MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	AGTG	2	8	1042	1049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017640	CTGT	2	8	1088	1095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017640	TTTG	2	8	2107	2114	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017640	AGCC	2	8	2184	2191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017640	TAAT	2	8	2556	2563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017640	CTGA	2	8	3591	3598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017640	TTTA	2	8	3942	3949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017640	TATT	2	8	4244	4251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017640	CTGA	2	8	6678	6685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017640	TCGT	2	8	8921	8928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017640	TACA	2	8	8949	8956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017640	CAGC	2	8	13462	13469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017640	GATT	2	8	14321	14328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017640	TATT	2	8	14614	14621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017640	ATTG	2	8	15072	15079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017640	TTCT	2	8	15680	15687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017640	CTTA	2	8	19029	19036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017640	ATAA	2	8	23637	23644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017640	AAAT	2	8	23684	23691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017640	AAAT	2	8	23754	23761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017640	GCAG	2	8	23996	24003	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017640	TCCA	2	8	24027	24034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017640	GCCC	2	8	24060	24067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_017640	CATT	2	8	24121	24128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017640	GACT	2	8	24181	24188	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017640	AGTC	2	8	33128	33135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017640	ATTT	2	8	33242	33249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017640	ATTT	2	8	33273	33280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017640	TTTC	2	8	33283	33290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017640	ATCA	2	8	33331	33338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017640	CTCC	2	8	37474	37481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_017640	GCGG	2	8	37515	37522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017640	GTCA	2	8	41559	41566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017640	GGCT	2	8	46975	46982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017640	GACT	2	8	50014	50021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017640	ATTT	2	8	50159	50166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017640	ATTT	2	8	51100	51107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017640	GATA	2	8	55354	55361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017640	TAAT	2	8	56476	56483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017640	AAAT	2	8	57187	57194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017640	ACTG	2	8	57955	57962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017640	CACT	2	8	60684	60691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017640	GTGA	2	8	61802	61809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017640	ACAG	2	8	65399	65406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017640	TACT	2	8	67869	67876	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017640	TGAC	2	8	68050	68057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017640	AAAT	2	8	68063	68070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017640	AAAT	2	8	68089	68096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017640	CAGT	2	8	68321	68328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017640	GGCA	2	8	68390	68397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017640	CCGT	2	8	69514	69521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017640	TCAT	2	8	71782	71789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017640	AATA	2	8	76048	76055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017640	GACT	2	8	76975	76982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017640	GGGT	2	8	79478	79485	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017640	CATT	2	8	79512	79519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017640	AAGT	2	8	81293	81300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017640	TCAG	2	8	81365	81372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.