MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	TGGG	2	8	252	259	0 %	25 %	75 %	0 %	386612082
2	NC_017640	TCAT	2	8	262	269	25 %	50 %	0 %	25 %	386612082
3	NC_017640	AGTC	2	8	890	897	25 %	25 %	25 %	25 %	386612082
4	NC_017640	CCCG	2	8	1306	1313	0 %	0 %	25 %	75 %	386612083
5	NC_017640	CCAG	2	8	1401	1408	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
6	NC_017640	CGCA	2	8	1691	1698	25 %	0 %	25 %	50 %	386612083
7	NC_017640	CACT	2	8	1852	1859	25 %	25 %	0 %	50 %	386612083
8	NC_017640	ACTT	2	8	5144	5151	25 %	50 %	0 %	25 %	386612084
9	NC_017640	CAGC	2	8	5933	5940	25 %	0 %	25 %	50 %	386612085
10	NC_017640	CAGG	2	8	6031	6038	25 %	0 %	50 %	25 %	386612085
11	NC_017640	GCTT	2	8	6247	6254	0 %	50 %	25 %	25 %	386612085
12	NC_017640	GCTC	2	8	7262	7269	0 %	25 %	25 %	50 %	386612087
13	NC_017640	GCTT	2	8	7648	7655	0 %	50 %	25 %	25 %	386612088
14	NC_017640	GCGA	2	8	7714	7721	25 %	0 %	50 %	25 %	386612088
15	NC_017640	TTGC	2	8	8290	8297	0 %	50 %	25 %	25 %	386612089
16	NC_017640	CTGG	2	8	8311	8318	0 %	25 %	50 %	25 %	386612089
17	NC_017640	ATTC	2	8	9599	9606	25 %	50 %	0 %	25 %	386612090
18	NC_017640	CTTA	2	8	9779	9786	25 %	50 %	0 %	25 %	386612090
19	NC_017640	GGCA	2	8	10354	10361	25 %	0 %	50 %	25 %	386612090
20	NC_017640	TTAT	2	8	10955	10962	25 %	75 %	0 %	0 %	386612091
21	NC_017640	TTTC	2	8	11147	11154	0 %	75 %	0 %	25 %	386612091
22	NC_017640	CGGG	2	8	11990	11997	0 %	0 %	75 %	25 %	386612091
23	NC_017640	TTCT	2	8	13108	13115	0 %	75 %	0 %	25 %	386612093
24	NC_017640	ATTC	2	8	13320	13327	25 %	50 %	0 %	25 %	386612093
25	NC_017640	AATA	2	8	13780	13787	75 %	25 %	0 %	0 %	386612094
26	NC_017640	GCCT	2	8	15401	15408	0 %	25 %	25 %	50 %	386612097
27	NC_017640	TGTC	2	8	16980	16987	0 %	50 %	25 %	25 %	386612099
28	NC_017640	GTCT	2	8	17107	17114	0 %	50 %	25 %	25 %	386612099
29	NC_017640	TCAC	2	8	18609	18616	25 %	25 %	0 %	50 %	386612100
30	NC_017640	TGAT	2	8	19937	19944	25 %	50 %	25 %	0 %	386612101
31	NC_017640	ATCA	2	8	20177	20184	50 %	25 %	0 %	25 %	386612101
32	NC_017640	TCAG	2	8	20214	20221	25 %	25 %	25 %	25 %	386612101
33	NC_017640	GGCA	2	8	20411	20418	25 %	0 %	50 %	25 %	386612102
34	NC_017640	CAGT	2	8	20945	20952	25 %	25 %	25 %	25 %	386612103
35	NC_017640	GCAG	2	8	22367	22374	25 %	0 %	50 %	25 %	386612105
36	NC_017640	GGCA	2	8	24397	24404	25 %	0 %	50 %	25 %	386612107
37	NC_017640	GGCC	2	8	25009	25016	0 %	0 %	50 %	50 %	386612108
