MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	GTTAAT	2	12	1666	1677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386611996
2	NC_017639	TTTCGT	2	12	4880	4891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386612000
3	NC_017639	TGACAC	2	12	5822	5833	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612001
4	NC_017639	TACGGT	2	12	6079	6090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386612001
5	NC_017639	CGGTGG	2	12	6965	6976	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386612001
6	NC_017639	ACGGAA	2	12	7971	7982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386612002
7	NC_017639	ATGGGA	2	12	9082	9093	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386612004
8	NC_017639	TTACTG	2	12	9165	9176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386612004
9	NC_017639	AGTGAA	2	12	9379	9390	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386612004
10	NC_017639	TGGCAG	2	12	11746	11757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386612007
11	NC_017639	AGTCAT	2	12	17509	17520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386612015
12	NC_017639	AAAATA	2	12	21080	21091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386612017
13	NC_017639	CGGTAT	2	12	23684	23695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386612019
14	NC_017639	GCCGGA	2	12	26489	26500	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386612021
15	NC_017639	GCTGAT	2	12	29418	29429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386612025
16	NC_017639	GCACCG	2	12	30181	30192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386612026
17	NC_017639	TTTAAT	2	12	34507	34518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386612029
18	NC_017639	TTTACG	2	12	41060	41071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386612038
19	NC_017639	TCCAGC	2	12	45335	45346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386612042
20	NC_017639	ACTCAA	2	12	45579	45590	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386612042
21	NC_017639	TCAGTG	2	12	46842	46853	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386612042
22	NC_017639	GCTTCC	2	12	48011	48022	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386612043
23	NC_017639	TGAAAA	2	12	49161	49172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386612044
24	NC_017639	ACTGCA	2	12	53720	53731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386612050
25	NC_017639	ATCTGA	2	12	53862	53873	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386612050
26	NC_017639	GCGCTG	2	12	57533	57544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386612056
27	NC_017639	GGAAAA	2	12	60356	60367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386612059
28	NC_017639	CACTGG	2	12	64279	64290	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386612062
29	NC_017639	TAATAT	2	12	74524	74535	50 %	50 %	0 %	0 %	386612076

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.