MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Ent

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017640	CTG	2	6	1227	1232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017640	ACC	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017640	ATT	2	6	2125	2130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017640	ACT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017640	CTG	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017640	ATA	3	9	2420	2428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017640	ATT	5	15	2517	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017640	AGC	2	6	2574	2579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017640	TCC	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017640	TGC	3	9	2726	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017640	TCT	2	6	2740	2745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017640	AAT	2	6	2836	2841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017640	AGC	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017640	ATT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017640	CTG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017640	GCA	2	6	3000	3005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017640	ATA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017640	ATT	2	6	3169	3174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017640	AAC	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017640	TCC	2	6	3208	3213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017640	ACC	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017640	CCT	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017640	TTG	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017640	TGT	3	9	3567	3575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017640	ATG	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017640	GTG	2	6	3786	3791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017640	CGC	2	6	3820	3825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017640	TAT	4	12	3831	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017640	AGG	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017640	TAA	2	6	4118	4123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017640	GTG	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017640	TTA	2	6	4514	4519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017640	AAT	2	6	4548	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017640	ATT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017640	TAT	2	6	4672	4677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017640	ATT	2	6	5542	5547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017640	ACC	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017640	ATT	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017640	GTT	2	6	6769	6774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017640	ACT	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017640	GTG	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017640	ATT	2	6	8631	8636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017640	GCA	2	6	8656	8661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017640	TCT	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017640	ATT	2	6	8891	8896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017640	ATT	2	6	9011	9016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017640	GCA	2	6	10611	10616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017640	AAT	2	6	10682	10687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017640	TCC	2	6	10702	10707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017640	CGG	2	6	13436	13441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017640	TCA	2	6	13614	13619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017640	ACG	2	6	13640	13645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017640	GAT	2	6	14335	14340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017640	AAG	2	6	14436	14441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017640	CAC	2	6	14461	14466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017640	GTA	2	6	14498	14503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017640	ATT	2	6	14506	14511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017640	ATT	2	6	14645	14650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017640	TTA	2	6	14997	15002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017640	TAT	2	6	15083	15088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017640	AAG	2	6	15130	15135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017640	GGA	2	6	15150	15155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017640	ATG	2	6	15229	15234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017640	GAT	2	6	15245	15250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017640	AAT	2	6	15275	15280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017640	CAA	2	6	15329	15334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017640	CAG	2	6	15674	15679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017640	TGA	2	6	15730	15735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017640	GCT	2	6	15905	15910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017640	GCT	2	6	15973	15978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017640	AAT	2	6	17780	17785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017640	ATC	2	6	17841	17846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017640	CGG	2	6	18691	18696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017640	CCT	2	6	18721	18726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017640	CAC	2	6	18731	18736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017640	GAG	2	6	18825	18830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017640	TGC	2	6	18881	18886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017640	TAA	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017640	AAT	2	6	19264	19269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017640	CAT	2	6	19398	19403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017640	ACT	2	6	20673	20678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017640	TGC	2	6	20701	20706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017640	AGG	2	6	20724	20729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017640	AGT	2	6	22726	22731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017640	CGC	2	6	22835	22840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017640	ATA	2	6	22842	22847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017640	CCA	2	6	22874	22879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017640	ATT	2	6	22957	22962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017640	AAC	2	6	23591	23596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017640	GCA	2	6	23722	23727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017640	TAC	2	6	23827	23832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017640	ATT	2	6	23865	23870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017640	GCT	2	6	23899	23904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017640	CTG	3	9	23966	23974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017640	CTC	2	6	24135	24140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017640	GTC	2	6	24148	24153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017640	TAT	2	6	24156	24161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017640	AAT	2	6	24169	24174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017640	CCT	2	6	24236	24241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017640	ATA	2	6	25310	25315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017640	AAT	2	6	25328	25333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017640	TGA	2	6	25516	25521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017640	TCA	2	6	25618	25623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017640	ATC	2	6	30917	30922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017640	TCC	2	6	30936	30941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017640	CTG	3	9	30989	30997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017640	GAT	2	6	31006	31011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017640	ACT	2	6	31047	31052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017640	TCT	2	6	31095	31100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017640	CTT	2	6	31163	31168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017640	TCT	2	6	31265	31270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017640	AAC	2	6	31276	31281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017640	GAC	2	6	31317	31322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017640	CCA	2	6	31796	31801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017640	TCA	2	6	31831	31836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017640	CAG	2	6	31878	31883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017640	GAA	2	6	33118	33123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017640	ATT	2	6	33142	33147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017640	TAA	2	6	33162	33167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017640	TGA	2	6	33359	33364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017640	TAA	2	6	33397	33402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017640	ACC	2	6	33413	33418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017640	CAT	2	6	34212	34217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017640	TAA	2	6	34282	34287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017640	GTT	2	6	37491	37496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017640	GCT	2	6	37526	37531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017640	CAG	2	6	37563	37568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017640	CTG	2	6	37575	37580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017640	CGC	2	6	37602	37607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017640	CAT	2	6	37622	37627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017640	TGT	2	6	37631	37636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017640	TTA	2	6	40303	40308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017640	ATT	2	6	40372	40377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017640	TTA	2	6	40389	40394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017640	AGC	3	9	41625	41633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017640	TCA	2	6	41762	41767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017640	CTC	2	6	44722	44727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017640	GTT	2	6	47035	47040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017640	GGC	2	6	47090	47095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017640	CCA	3	9	47177	47185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017640	GCA	2	6	49728	49733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_017640	GTT	2	6	50200	50205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017640	CCG	2	6	50338	50343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_017640	CGA	2	6	55643	55648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_017640	GTT	2	6	81336	81341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.