38	NC_017640	TGAC	2	8	25122	25129	25 %	25 %	25 %	25 %	386612108
39	NC_017640	ACGG	2	8	26072	26079	25 %	0 %	50 %	25 %	386612109
40	NC_017640	CAGC	2	8	26156	26163	25 %	0 %	25 %	50 %	386612109
41	NC_017640	CTGC	2	8	26741	26748	0 %	25 %	25 %	50 %	386612109
42	NC_017640	TTCA	2	8	27207	27214	25 %	50 %	0 %	25 %	386612109
43	NC_017640	CAGG	2	8	28634	28641	25 %	0 %	50 %	25 %	386612109
44	NC_017640	CCAG	2	8	28994	29001	25 %	0 %	25 %	50 %	386612109
45	NC_017640	GCGA	2	8	29495	29502	25 %	0 %	50 %	25 %	386612109
46	NC_017640	TGCG	2	8	30001	30008	0 %	25 %	50 %	25 %	386612109
47	NC_017640	GTCC	2	8	30524	30531	0 %	25 %	25 %	50 %	386612109
48	NC_017640	GGCC	2	8	30806	30813	0 %	0 %	50 %	50 %	386612109
49	NC_017640	CAGC	2	8	31962	31969	25 %	0 %	25 %	50 %	386612110
50	NC_017640	CAGA	2	8	32537	32544	50 %	0 %	25 %	25 %	386612110
51	NC_017640	TGTC	2	8	32644	32651	0 %	50 %	25 %	25 %	386612110
52	NC_017640	TAAT	2	8	33770	33777	50 %	50 %	0 %	0 %	386612111
53	NC_017640	CCCT	2	8	33814	33821	0 %	25 %	0 %	75 %	386612111
54	NC_017640	ACTG	2	8	35787	35794	25 %	25 %	25 %	25 %	386612113
55	NC_017640	ACCG	2	8	35914	35921	25 %	0 %	25 %	50 %	386612113
56	NC_017640	CATC	2	8	35946	35953	25 %	25 %	0 %	50 %	386612113
57	NC_017640	CTGC	2	8	36107	36114	0 %	25 %	25 %	50 %	386612113
58	NC_017640	GGAC	2	8	36399	36406	25 %	0 %	50 %	25 %	386612113
59	NC_017640	GGCT	2	8	36576	36583	0 %	25 %	50 %	25 %	386612113
60	NC_017640	CTGG	2	8	36658	36665	0 %	25 %	50 %	25 %	386612113
61	NC_017640	TTCA	2	8	37459	37466	25 %	50 %	0 %	25 %	386612113
62	NC_017640	CCCT	2	8	38847	38854	0 %	25 %	0 %	75 %	386612115
63	NC_017640	ACAT	2	8	38988	38995	50 %	25 %	0 %	25 %	386612115
64	NC_017640	CAAT	2	8	39091	39098	50 %	25 %	0 %	25 %	386612115
65	NC_017640	TTTG	2	8	39203	39210	0 %	75 %	25 %	0 %	386612115
66	NC_017640	TTCA	2	8	39246	39253	25 %	50 %	0 %	25 %	386612116
67	NC_017640	ATCC	2	8	39292	39299	25 %	25 %	0 %	50 %	386612116
68	NC_017640	ATCC	2	8	39516	39523	25 %	25 %	0 %	50 %	386612116
69	NC_017640	CCTG	2	8	39824	39831	0 %	25 %	25 %	50 %	386612116
70	NC_017640	ATTT	2	8	41420	41427	25 %	75 %	0 %	0 %	386612119
71	NC_017640	CCTG	2	8	41799	41806	0 %	25 %	25 %	50 %	386612120
72	NC_017640	GTTT	2	8	42124	42131	0 %	75 %	25 %	0 %	386612120
73	NC_017640	CAGG	2	8	42522	42529	25 %	0 %	50 %	25 %	386612120
74	NC_017640	TGAC	2	8	42620	42627	25 %	25 %	25 %	25 %	386612120
75	NC_017640	CAGT	2	8	42847	42854	25 %	25 %	25 %	25 %	386612120
