	386612134
143	NC_017640	GATA	2	8	55354	55361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017640	CTGT	2	8	55832	55839	0 %	50 %	25 %	25 %	386612135
145	NC_017640	TATT	2	8	56318	56325	25 %	75 %	0 %	0 %	386612135
146	NC_017640	TAAT	2	8	56476	56483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017640	AAAT	2	8	57187	57194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_017640	ACTG	2	8	66179	66186	25 %	25 %	25 %	25 %	386612144
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176	NC_017640	AAAT	2	8	68089	68096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017640	CAGT	2	8	68321	68328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_017640	TCAT	2	8	71782	71789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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188	NC_017640	AAGA	2	8	74348	74355	75 %	0 %	25 %	0 %	386612153
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192	NC_017640	AATA	2	8	76048	76055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017640	TCAG	2	8	76222	76229	25 %	25 %	25 %	25 %	386612156
194	NC_017640	TTCC	2	8	76267	76274	0 %	50 %	0 %	50 %	386612156
195	NC_017640	CAGC	2	8	76493	76500	25 %	0 %	25 %	50 %	386612156
196	NC_017640	GACT	2	8	76975	76982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
197	NC_017640	CTGT	2	8	77635	77642	0 %	50 %	25 %	25 %	386612157
198	NC_017640	AACG	2	8	77885	77892	50 %	0 %	25 %	25 %	386612157
199	NC_017640	GCGA	2	8	77996	78003	25 %	0 %	50 %	25 %	386612157
200	NC_017640	GGGT	2	8	79478	79485	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
201	NC_017640	CATT	2	8	79512	79519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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205	NC_017640	AAGT	2	8	81293	81300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.