MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_K88

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017639	CCTGT	2	10	1098	1107	0 %	40 %	20 %	40 %	386611995
2	NC_017639	CAGCA	2	10	2636	2645	40 %	0 %	20 %	40 %	386611998
3	NC_017639	TTTTC	2	10	3011	3020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017639	CCTGG	2	10	3045	3054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017639	TGTGC	2	10	3909	3918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017639	GAATG	2	10	6400	6409	40 %	20 %	40 %	0 %	386612001
7	NC_017639	AGACC	2	10	7522	7531	40 %	0 %	20 %	40 %	386612002
8	NC_017639	GCAGA	2	10	8171	8180	40 %	0 %	40 %	20 %	386612002
9	NC_017639	TTTAT	2	10	8940	8949	20 %	80 %	0 %	0 %	386612004
10	NC_017639	TGACC	2	10	9133	9142	20 %	20 %	20 %	40 %	386612004
11	NC_017639	TTTGA	2	10	10189	10198	20 %	60 %	20 %	0 %	386612005
12	NC_017639	TGCAG	2	10	11787	11796	20 %	20 %	40 %	20 %	386612007
13	NC_017639	CTGGC	2	10	11798	11807	0 %	20 %	40 %	40 %	386612007
14	NC_017639	ACACG	2	10	13669	13678	40 %	0 %	20 %	40 %	386612010
15	NC_017639	TTGTT	2	10	14728	14737	0 %	80 %	20 %	0 %	386612010
16	NC_017639	AATAA	2	10	19654	19663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017639	TGTGC	2	10	20104	20113	0 %	40 %	40 %	20 %	386612017
18	NC_017639	TACAA	2	10	20143	20152	60 %	20 %	0 %	20 %	386612017
19	NC_017639	ACCCA	2	10	20396	20405	40 %	0 %	0 %	60 %	386612017
20	NC_017639	CAGGC	2	10	21961	21970	20 %	0 %	40 %	40 %	386612018
21	NC_017639	CCCCG	2	10	22124	22133	0 %	0 %	20 %	80 %	386612018
22	NC_017639	CGTTT	2	10	22778	22787	0 %	60 %	20 %	20 %	386612018
23	NC_017639	TGAAA	2	10	23113	23122	60 %	20 %	20 %	0 %	386612019
24	NC_017639	AAATA	2	10	23866	23875	80 %	20 %	0 %	0 %	386612019
25	NC_017639	GGTAT	2	10	25393	25402	20 %	40 %	40 %	0 %	386612020
26	NC_017639	GAACA	2	10	29907	29916	60 %	0 %	20 %	20 %	386612025
27	NC_017639	AACAA	2	10	33246	33255	80 %	0 %	0 %	20 %	386612029
28	NC_017639	ACATA	2	10	33534	33543	60 %	20 %	0 %	20 %	386612029
29	NC_017639	ATCAT	2	10	33605	33614	40 %	40 %	0 %	20 %	386612029
30	NC_017639	AGAAC	2	10	34192	34201	60 %	0 %	20 %	20 %	386612029
31	NC_017639	ACCTT	2	10	36203	36212	20 %	40 %	0 %	40 %	386612031
32	NC_017639	GCTCT	2	10	38720	38729	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017639	CCATT	2	10	40076	40085	20 %	40 %	0 %	40 %	386612037
34	NC_017639	ACATC	2	10	40244	40253	40 %	20 %	0 %	40 %	386612037
35	NC_017639	ATCGC	2	10	42160	42169	20 %	20 %	20 %	40 %	386612040
36	NC_017639	TGCTG	2	10	45387	45396	0 %	40 %	40 %	20 %	386612042
37	NC_017639	CATTC	2	10	46210	46219	20 %	40 %	0 %	40 %	386612042
38	NC_017639	TCCAC	2	10	46366	46375	20 %	20 %	0 %	60 %	386612042
39	NC_017639	TCCTG	2	10	48702	48711	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017639	CTGCG	2	10	50977	50986	0 %	20 %	40 %	40 %	386612046
41	NC_017639	CAGAC	2	10	51297	51306	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017639	GTCAT	2	10	52913	52922	20 %	40 %	20 %	20 %	386612048
43	NC_017639	CGGCC	2	10	55138	55147	0 %	0 %	40 %	60 %	386612052
44	NC_017639	CTTCC	2	10	59045	59054	0 %	40 %	0 %	60 %	386612057
45	NC_017639	ATGTG	2	10	59152	59161	20 %	40 %	40 %	0 %	386612057
46	NC_017639	TGATG	2	10	59795	59804	20 %	40 %	40 %	0 %	386612058
47	NC_017639	GTTCA	2	10	60866	60875	20 %	40 %	20 %	20 %	386612060
48	NC_017639	CGTAC	2	10	61329	61338	20 %	20 %	20 %	40 %	386612060
49	NC_017639	CCGCC	2	10	63891	63900	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
50	NC_017639	ACTGA	2	10	63939	63948	40 %	20 %	20 %	20 %	386612062
51	NC_017639	CATTC	2	10	64826	64835	20 %	40 %	0 %	40 %	386612063
52	NC_017639	ACTGC	2	10	67405	67414	20 %	20 %	20 %	40 %	386612066
53	NC_017639	GTGAT	2	10	68777	68786	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017639	CGATT	2	10	68823	68832	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017639	GCCCG	2	10	72936	72945	0 %	0 %	40 %	60 %	386612074
56	NC_017639	AAATG	2	10	74373	74382	60 %	20 %	20 %	0 %	386612076
57	NC_017639	TCAGT	2	10	75179	75188	20 %	40 %	20 %	20 %	386612077
58	NC_017639	TACCG	2	10	77150	77159	20 %	20 %	20 %	40 %	386612078
59	NC_017639	GAAGC	2	10	77481	77490	40 %	0 %	40 %	20 %	386612078
60	NC_017639	AGTCC	2	10	78173	78182	20 %	20 %	20 %	40 %	386612079
61	NC_017639	TTTGC	2	10	79245	79254	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017639	TGATC	2	10	79287	79296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017639	TCATT	2	10	81067	81076	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.