76	NC_017640	ATGA	2	8	43311	43318	50 %	25 %	25 %	0 %	386612120
77	NC_017640	TTAA	2	8	44923	44930	50 %	50 %	0 %	0 %	386612123
78	NC_017640	TCAG	2	8	45112	45119	25 %	25 %	25 %	25 %	386612123
79	NC_017640	GTCC	2	8	45706	45713	0 %	25 %	25 %	50 %	386612124
80	NC_017640	CGTC	2	8	45942	45949	0 %	25 %	25 %	50 %	386612124
81	NC_017640	CTGA	2	8	46063	46070	25 %	25 %	25 %	25 %	386612124
82	NC_017640	GACG	2	8	46581	46588	25 %	0 %	50 %	25 %	386612125
83	NC_017640	GGAA	2	8	47463	47470	50 %	0 %	50 %	0 %	386612126
84	NC_017640	GGAC	2	8	47866	47873	25 %	0 %	50 %	25 %	386612126
85	NC_017640	AGCC	2	8	48103	48110	25 %	0 %	25 %	50 %	386612126
86	NC_017640	GGTG	2	8	48481	48488	0 %	25 %	75 %	0 %	386612126
87	NC_017640	ACGG	2	8	48839	48846	25 %	0 %	50 %	25 %	386612126
88	NC_017640	ATTC	2	8	49411	49418	25 %	50 %	0 %	25 %	386612126
89	NC_017640	GATG	2	8	49563	49570	25 %	25 %	50 %	0 %	386612126
90	NC_017640	TCAT	2	8	49685	49692	25 %	50 %	0 %	25 %	386612126
91	NC_017640	TTAA	2	8	50377	50384	50 %	50 %	0 %	0 %	386612127
92	NC_017640	CGGA	2	8	50640	50647	25 %	0 %	50 %	25 %	386612127
93	NC_017640	AAAG	2	8	50872	50879	75 %	0 %	25 %	0 %	386612127
94	NC_017640	GCAT	2	8	51274	51281	25 %	25 %	25 %	25 %	386612128
95	NC_017640	ACAT	2	8	51536	51543	50 %	25 %	0 %	25 %	386612128
96	NC_017640	AAAC	2	8	51786	51793	75 %	0 %	0 %	25 %	386612129
97	NC_017640	CCCT	2	8	51935	51942	0 %	25 %	0 %	75 %	386612130
98	NC_017640	TGCG	2	8	52083	52090	0 %	25 %	50 %	25 %	386612130
99	NC_017640	TGTT	2	8	53052	53059	0 %	75 %	25 %	0 %	386612130
100	NC_017640	CAGA	2	8	53242	53249	50 %	0 %	25 %	25 %	386612130
101	NC_017640	CTGA	2	8	53413	53420	25 %	25 %	25 %	25 %	386612131
102	NC_017640	GACA	2	8	53473	53480	50 %	0 %	25 %	25 %	386612131
103	NC_017640	CCAG	2	8	54094	54101	25 %	0 %	25 %	50 %	386612132
104	NC_017640	TGGT	2	8	54900	54907	0 %	50 %	50 %	0 %	386612133
105	NC_017640	AATA	2	8	55003	55010	75 %	25 %	0 %	0 %	386612134
106	NC_017640	CTGT	2	8	55832	55839	0 %	50 %	25 %	25 %	386612135
107	NC_017640	TATT	2	8	56318	56325	25 %	75 %	0 %	0 %	386612135
108	NC_017640	CTCC	2	8	56865	56872	0 %	25 %	0 %	75 %	386612136
109	NC_017640	AAAT	2	8	58445	58452	75 %	25 %	0 %	0 %	386612138
110	NC_017640	TTTC	2	8	58477	58484	0 %	75 %	0 %	25 %	386612138
111	NC_017640	ATTG	2	8	58838	58845	25 %	50 %	25 %	0 %	386612138
112	NC_017640	CTGA	2	8	59218	59225	25 %	25 %	25 %	25 %	386612139
113	NC_017640	TCAG	2	8	59285	59292	25 %	25 %	25 %	25 %	386612139
114	NC_017640	CCGC	2	8	61410	61417	0 %	0 %	25 %	75 %	386612140
115	NC_017640	TCTG	2	8	61998	62005	0 %	50 %	25 %	25 %	386612141
116	NC_017640	CCTT	2	8	62433	62440	0 %	50 %	0 %	50 %	386612141
117	NC_017640	GCGT	2	8	62602	62609	0 %	25 %	50 %	25 %	386612141
118	NC_017640	GTTC	2	8	62899	62906	0 %	50 %	25 %	25 %	386612141
119	NC_017640	CAGT	2	8	64264	64271	25 %	25 %	25 %	25 %	386612142
120	NC_017640	TCTG	2	8	64654	64661	0 %	50 %	25 %	25 %	386612142
121	NC_017640	GCCC	2	8	65346	65353	0 %	0 %	25 %	75 %	386612143
122	NC_017640	CAGA	2	8	65745	65752	50 %	0 %	25 %	25 %	386612144
123	NC_017640	ACTG	2	8	66179	66186	25 %	25 %	25 %	25 %	386612144
124	NC_017640	GTCT	2	8	66458	66465	0 %	50 %	25 %	25 %	386612145
125	NC_017640	GCCC	2	8	66642	66649	0 %	0 %	25 %	75 %	386612145
126	NC_017640	CTTC	2	8	66845	66852	0 %	50 %	0 %	50 %	386612145
127	NC_017640	CGGG	2	8	67221	67228	0 %	0 %	75 %	25 %	386612145
128	NC_017640	AGCG	2	8	67333	67340	25 %	0 %	50 %	25 %	386612145
129	NC_017640	GCCC	2	8	68608	68615	0 %	0 %	25 %	75 %	386612146
130	NC_017640	ATCC	2	8	71513	71520	25 %	25 %	0 %	50 %	386612151
131	NC_017640	CTGC	2	8	72031	72038	0 %	25 %	25 %	50 %	386612152
132	NC_017640	GTCA	2	8	72471	72478	25 %	25 %	25 %	25 %	386612152
133	NC_017640	CACC	2	8	73129	73136	25 %	0 %	0 %	75 %	386612153
134	NC_017640	AGTC	2	8	74273	74280	25 %	25 %	25 %	25 %	386612153
135	NC_017640	AAAG	2	8	74327	74334	75 %	0 %	25 %	0 %	386612153
136	NC_017640	AAGA	2	8	74348	74355	75 %	0 %	25 %	0 %	386612153
137	NC_017640	GCCC	2	8	75317	75324	0 %	0 %	25 %	75 %	386612154
138	NC_017640	CAGC	2	8	75808	75815	25 %	0 %	25 %	50 %	386612155
139	NC_017640	GAAC	2	8	75925	75932	50 %	0 %	25 %	25 %	386612155
140	NC_017640	TCAG	2	8	76222	76229	25 %	25 %	25 %	25 %	386612156
141	NC_017640	TTCC	2	8	76267	76274	0 %	50 %	0 %	50 %	386612156
142	NC_017640	CAGC	2	8	76493	76500	25 %	0 %	25 %	50 %	386612156
143	NC_017640	CTGT	2	8	77635	77642	0 %	50 %	25 %	25 %	386612157
144	NC_017640	AACG	2	8	77885	77892	50 %	0 %	25 %	25 %	386612157
145	NC_017640	GCGA	2	8	77996	78003	25 %	0 %	50 %	25 %	386612157
146	NC_017640	TTCC	2	8	80379	80386	0 %	50 %	0 %	50 %	386612161
147	NC_017640	AATT	2	8	80472	80479	50 %	50 %	0 %	0 %	386612161
148	NC_017640	ATGA	2	8	81142	81149	50 %	25 %	25 %	0 %	386612162

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.